49 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
SeAg_B0048  CDS  NC_011149  52277  52540  264  30S ribosomal protein S20  YP_002145024  unclonable  1.61385e-14  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0482  CDS  NC_011149  478735  479664  930  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  YP_002145424  unclonable  1.91941e-12  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0510  CDS  NC_011149  507897  508157  261  50S ribosomal protein L31 type B  YP_002145450  unclonable  5.10204e-14  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0725  CDS  NC_011149  714171  714854  684  integrase, catalytic region  YP_002145650  unclonable  4.4412e-13  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0741  CDS  NC_011149  733928  734557  630  flavodoxin FldA  YP_002145666  unclonable  4.1401e-13  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0742  CDS  NC_011149  734609  734902  294  LexA regulated protein  YP_002145667  unclonable  8.25535e-14  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0743  CDS  NC_011149  735036  735806  771  hypothetical protein  YP_002145668  unclonable  7.86446e-13  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0744  CDS  NC_011149  735991  736533  543  replication initiation regulator SeqA  YP_002145669  unclonable  2.88551e-13  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0787  tRNA  NC_011149  782719  782796  78  tRNA-Lys    unclonable  1.14753e-14  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0788  tRNA  NC_011149  782932  783007  76  tRNA-Val    unclonable  1.0379e-14  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B0789  tRNA  NC_011149  783011  783086  76  tRNA-Lys    unclonable  9.38184e-15  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B1028  CDS  NC_011149  1030515  1031630  1116  outer membrane protein A  YP_002145940  unclonable  2.86695e-12  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B1134  ncRNA  NC_011149  1136548  1136631  84  DsrA RNA    unclonable  3.35092e-14  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B1175  CDS  NC_011149  1168239  1168787  549  phosphatidylglycerophosphate synthetase  YP_002146078  unclonable  1.44583e-13  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B1176  tRNA  NC_011149  1168939  1169014  76  tRNA-Gly    unclonable  1.20685e-14  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B1177  tRNA  NC_011149  1169067  1169140  74  tRNA-Cys    unclonable  9.57331e-15  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B1178  tRNA  NC_011149  1169152  1169238  87  tRNA-Leu    unclonable  1.00662e-14  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B1179  CDS  NC_011149  1169315  1169443  129  hypothetical protein  YP_002146079  unclonable  1.30763e-14  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B1316  CDS  NC_011149  1285487  1286614  1128  ribonuclease D  YP_002146207  unclonable  1.19147e-11  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B1332  CDS  NC_011149  1299093  1300826  1734  potassium/proton antiporter  YP_002146223  unclonable  6.12144e-11  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B1441  CDS  NC_011149  1400325  1401494  1170  tetratricopeptide repeat protein  YP_002146321  unclonable  1.53911e-12  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B1576  CDS  NC_011149  1539712  1541205  1494  L-asparagine permease  YP_002146451  unclonable  2.85451e-11  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B1793  CDS  NC_011149  1754644  1756056  1413  pyruvate kinase  YP_002146661  unclonable  2.63395e-11  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B1794  CDS  NC_011149  1756367  1756603  237  major outer membrane lipoprotein  YP_002146662  unclonable  7.10111e-14  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B1841  CDS  NC_011149  1804042  1804896  855  DNA/RNA non-specific endonuclease  YP_002146705  unclonable  3.6697e-13  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B1990  CDS  NC_011149  1933780  1934016  237  acyl carrier protein  YP_002146847  unclonable  2.74294e-14  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B1991  CDS  NC_011149  1934172  1934906  735  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  YP_002146848  unclonable  3.78223e-13  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B1996  CDS  NC_011149  1938335  1938856  522  hypothetical protein  YP_002146853  unclonable  8.50849e-14  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B2066  CDS  NC_011149  1995376  1996173  798  hypothetical protein  YP_002146917  unclonable  6.83564e-13  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B2067  tRNA  NC_011149  1996273  1996350  78  tRNA-Asn    unclonable  2.48141e-14  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B2115  tRNA  NC_011149  2038000  2038077  78  tRNA-Asn    unclonable  3.35092e-14  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B2116    NC_011149  2038217  2039743  1527      unclonable  3.25483e-11  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B2469  CDS  NC_011149  2401806  2402744  939  HTH-type transcriptional regulator PecT  YP_002147288  unclonable  1.82505e-12  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B2572  CDS  NC_011149  2502442  2503428  987  cell division protein ZipA  YP_002147381  unclonable  2.3932e-12  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B2661  CDS  NC_011149  2593563  2594912  1350  exodeoxyribonuclease VII large subunit  YP_002147465  unclonable  1.5005e-11  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B2778  CDS  NC_011149  2722121  2723593  1473  hypothetical protein  YP_002147569  unclonable  1.24034e-11  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B3084  CDS  NC_011149  3006330  3007001  672  radical SAM domain protein  YP_002147853  unclonable  2.55818e-13  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B3097  CDS  NC_011149  3020308  3022542  2235  GDP/GTP pyrophosphokinase  YP_002147866  unclonable  4.0075e-10  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B3151  CDS  NC_011149  3079597  3080127  531  dinucleoside polyphosphate hydrolase  YP_002147913  unclonable  2.1359e-13  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B3485  CDS  NC_011149  3381899  3383842  1944  ATP-dependent metalloprotease  YP_002148220  unclonable  1.63816e-10  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B3495  CDS  NC_011149  3390415  3391527  1113  octaprenyl diphosphate synthase  YP_002148230  unclonable  5.67296e-12  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B3686  CDS  NC_011149  3558862  3559383  522  shikimate kinase I  YP_002148408  unclonable  2.8278e-13  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B4382  CDS  NC_011149  4277337  4278287  951  pantothenate kinase  YP_002149055  unclonable  6.69891e-13  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B4383  tRNA  NC_011149  4278688  4278765  78  tRNA-Thr    unclonable  1.02716e-14  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B4384  tRNA  NC_011149  4278773  4278857  85  tRNA-Tyr    unclonable  1.1593e-14  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B4385  CDS  NC_011149  4278872  4278988  117  hypothetical protein  YP_002149056  unclonable  1.33432e-14  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B4386  tRNA  NC_011149  4278974  4279048  75  tRNA-Gly    unclonable  1.13588e-14  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B4387  tRNA  NC_011149  4279054  4279131  78  tRNA-Thr    unclonable  1.02716e-14  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
SeAg_B4388  CDS  NC_011149  4279246  4280430  1185  elongation factor Tu  YP_002149057  unclonable  3.6113e-12  n/a    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>