141 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
ECD_00027  CDS  CP001509  24887  25150  264  30S ribosomal protein S20  ACT41929  unclonable  4.13778e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00028  CDS  CP001509  25253  25471  219  hypothetical protein  ACT41930  unclonable  4.13778e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00029  CDS  CP001509  25479  26420  942  putative regulator  ACT41931  unclonable  1.73781e-06  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00058  CDS  CP001509  58951  61305  2355  organic solvent tolerance protein precursor  ACT41959  unclonable  1.14767e-05  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00059  CDS  CP001509  61560  62375  816  Dna-J like membrane chaperone protein  ACT41960  unclonable  4.86823e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00176  CDS  CP001509  203325  203810  486  periplasmic chaperone  ACT42077  unclonable  2.32591e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00177  CDS  CP001509  203814  204839  1026  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase  ACT42078  unclonable  6.14586e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00178  CDS  CP001509  204944  205399  456  (3R)-hydroxymyristoyl ACP dehydratase  ACT42079  unclonable  2.81915e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00298  CDS  CP001509  332766  335840  3075  beta-D-galactosidase  ACT42197  unclonable  2.6518e-05  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00383  CDS  CP001509  418345  419292  948  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  ACT42282  unclonable  6.8734e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00384  CDS  CP001509  419754  421229  1476  muropeptide transporter  ACT42283  unclonable  2.02049e-06  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00385  CDS  CP001509  421273  421851  579  predicted lipoprotein  ACT42284  unclonable  4.6254e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00386  CDS  CP001509  422156  422473  318  regulator of penicillin binding proteins and beta lactamase transcription (morphogene)  ACT42285  unclonable  3.27919e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00550  CDS  CP001509  570740  572980  2241  iron-enterobactin outer membrane transporter  ACT42429  unclonable  1.04738e-05  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00631  CDS  CP001509  657387  659051  1665  asparagine synthetase B  ACT42507  unclonable  2.78776e-06  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00644  CDS  CP001509  672861  673406  546  regulatory protein for replication initiation  ACT42520  unclonable  3.70073e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00702  CDS  CP001509  738259  739050  792  hypothetical protein  ACT42577  unclonable  4.22433e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00745  CDS  CP001509  796263  796940  678  dethiobiotin synthetase  ACT42646  unclonable  4.76961e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00950  CDS  CP001509  1011041  1011583  543  hypothetical protein  ACT42845  unclonable  4.81867e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00955  CDS  CP001509  1018348  1019988  1641  paraquat-inducible protein B  ACT42850  unclonable  2.62354e-06  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00956  CDS  CP001509  1020000  1020548  549  hypothetical protein  ACT42851  unclonable  2.76204e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00957  CDS  CP001509  1020804  1020971  168  ribosome modulation factor  ACT42852  unclonable  1.13718e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00958  CDS  CP001509  1021041  1021559  519  3-hydroxydecanoyl-ACP dehydratase  ACT42853  unclonable  2.42251e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00959  CDS  CP001509  1021628  1023388  1761  predicted peptidase  ACT42854  unclonable  2.59682e-06  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00960  CDS  CP001509  1023574  1024026  453  hypothetical protein  ACT42855  unclonable  1.90076e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_00961  CDS  CP001509  1024102  1025142  1041  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  ACT42856  unclonable  5.0212e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_01084  CDS  CP001509  1149361  1149882  522  hypothetical protein  ACT42979  unclonable  2.18944e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_01085  CDS  CP001509  1149934  1150107  174  50S ribosomal protein L32  ACT42980  unclonable  1.24601e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_01086  CDS  CP001509  1150188  1151258  1071  fatty acid/phospholipid synthesis protein  ACT42981  unclonable  6.39968e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_01087  CDS  CP001509  1151326  1152279  954  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase  ACT42982  unclonable  5.78388e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_01088  CDS  CP001509  1152295  1153224  930  acyl carrier protein S-malonyltransferase  ACT42983  unclonable  7.37698e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_01089  CDS  CP001509  1153237  1153971  735  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  ACT42984  unclonable  4.6254e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_01090  CDS  CP001509  1154182  1154418  237  acyl carrier protein  ACT42985  unclonable  1.66866e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_01159  CDS  CP001509  1219334  