184 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
GWCH70_0018  CDS  NC_012793  26534  27016  483  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  YP_002948226  unclonable  2.22669e-12  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0019  CDS  NC_012793  27453  29138  1686  DNA polymerase III subunits gamma and tau  YP_002948227  unclonable  1.59056e-09  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0020  CDS  NC_012793  29161  29487  327  hypothetical protein  YP_002948228  unclonable  2.61671e-12  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0021  CDS  NC_012793  29499  30095  597  recombination protein RecR  YP_002948229  unclonable  7.3919e-12  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0022  CDS  NC_012793  30113  30337  225  conserved hypothetical cytosolic protein  YP_002948230  unclonable  1.57824e-12  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0023  CDS  NC_012793  30415  30681  267  pro-sigmaK processing inhibitor BofA  YP_002948231  unclonable  2.09525e-12  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0058  CDS  NC_012793  68292  68690  399  hypothetical protein  YP_002948266  unclonable  2.38948e-12  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0065  CDS  NC_012793  77888  78664  777  pantothenate kinase  YP_002948273  unclonable  1.07258e-11  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0066  CDS  NC_012793  78679  79566  888  Hsp33-like chaperonin  YP_002948274  unclonable  1.94487e-11  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0067  CDS  NC_012793  79644  80570  927  cysteine synthase A  YP_002948275  unclonable  2.00639e-11  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0094  CDS  NC_012793  119822  120472  651  RNA polymerase factor sigma-70  YP_002948300  unclonable  1.96498e-11  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0095  CDS  NC_012793  120562  120711  150  ribosomal protein L33  YP_002948301  unclonable  2.18198e-12  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0096  CDS  NC_012793  120754  120936  183  preprotein translocase subunit SecE  YP_002948302  unclonable  1.78196e-12  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0097  CDS  NC_012793  121065  121598  534  transcription antitermination protein NusG  YP_002948303  unclonable  9.31665e-12  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0098  CDS  NC_012793  121846  122271  426  50S ribosomal protein L11  YP_002948304  unclonable  4.46948e-12  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0099  CDS  NC_012793  122380  123081  702  50S ribosomal protein L1  YP_002948305  unclonable  1.32548e-11  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0100  CDS  NC_012793  123327  123827  501  50S ribosomal protein L10  YP_002948306  unclonable  6.89021e-12  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0104  CDS  NC_012793  128869  132468  3600  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  YP_002948310  unclonable  4.39156e-06  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0105  CDS  NC_012793  132601  132849  249  putative ribosomal protein L7Ae-like  YP_002948311  unclonable  1.54657e-12  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0106  CDS  NC_012793  132954  133376  423  30S ribosomal protein S12  YP_002948312  unclonable  4.99342e-12  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0107  CDS  NC_012793  133414  133884  471  30S ribosomal protein S7  YP_002948313  unclonable  4.42376e-12  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0108  CDS  NC_012793  134042  136120  2079  elongation factor G  YP_002948314  unclonable  9.24117e-09  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0109  CDS  NC_012793  136265  137452  1188  elongation factor Tu  YP_002948315  unclonable  2.45051e-10  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0110  CDS  NC_012793  137748  138056  309  30S ribosomal protein S10  YP_002948316  unclonable  4.37851e-12  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0111  CDS  NC_012793  138077  138712  636  50S ribosomal protein L3  YP_002948317  unclonable  1.51121e-11  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0112  CDS  NC_012793  138742  139365  624  50S ribosomal protein L4  YP_002948318  unclonable  1.23482e-11  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0113  CDS  NC_012793  139365  139652  288  50S ribosomal protein L23  YP_002948319  unclonable  2.41418e-12  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0114  CDS  NC_012793  139679  140509  831  50S ribosomal protein L2  YP_002948320  unclonable  2.90971e-11  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0134  CDS  NC_012793  149761  149979  219  translation initiation factor IF-1  YP_002948340  unclonable  1.06677e-12  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0135  CDS  NC_012793  150012  150125  114  50S ribosomal protein L36  YP_002948341  unclonable  5.44663e-13  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0136  CDS  NC_012793  150146  150511  366  30S ribosomal protein S13  YP_002948342  unclonable  2.07382e-12  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0137  CDS  NC_012793  150537  150926  390  30S ribosomal protein S11  YP_002948343  unclonable  1.97157e-12  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0138  CDS  NC_012793  151101  152045  945  DNA-directed RNA polymerase subunit alpha  YP_002948344  unclonable  3.98199e-11  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0139  CDS  NC_012793  152183  152545  363  50S ribosomal protein L17  YP_002948345  