91 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Nther_0103  CDS  NC_010718  119649  120980  1332  potassium uptake protein, TrkH family  YP_001916290  unclonable  2.78363e-12  decreased coverage  8.77762e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0177  CDS  NC_010718  200993  202195  1203  elongation factor Tu  YP_001916364  unclonable  2.29884e-12  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0178  CDS  NC_010718  202343  202492  150  LSU ribosomal protein L33P  YP_001916365  unclonable  8.16698e-15  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0179  CDS  NC_010718  202598  202789  192  preprotein translocase, SecE subunit  YP_001916366  unclonable  1.11498e-14  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0180  CDS  NC_010718  202834  203358  525  transcription antitermination protein nusG  YP_001916367  unclonable  7.27534e-14  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0181  CDS  NC_010718  203434  203859  426  LSU ribosomal protein L11P  YP_001916368  unclonable  4.49736e-14  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0182  CDS  NC_010718  203988  204689  702  LSU ribosomal protein L1P  YP_001916369  unclonable  2.40107e-13  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0484  CDS  NC_010718  513992  514717  726  cell wall hydrolase SleB  YP_001916668  unclonable  2.26048e-13  normal  0.576315  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0500  CDS  NC_010718  527786  528265  480  GTP cyclohydrolase subunit MoaC  YP_001916684  unclonable  4.63741e-14  hitchhiker  4.29916e-05  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0501  CDS  NC_010718  528343  528849  507  cation antiporter  YP_001916685  unclonable  4.54407e-14  hitchhiker  4.10106e-05  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0502  CDS  NC_010718  528839  529102  264  multiple resistance and pH regulation protein F  YP_001916686  unclonable  1.19623e-14  hitchhiker  6.53225e-05  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0503  CDS  NC_010718  529116  529448  333  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  YP_001916687  unclonable  1.66612e-14  hitchhiker  0.000137225  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0504  CDS  NC_010718  529445  529690  246  putative multicomponent Na+:H+ antiporter subunit B  YP_001916688  unclonable  9.12266e-15  hitchhiker  0.000130632  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0505  CDS  NC_010718  529687  529968  282  hypothetical protein  YP_001916689  unclonable  1.23307e-14  hitchhiker  6.53225e-05  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0506  CDS  NC_010718  529973  530425  453  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  YP_001916690  unclonable  2.94811e-14  hitchhiker  3.57823e-05  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0600  CDS  NC_010718  624022  625776  1755  choline/carnitine/betaine transporter  YP_001916783  unclonable  8.57259e-11  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0736  CDS  NC_010718  763142  764545  1404  Na+/H+ antiporter NhaC  YP_001916914  unclonable  1.32088e-11  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0802  CDS  NC_010718  837181  838020  840  hypothetical protein  YP_001916976  unclonable  2.0853e-13  hitchhiker  0.00290712  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0824  CDS  NC_010718  861591  861857  267  Stage V sporulation protein S  YP_001916997  unclonable  3.26249e-14  decreased coverage  1.65948e-07  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0862  CDS  NC_010718  908405  909772  1368  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  YP_001917035  unclonable  9.67478e-12  normal  0.747959  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0889  CDS  NC_010718  936537  937490  954  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  YP_001917062  unclonable  8.69689e-13  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0919  CDS  NC_010718  974426  975010  585  hypothetical protein  YP_001917092  unclonable  2.70991e-13  unclonable  1.59322e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0920  CDS  NC_010718  975174  976394  1221  hypothetical protein  YP_001917093  unclonable  6.09095e-12  unclonable  4.61706e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0964  CDS  NC_010718  1023929  1024294  366  transcriptional regulator, PadR-like family  YP_001917136  unclonable  3.10235e-14  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_0991  CDS  NC_010718  1054987  1056414  1428  MATE efflux family protein  YP_001917163  unclonable  1.56724e-11  normal  0.091152  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_1090  CDS  NC_010718  1151722  1152600  879  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  YP_001917262  unclonable  8.18491e-13  decreased coverage  0.00172118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_1091  CDS  NC_010718  1152776  1153687  912  cysteine synthase  YP_001917263  unclonable  8.26995e-13  decreased coverage  0.00308217  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_1170  CDS  NC_010718  1238076  1240313  2238  D-Lysine 56-aminomutase alpha subunit  YP_001917341  unclonable  1.01599e-09  decreased coverage  6.23397e-05  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_1215  CDS  NC_010718  1288374  1289456  1083  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD family  YP_001917386  unclonable  2.56701e-12  hitchhiker  0.00656648  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_1378  CDS  NC_010718  1447665  1448774  1110  protein of unknown function DUF939  YP_001917549  unclonable  