1220602  1269  DNA polymerase V subunit UmuC  ACT43051  unclonable  2.2565e-06  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_01160  CDS  CP001509  1220648  1221178  531  disulfide bond formation protein B  ACT43052  unclonable  6.59923e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_01161  CDS  CP001509  1221324  1222865  1542  sodium/proton antiporter  ACT43053  unclonable  3.92786e-06  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_01162  CDS  CP001509  1223086  1223805  720  fatty acid metabolism regulator  ACT43054  unclonable  7.99515e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_01163  CDS  CP001509  1223857  1225389  1533  hypothetical protein  ACT43055  unclonable  4.3482e-06  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_01257  CDS  CP001509  1326928  1328097  1170  hypothetical protein  ACT43145  unclonable  1.60117e-06  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_01499  CDS  CP001509  1577648  1578334  687  predicted DNA-binding transcriptional regulator  ACT43376  unclonable  4.22433e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_01646  CDS  CP001509  1702690  1702926  237  murein lipoprotein  ACT43504  unclonable  2.90635e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_01647  CDS  CP001509  1702990  1703994  1005  hypothetical protein  ACT43505  unclonable  1.43336e-06  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_01877  CDS  CP001509  1937410  1937958  549  phosphatidylglycerophosphate synthetase  ACT43731  unclonable  6.94411e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_01878  CDS  CP001509  1938015  1939781  1767  excinuclease ABC subunit C  ACT43732  unclonable  5.83054e-06  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_01879  CDS  CP001509  1939844  1940353  510  response regulator  ACT43733  unclonable  6.14586e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_01880  CDS  CP001509  1940475  1940750  276  IS1 protein InsA  ACT43734  unclonable  4.13778e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_01881  CDS  CP001509  1940669  1941172  504  IS1 protein InsB  ACT43735  unclonable  6.53204e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_01882  CDS  CP001509  1941174  1941833  660  chaperone protein HchA  ACT43736  unclonable  9.39788e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_01883  CDS  CP001509  1941941  1943299  1359  predicted sensory kinase in two-component regulatory system with YedW  ACT43737  unclonable  2.73191e-06  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_01884  CDS  CP001509  1943299  1943970  672  predicted DNA-binding response regulator in two-component system with YedV  ACT43738  unclonable  5.33293e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_01885  CDS  CP001509  1944103  1944516  414  hypothetical protein  ACT43739  unclonable  3.11781e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_01886  CDS  CP001509  1944625  1945629  1005  hypothetical protein  ACT43740  unclonable  1.17188e-06  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02224  CDS  CP001509  2305887  2306429  543  predicted NUDIX hydrolase  ACT44046  unclonable  2.12424e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02306  CDS  CP001509  2395794  2397209  1416  glutamyl-tRNA synthetase  ACT44127  unclonable  1.63468e-06  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02307  CDS  CP001509  2397985  2398326  342  conserved hypothetical protein  ACT44128  unclonable  2.54731e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02308  CDS  CP001509  2398317  2399243  927  predicted DNA-binding transcriptional regulator  ACT44129  unclonable  8.41101e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02309  CDS  CP001509  2399333  2400331  999  predicted inner membrane protein  ACT44130  unclonable  8.32535e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02310  CDS  CP001509  2400328  2400546  219  hypothetical protein  ACT44131  unclonable  1.90076e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02311  CDS  CP001509  2400548  2402563  2016  NAD-dependent DNA ligase LigA  ACT44132  unclonable  5.71235e-06  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02312  CDS  CP001509  2402634  2403620  987  cell division protein ZipA  ACT44133  unclonable  9.11583e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02313  CDS  CP001509  2403850  2404611  762  putative sulfate transport protein CysZ  ACT44134  unclonable  6.59923e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02314  CDS  CP001509  2404796  2405767  972  cysteine synthase A, O-acetylserine sulfhydrolase A subunit  ACT44135  unclonable  1.13698e-06  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02315  CDS  CP001509  2406151  2406408  258  phosphohistidinoprotein-hexose phosphotransferase component of PTS system (Hpr)  ACT44136  unclonable  2.54731e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02316  CDS  CP001509  2406453  2408180  1728  PEP-protein phosphotransferase of PTS system (enzyme I)  ACT44137  unclonable  5.89054e-06  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02401  CDS  CP001509  2498712  2500082  1371  exodeoxyribonuclease VII large subunit  ACT44221  unclonable  1.49221e-06  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02482  CDS  CP001509  2598115  2600688  2574  protein disaggregation chaperone  ACT44301  unclonable  3.28184e-05  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02621  CDS  CP001509  