unclonable  3.16871e-12  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0140  CDS  NC_012793  152664  153506  843  cobalt transporter ATP-binding subunit  YP_002948346  unclonable  2.87993e-11  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0141  CDS  NC_012793  153482  154357  876  cobalt transporter ATP-binding subunit  YP_002948347  unclonable  3.52159e-11  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0142  CDS  NC_012793  154347  155144  798  cobalt transport protein  YP_002948348  unclonable  2.26284e-11  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0143  CDS  NC_012793  155158  155904  747  tRNA pseudouridine synthase A  YP_002948349  unclonable  1.60558e-11  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0144  CDS  NC_012793  156050  156487  438  50S ribosomal protein L13  YP_002948350  unclonable  5.14694e-12  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0229  CDS  NC_012793  253353  254087  735  Abortive infection protein  YP_002948426  unclonable  1.54218e-11  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0285  CDS  NC_012793  323528  324109  582  hypothetical protein  YP_002948478  unclonable  7.69793e-12  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0286  CDS  NC_012793  324303  324593  291  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit C  YP_002948479  unclonable  2.01197e-12  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0314  CDS  NC_012793  362930  364243  1314  CRISPR-associated protein, TM1812 family  YP_002948507  unclonable  2.12664e-10  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0352  CDS  NC_012793  400643  401923  1281  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  YP_002948543  unclonable  1.29716e-10  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0468  CDS  NC_012793  520936  522036  1101  A/G-specific adenine glycosylase  YP_002948645  unclonable  7.36881e-11  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0476  CDS  NC_012793  528318  529691  1374  transposase IS4 family protein  YP_002948653  unclonable  2.19205e-10  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0477  CDS  NC_012793  529914  530939  1026  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  YP_002948654  unclonable  8.93655e-11  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0508  CDS  NC_012793  577639  579012  1374  transposase IS4 family protein  YP_002948684  unclonable  1.6026e-10  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0539  CDS  NC_012793  608836  610272  1437  transposase  YP_002948709  unclonable  5.12999e-10  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0602  CDS  NC_012793  668987  669517  531  metal-dependent hydrolase  YP_002948765  unclonable  3.84041e-12  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0603  CDS  NC_012793  669655  670830  1176  major facilitator superfamily MFS_1  YP_002948766  unclonable  6.45746e-11  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0604  CDS  NC_012793  670893  672077  1185  protein of unknown function Met10  YP_002948767  unclonable  4.82493e-11  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0629  CDS  NC_012793  692233  692586  354  hypothetical protein  YP_002948788  unclonable  1.67631e-12  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0632  CDS  NC_012793  695429  696511  1083  transposase, IS605 OrfB family  YP_002948791  unclonable  7.67619e-11  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0633  CDS  NC_012793  696832  697017  186  hypothetical protein  YP_002948792  unclonable  1.12178e-12  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0634  CDS  NC_012793  697160  698059  900  ABC transporter related  YP_002948793  unclonable  3.558e-11  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0635  CDS  NC_012793  698052  699290  1239  ABC transporter (permease) (Na+ exclusion)  YP_002948794  unclonable  1.53887e-10  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0636  CDS  NC_012793  699380  700354  975  3'-5' exoribonuclease YhaM  YP_002948795  unclonable  5.3339e-11  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0637  CDS  NC_012793  700548  700733  186  hypothetical protein  YP_002948796  unclonable  1.22845e-12  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0638  CDS  NC_012793  700842  701924  1083  phosphoserine aminotransferase  YP_002948797  unclonable  7.07375e-11  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0654  CDS  NC_012793  717471  717608  138  hypothetical protein  YP_002948813  unclonable  9.83935e-13  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0655  CDS  NC_012793  717758  718492  735  beta-lactamase domain protein  YP_002948814  unclonable  1.22219e-11  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0694  CDS  NC_012793  762660  764096  1437  transposase  YP_002948853  unclonable  2.08331e-10  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0711  CDS  NC_012793  788078  788569  492  putative nucleotide-binding protein  YP_002948866  unclonable  3.20146e-12  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0728  CDS  NC_012793  803700  804980  1281  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  YP_002948880  unclonable  2.10486e-10  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0729  CDS  NC_012793  805378  806400  1023  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  YP_002948881  unclonable  4.1068e-11  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0730  CDS  NC_012793  806451  807161  711  protein of unknown function DUF542 ScdA domain protein  YP_002948882  