16 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Hoch_0576  CDS  NC_013440  775214  777499  2286  hypothetical protein  YP_003265107  unclonable  2.28174e-05  normal  0.476347  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_1000  CDS  NC_013440  1280958  1285220  4263  hypothetical protein  YP_003265493  unclonable  0.00761303  normal  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_1055  CDS  NC_013440  1352867  1354867  2001  hypothetical protein  YP_003265540  unclonable  1.121e-05  normal  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_1273  CDS  NC_013440  1679060  1679443  384  hypothetical protein  YP_003265726  hitchhiker  0.00123545  unclonable  1.4967e-09  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_1274  CDS  NC_013440  1679447  1681051  1605  hypothetical protein  YP_003265727  decreased coverage  4.55544e-05  unclonable  2.67355e-09  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_1508  CDS  NC_013440  2047252  2048211  960  serine/threonine protein kinase  YP_003265953  unclonable  4.84572e-07  decreased coverage  4.95585e-07  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_1687  CDS  NC_013440  2296404  2298029  1626  hypothetical protein  YP_003266130  unclonable  2.65405e-06  unclonable  4.5435e-09  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_1688  CDS  NC_013440  2298508  2299350  843  hypothetical protein  YP_003266131  hitchhiker  0.00800751  unclonable  3.20129e-09  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_2570  CDS  NC_013440  3549418  3552264  2847  hypothetical protein  YP_003266997  unclonable  8.05341e-05  decreased coverage  1.45037e-07  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_3134  CDS  NC_013440  4310176  4311711  1536  hypothetical protein  YP_003267529  unclonable  4.64771e-06  normal  0.438059  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_3135  CDS  NC_013440  4311862  4312950  1089  hypothetical protein  YP_003267530  unclonable  9.37816e-07  normal  0.410686  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_3762  CDS  NC_013440  5168740  5172318  3579  serine/threonine protein kinase  YP_003268155  unclonable  0.00167797  normal  0.557916  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_4015  CDS  NC_013440  5509790  5513956  4167  DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit  YP_003268407  unclonable  0.00534047  normal  0.454006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_4381  CDS  NC_013440  6006645  6009164  2520  hypothetical protein  YP_003268768  unclonable  5.56116e-05  normal  0.325935  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_6125  CDS  NC_013440  8381283  8384921  3639  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  YP_003270493  unclonable  0.000714594  normal  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_6539  CDS  NC_013440  8972717  8974717  2001  hypothetical protein  YP_003270901  unclonable  7.89727e-06  normal  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>