26 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
YPK_0358  CDS  NC_010465  383945  384064  120  hypothetical protein  YP_001719121  unclonable  3.72042e-13  n/a    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria 
 
 
-
 
YPK_0841  CDS  NC_010465  962262  962969  708  deoxyribonuclease I  YP_001719595  unclonable  2.39428e-11  n/a    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria 
 
 
-
 
YPK_1168  CDS  NC_010465  1306472  1307422  951  urea amidolyase related protein  YP_001719919  unclonable  1.70574e-10  n/a    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria 
 
 
-
 
YPK_1301  CDS  NC_010465  1430339  1431718  1380  exodeoxyribonuclease VII large subunit  YP_001720052  unclonable  1.14365e-09  n/a    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria 
 
 
-
 
YPK_1437  CDS  NC_010465  1586063  1587478  1416  glutamyl-tRNA synthetase  YP_001720183  unclonable  8.38412e-10  n/a    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria 
 
 
-
 
YPK_1677  CDS  NC_010465  1861843  1865493  3651  ribonuclease E  YP_001720423  unclonable  0.000377607  n/a    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria 
 
 
-
 
YPK_1686  CDS  NC_010465  1872294  1873028  735  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  YP_001720432  unclonable  2.34633e-11  n/a    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria 
 
 
-
 
YPK_1854  CDS  NC_010465  2059668  2059904  237  LPP repeat-containing protein  YP_001720598  unclonable  7.96453e-13  n/a    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria 
 
 
-
 
YPK_1873  CDS  NC_010465  2078508  2080145  1638  putative cell division protein  YP_001720617  unclonable  4.30233e-09  n/a    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria 
 
 
-
 
YPK_1874  CDS  NC_010465  2080193  2080558  366  hypothetical protein  YP_001720618  unclonable  1.60461e-12  n/a    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria 
 
 
-
 
YPK_1875  CDS  NC_010465  2080690  2081586  897  aldo/keto reductase  YP_001720619  unclonable  5.12322e-11  n/a    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria 
 
 
-
 
YPK_2469  CDS  NC_010465  2702505  2704811  2307  TonB-dependent siderophore receptor  YP_001721199  unclonable  2.79609e-07  n/a    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria 
 
 
-
 
YPK_2629  CDS  NC_010465  2884883  2885389  507  SOS cell division inhibitor  YP_001721359  unclonable  3.71858e-12  n/a    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria 
 
 
-
 
YPK_2630  CDS  NC_010465  2885747  2886808  1062  outer membrane protein A  YP_001721360  unclonable  8.8038e-11  n/a    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria 
 
 
-
 
YPK_3024  CDS  NC_010465  3326771  3327973  1203  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase fraction A  YP_001721750  unclonable  2.98829e-10  n/a    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria 
 
 
-
 
YPK_3486  CDS  NC_010465  3827773  3828132  360  hypothetical protein  YP_001722206  unclonable  1.45157e-12  n/a    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria 
 
 
-
 
YPK_3805  CDS  NC_010465  4193591  4194730  1140  iron-sulfur cluster binding protein  YP_001722525  unclonable  1.82984e-10  n/a    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria 
 
 
-
 
YPK_3807  CDS  NC_010465  4195435  4195833  399  hypothetical protein  YP_001722526  unclonable  4.87235e-12  n/a    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria 
 
 
-
 
YPK_3929  CDS  NC_010465  4334105  4334638  534  protoporphyrinogen oxidase  YP_001722645  unclonable  3.39774e-12  n/a    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria 
 
 
-
 
YPK_4072  CDS  NC_010465  4495923  4496786  864  glutamate racemase  YP_001722784  unclonable  3.83263e-11  n/a    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria 
 
 
-
 
YPK_R0028  tRNA  NC_010465  3302900  3302976  77  tRNA-Met    unclonable  1.67131e-13  n/a    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria 
 
 
-
 
YPK_R0048  tRNA  NC_010465  4195352  4195427  76  tRNA-Gly    unclonable  5.07488e-13  n/a    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria 
 
 
-
 
YPK_R0049  tRNA  NC_010465  4195185  4195260  76  tRNA-Gly    unclonable  5.55538e-13  n/a    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria 
 
 
-
 
YPK_R0050  tRNA  NC_010465  4195042  4195117  76  tRNA-Gly    unclonable  5.44411e-13  n/a    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria 
 
 
-
 
YPK_R0054  tRNA  NC_010465  3698153  3698245  93  tRNA-Ser    unclonable  3.79646e-13  n/a    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria 
 
 
-
 
YPK_R0090  rRNA  NC_010465  4332089  4333623  1535  16S ribosomal RNA    unclonable  1.90898e-09  n/a    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>