1.80772e-12  normal  0.221416  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_1513  CDS  NC_010718  1587740  1588606  867  putative orphan protein  YP_001917682  unclonable  1.02093e-12  hitchhiker  9.01712e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_1582  CDS  NC_010718  1663379  1664344  966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  YP_001917745  hitchhiker  4.91095e-10  unclonable  4.61706e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_1583  CDS  NC_010718  1664361  1665227  867  UDP-glucose pyrophosphorylase  YP_001917746  unclonable  1.05274e-12  unclonable  3.59337e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_1584  CDS  NC_010718  1665329  1665532  204  cold-shock DNA-binding protein family  YP_001917747  unclonable  2.97873e-14  unclonable  9.08249e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_1585  CDS  NC_010718  1666073  1666297  225  small acid-soluble spore protein alpha/beta type  YP_001917748  unclonable  3.50021e-14  unclonable  8.28702e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_1586  CDS  NC_010718  1666369  1666530  162  hypothetical protein  YP_001917749  unclonable  3.07046e-14  unclonable  7.41642e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_1587  CDS  NC_010718  1666754  1666954  201  cold-shock DNA-binding protein family  YP_001917750  hitchhiker  1.2511e-12  unclonable  7.72165e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_1588  CDS  NC_010718  1667048  1667464  417  hypothetical protein  YP_001917751  hitchhiker  6.49074e-11  unclonable  1.1325e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_1589  CDS  NC_010718  1667489  1667677  189  hypothetical protein  YP_001917752  hitchhiker  9.5176e-09  unclonable  8.46284e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_1590  CDS  NC_010718  1667722  1668099  378  hypothetical protein  YP_001917753  hitchhiker  2.18418e-08  unclonable  1.06619e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_1591    NC_010718  1668415  1669278  864      hitchhiker  5.13635e-06  unclonable  2.52799e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_1592  CDS  NC_010718  1669290  1669556  267  transposase IS3/IS911 family protein  YP_001917754  hitchhiker  2.00325e-05  unclonable  8.37308e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_1593  CDS  NC_010718  1669701  1670027  327  hypothetical protein  YP_001917755  hitchhiker  6.97441e-05  unclonable  7.95944e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_1594  CDS  NC_010718  1670331  1670702  372  hypothetical protein  YP_001917756  hitchhiker  0.000171671  unclonable  8.37308e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_1595  CDS  NC_010718  1670873  1671655  783  hypothetical protein  YP_001917757  normal  0.010794  unclonable  1.49995e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_1596  CDS  NC_010718  1671840  1673558  1719  extracellular solute-binding protein family 5  YP_001917758  normal  0.0368881  unclonable  7.93881e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_1597  CDS  NC_010718  1673842  1674504  663  deoxyribose-phosphate aldolase  YP_001917759  normal  0.464616  unclonable  1.48452e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_1598  CDS  NC_010718  1674525  1675304  780  stationary-phase survival protein SurE  YP_001917760  normal  0.520429  unclonable  1.79755e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_1599  CDS  NC_010718  1675337  1676641  1305  Atrazine chlorohydrolase  YP_001917761  normal  0.748458  unclonable  4.43454e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_1600  CDS  NC_010718  1676714  1677559  846  hydrolase of metallo-beta-lactamase fold  YP_001917762  normal  0.949503  unclonable  2.1744e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_1601  CDS  NC_010718  1677674  1678741  1068  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  YP_001917763  normal  0.799203  unclonable  3.52104e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_1602  CDS  NC_010718  1678926  1679081  156  hypothetical protein  YP_001917764  normal  0.982132  unclonable  7.05239e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_1603  CDS  NC_010718  1679118  1680740  1623  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  YP_001917765  normal  0.541041  unclonable  7.03874e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_1604  CDS  NC_010718  1681349  1682131  783  MCP methyltransferase, CheR-type  YP_001917766  normal  0.0143514  unclonable  1.76137e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_1605  CDS  NC_010718  1682177  1682596  420  nucleoside diphosphate kinase  YP_001917767  hitchhiker  0.00669649  unclonable  1.19096e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_1606  CDS  NC_010718  1682743  1684278  1536  phytoene desaturase  YP_001917768  hitchhiker  0.000200105  unclonable  6.43078e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_1607  CDS  NC_010718  1684367  1685758  1392  MATE efflux family protein  YP_001917769  hitchhiker  1.42965e-07  unclonable  4.95515e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_1608  CDS  NC_010718  1686102  1686965  864  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  YP_001917770  unclonable  2.64698e-12  unclonable  2.65848e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_1609  CDS  NC_010718  1687272  1688075  804  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  YP_001917771  hitchhiker  7.69297e-10  unclonable  2.30963e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_1610  CDS  NC_010718  1688144  1689415  1272  hypothetical protein  YP_001917772  