unclonable  1.23482e-11  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0848  CDS  NC_012793  912744  913559  816  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  YP_002948994  unclonable  1.96498e-11  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0849  CDS  NC_012793  913660  914832  1173  transaminase  YP_002948995  unclonable  1.1377e-10  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0866    NC_012793  932066  932446  381      unclonable  2.78087e-12  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0867    NC_012793  932455  932892  438      unclonable  3.9191e-12  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0961  CDS  NC_012793  1017656  1017958  303  hypothetical protein  YP_002949089  unclonable  1.04536e-12  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0962  CDS  NC_012793  1018094  1018219  126  uncharacterized conserved protein, contains two CXXC motifs  YP_002949090  unclonable  4.87521e-13  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_0963  CDS  NC_012793  1018368  1019840  1473  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  YP_002949091  unclonable  2.04147e-10  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_1027  CDS  NC_012793  1077812  1079086  1275  cell division protein FtsA  YP_002949153  unclonable  1.84559e-10  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_1028  CDS  NC_012793  1079112  1080245  1134  cell division protein FtsZ  YP_002949154  unclonable  8.23516e-11  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_1029  CDS  NC_012793  1080644  1081570  927  sigma-E processing peptidase SpoIIGA  YP_002949155  unclonable  2.60513e-11  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_1030  CDS  NC_012793  1081622  1082341  720  sporulation sigma factor SigE  YP_002949156  unclonable  1.29886e-11  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_1031  CDS  NC_012793  1082461  1083240  780  sporulation sigma factor SigG  YP_002949157  unclonable  1.74079e-11  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_1041  CDS  NC_012793  1091023  1091937  915  pseudouridine synthase, RluA family  YP_002949167  unclonable  8.66742e-11  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_1056  CDS  NC_012793  1110798  1111673  876  hypothetical protein  YP_002949182  unclonable  1.65495e-11  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_1087  CDS  NC_012793  1141530  1142870  1341  signal recognition particle protein  YP_002949213  unclonable  2.40128e-10  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_1088  CDS  NC_012793  1142965  1143237  273  30S ribosomal protein S16  YP_002949214  unclonable  1.932e-12  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_1089  CDS  NC_012793  1143237  1143488  252  nucleic acid binding protein  YP_002949215  unclonable  1.85572e-12  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_1090  CDS  NC_012793  1143541  1143927  387  hypothetical protein  YP_002949216  unclonable  3.54215e-12  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_1091  CDS  NC_012793  1143942  1144460  519  16S rRNA-processing protein RimM  YP_002949217  unclonable  6.55231e-12  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_1092  CDS  NC_012793  1144457  1145194  738  tRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  YP_002949218  unclonable  1.36624e-11  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_1093  CDS  NC_012793  1145329  1145679  351  ribosomal protein L19  YP_002949219  unclonable  4.84447e-12  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_1141  CDS  NC_012793  1187414  1188121  708  30S ribosomal protein S2  YP_002949267  unclonable  1.68885e-11  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_1174  CDS  NC_012793  1222957  1225257  2301  cell divisionFtsK/SpoIIIE  YP_002949300  unclonable  1.51723e-08  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_1192  CDS  NC_012793  1244716  1245510  795  metallophosphoesterase  YP_002949318  unclonable  3.74794e-11  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_1235  CDS  NC_012793  1288838  1290172  1335  glutamine synthetase, type I  YP_002949354  unclonable  1.6519e-10  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_1236  CDS  NC_012793  1290226  1290849  624  LexA repressor  YP_002949355  unclonable  6.35507e-12  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_1237  CDS  NC_012793  1291002  1291307  306  cell division suppressor protein YneA  YP_002949356  unclonable  2.53866e-12  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_1238  CDS  NC_012793  1291326  1291979  654  Resolvase domain protein  YP_002949357  unclonable  1.00955e-11  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_1239  CDS  NC_012793  1292186  1292416  231  protein of unknown function DUF896  YP_002949358  unclonable  1.74569e-12  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_1240  CDS  NC_012793  1292587  1293834  1248  transposase, IS605 OrfB family  YP_002949359  unclonable  2.74025e-10  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_1241  CDS  NC_012793  1293983  1295989  2007  transketolase  YP_002949360  unclonable  5.46415e-09  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_1242  CDS  NC_012793  1296146  1296583  438  hypothetical protein  YP_002949361  unclonable  3.26705e-12  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
GWCH70_1243  CDS  NC_012793  1296671  1296883  213  protein of unknown function UPF0154  YP_002949362  unclonable  1.14476e-12  n/a    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>