14 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Snas_2944  CDS  NC_013947  3099309  3102626  3318  DNA polymerase III subunit alpha  YP_003511712  unclonable  0.000126736  decreased coverage  1.11947e-05  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_2945  CDS  NC_013947  3102619  3104136  1518  Nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  YP_003511713  unclonable  5.98538e-07  decreased coverage  4.34939e-06  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_2946  CDS  NC_013947  3104137  3104826  690  hypothetical protein  YP_003511714  unclonable  4.05982e-08  decreased coverage  2.58322e-06  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_3196  CDS  NC_013947  3375600  3377402  1803  extracellular solute-binding protein family 5  YP_003511959  hitchhiker  1.71923e-05  unclonable  4.13572e-11  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_3197  CDS  NC_013947  3377399  3378385  987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_003511960  unclonable  6.43204e-08  unclonable  2.362e-11  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_3198  CDS  NC_013947  3378463  3379245  783  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_003511961  unclonable  2.83157e-08  unclonable  2.0531e-11  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_3199  CDS  NC_013947  3379249  3380208  960  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  YP_003511962  hitchhiker  1.23373e-05  unclonable  1.85716e-11  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_3200  CDS  NC_013947  3380205  3381170  966  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  YP_003511963  hitchhiker  0.000978488  unclonable  1.99212e-11  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_3201  CDS  NC_013947  3381461  3381757  297  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  YP_003511964  normal  0.0130262  unclonable  1.17168e-11  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_3202  CDS  NC_013947  3381792  3382784  993  transcriptional regulator, AraC family  YP_003511965  normal  0.125903  unclonable  1.6632e-11  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_3203  CDS  NC_013947  3382898  3384115  1218  major facilitator superfamily MFS_1  YP_003511966  normal  0.455292  unclonable  1.8384e-11  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_3204  CDS  NC_013947  3384176  3384838  663  hypothetical protein  YP_003511967  normal  0.20809  unclonable  1.40296e-11  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_3612  CDS  NC_013947  3842813  3843175  363  hypothetical protein  YP_003512365  unclonable  1.12826e-08  normal  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Snas_6005  CDS  NC_013947  6356181  6357086  906  hypothetical protein  YP_003514724  unclonable  2.94758e-08  normal  0.0811231  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>