hitchhiker  6.40568e-09  unclonable  5.93437e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_1611  CDS  NC_010718  1689557  1691038  1482  GerA spore germination protein  YP_001917773  hitchhiker  5.99872e-09  unclonable  8.60289e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_1612  CDS  NC_010718  1691240  1691848  609  hypothetical protein  YP_001917774  hitchhiker  6.99953e-11  unclonable  2.71309e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_1613  CDS  NC_010718  1692015  1692782  768  SurA domain  YP_001917775  unclonable  2.47502e-13  unclonable  3.15321e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_1614  CDS  NC_010718  1692944  1693942  999  phosphotransacetylase  YP_001917776  unclonable  5.37063e-13  hitchhiker  9.00938e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_1853  CDS  NC_010718  1934317  1935702  1386  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  YP_001918013  unclonable  7.44962e-12  normal  0.0199441  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_1870  CDS  NC_010718  1955874  1956515  642  hypothetical protein  YP_001918030  unclonable  9.25185e-14  normal  0.109413  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_1871  CDS  NC_010718  1956671  1959271  2601  heavy metal translocating P-type ATPase  YP_001918031  unclonable  7.34074e-09  normal  0.315442  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_1872  CDS  NC_010718  1959517  1960587  1071  putative enzyme of poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)  YP_001918032  unclonable  8.02014e-13  normal  0.278856  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_1873  CDS  NC_010718  1960584  1961330  747  protein of unknown function DUF368  YP_001918033  unclonable  1.5734e-13  normal  0.185008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_2009  CDS  NC_010718  2117728  2118090  363  FMN-binding domain protein  YP_001918164  unclonable  3.9478e-14  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_2046  CDS  NC_010718  2161483  2162667  1185  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  YP_001918201  unclonable  6.15426e-12  decreased coverage  4.30181e-11  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_2064  CDS  NC_010718  2182063  2183169  1107  polysaccharide deacetylase  YP_001918219  unclonable  2.8992e-12  hitchhiker  0.000502846  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_2177  CDS  NC_010718  2301528  2303615  2088  hypothetical protein  YP_001918331  unclonable  3.33089e-10  decreased coverage  1.74533e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_2196  CDS  NC_010718  2331848  2332534  687  cell division ATP-binding protein FtsE  YP_001918350  unclonable  2.06385e-13  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_2224  CDS  NC_010718  2361572  2363074  1503  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  YP_001918378  unclonable  1.78543e-11  decreased coverage  1.10821e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_2394  CDS  NC_010718  2558751  2559185  435  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_001918547  unclonable  1.99537e-14  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_2395  CDS  NC_010718  2559247  2560119  873  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  YP_001918548  unclonable  3.06055e-13  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_2400  CDS  NC_010718  2564309  2565628  1320  sodium:dicarboxylate symporter  YP_001918553  unclonable  6.28072e-12  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_2656  CDS  NC_010718  2860096  2861340  1245  anion transporter  YP_001918799  unclonable  5.61885e-12  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_2869  CDS  NC_010718  3101016  3101720  705  hypothetical protein  YP_001919004  unclonable  2.19294e-13  hitchhiker  6.66906e-13  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_2870  CDS  NC_010718  3101713  3102534  822  sporulation sigma factor SigG  YP_001919005  unclonable  5.15832e-13  hitchhiker  1.71975e-11  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_2871  CDS  NC_010718  3102812  3103777  966  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  YP_001919006  unclonable  1.02093e-12  hitchhiker  9.56396e-11  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_R0008  tRNA  NC_010718  24426  24521  96  tRNA-Ser    unclonable  1.3912e-14  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_R0009  tRNA  NC_010718  24544  24621  78  tRNA-Arg    unclonable  1.33621e-14  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_R0039  tRNA  NC_010718  1289620  1289694  75  tRNA-Asn    unclonable  9.2174e-15  hitchhiker  0.00180785  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_R0049  tRNA  NC_010718  1680853  1680929  77  tRNA-Asp    normal  0.0598225  unclonable  6.70621e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_R0050  tRNA  NC_010718  1680934  1681010  77  tRNA-Thr    normal  0.0595881  unclonable  6.50586e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_R0051  tRNA  NC_010718  1681032  1681119  88  tRNA-Tyr    normal  0.0589159  unclonable  6.439e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_R0052  tRNA  NC_010718  1681190  1681264  75  tRNA-Gln    normal  0.0374404  unclonable  6.37282e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_R0053  tRNA  NC_010718  1687117  1687193  77  tRNA-Pro    hitchhiker  1.94568e-11  unclonable  8.89969e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Nther_R0075  tRNA  NC_010718  2117560  2117635  76  tRNA-Ala    unclonable  8.58856e-15  normal  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>