2736170  2737018  849  conserved hypothetical protein  ACT44438  unclonable  6.59923e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02622  CDS  CP001509  2737336  2738007  672  hypothetical protein  ACT44439  unclonable  4.86823e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02629  CDS  CP001509  2744006  2746240  2235  (p)ppGpp synthetase I/GTP pyrophosphokinase  ACT44446  unclonable  8.29976e-06  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02740  CDS  CP001509  2884373  2885698  1326  proline aminopeptidase P II  ACT44557  unclonable  9.20962e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02741  CDS  CP001509  2885724  2886302  579  hypothetical protein  ACT44558  unclonable  2.79044e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02742  CDS  CP001509  2886470  2886799  330  cytokinetic ring-localizing protein  ACT44559  unclonable  1.49347e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02797  CDS  CP001509  2941476  2942360  885  integrase  ACT44614  unclonable  5.96142e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02798  CDS  CP001509  2942440  2943342  903  conserved hypothetical protein  ACT44615  unclonable  6.46552e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02811  CDS  CP001509  2943807  2944376  570  conserved hypothetical protein  ACT44616  unclonable  3.31292e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02812  CDS  CP001509  2944614  2944907  294  conserved hypothetical protein  ACT44617  unclonable  1.94006e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02813  CDS  CP001509  2945481  2945636  156  hypothetical protein  ACT44618  unclonable  2.04e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02814  CDS  CP001509  2945664  2946683  1020  conserved hypothetical protein  ACT44619  unclonable  9.39788e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02815  CDS  CP001509  2946767  2947903  1137  Capsule polysaccharide export inner-membrane protein kpsE  ACT44620  unclonable  1.39035e-06  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02816  CDS  CP001509  2947927  2949603  1677  KpsD protein  ACT44621  unclonable  4.3482e-06  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02817  CDS  CP001509  2949613  2950353  741  KpsU protein  ACT44622  unclonable  7.15728e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02818  CDS  CP001509  2950350  2952377  2028  Capsule polysaccharide export protein KpsC  ACT44623  unclonable  8.1315e-06  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02819  CDS  CP001509  2952412  2953644  1233  KpsS protein  ACT44624  unclonable  1.40465e-06  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02820  CDS  CP001509  2953898  2954830  933  hypothetical protein  ACT44625  unclonable  8.07741e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02821  CDS  CP001509  2954892  2956031  1140  hypothetical protein  ACT44626  unclonable  1.36217e-06  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02822  CDS  CP001509  2956605  2957069  465  bifunctional Ribulose 5-phosphate reductase/CDP-ribitol pyrophosphorylase  ACT44627  unclonable  3.70073e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02823  CDS  CP001509  2957307  2957810  504  IS1 protein InsB  ACT44628  unclonable  3.74053e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02824  CDS  CP001509  2957729  2958004  276  IS1 protein InsA  ACT44629  unclonable  2.23419e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02825  CDS  CP001509  2958033  2958755  723  Pyrophosphorylase  ACT44630  unclonable  5.96142e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02826  CDS  CP001509  2958773  2960149  1377  hypothetical protein  ACT44631  unclonable  1.63468e-06  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02827  CDS  CP001509  2960358  2961017  660  Polysialic acid transport ATP-binding KpsT  ACT44632  unclonable  4.22433e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02828  CDS  CP001509  2961032  2961808  777  Polysialic acid transport protein kpsM  ACT44633  unclonable  4.86823e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02829  CDS  CP001509  2962869  2963405  537  predicted secretion pathway M-type protein, membrane anchored  ACT44634  unclonable  3.4154e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02830    CP001509  2963407  2964267  861      unclonable  5.72498e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02831  CDS  CP001509  2964582  2965517  936  hypothetical type II secretion protein GspK  ACT44635  unclonable  9.02301e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02832  CDS  CP001509  2965556  2966119  564  hypothetical type II secretion protein GspJ  ACT44636  unclonable  5.3878e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02833  CDS  CP001509  2966158  2966529  372  hypothetical type II secretion protein  ACT44637  unclonable  3.11781e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02834  CDS  CP001509  2966526  2967089  564  GspH, hypothetical type II secretion protein  ACT44638  unclonable  4.72105e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02835  CDS  CP001509  2967093  2967548  456  hypothetical type II secretion protein GspG  ACT44639  unclonable  3.70073e-07  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
ECD_02836  CDS  CP001509  2967565  2968788  1224  hypothetical type II secretion protein GspF  ACT44640  unclonable  1.56909e-06  n/a    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>