24 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Amir_0839  CDS  NC_013093  923501  923893  393  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  YP_003098646  unclonable  1.21321e-09  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0840  CDS  NC_013093  923932  925077  1146  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  YP_003098647  unclonable  1.57223e-08  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0841  CDS  NC_013093  925074  925832  759  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  YP_003098648  unclonable  6.19723e-09  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0842  CDS  NC_013093  925944  926273  330  hypothetical protein  YP_003098649  unclonable  1.57366e-09  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_2245  CDS  NC_013093  2482116  2484986  2871  transcriptional regulator, LuxR family  YP_003100031  unclonable  4.25814e-06  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_2298  CDS  NC_013093  2555558  2556727  1170  ROK family protein  YP_003100084  unclonable  1.66992e-08  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_2380  CDS  NC_013093  2640465  2642477  2013  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  YP_003100166  unclonable  1.86709e-07  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_2413  CDS  NC_013093  2670845  2671405  561  hypothetical protein  YP_003100199  unclonable  2.08245e-09  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_2510  CDS  NC_013093  2816234  2821168  4935  hypothetical protein  YP_003100294  unclonable  0.00514736  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_3453  CDS  NC_013093  4016788  4018710  1923  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  YP_003101196  unclonable  2.52279e-07  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_3864  CDS  NC_013093  4529109  4530809  1701  protein of unknown function DUF181  YP_003101589  unclonable  1.34117e-07  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_3865  CDS  NC_013093  4530818  4531948  1131  hypothetical protein  YP_003101590  unclonable  2.12347e-08  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_3866  CDS  NC_013093  4531948  4533504  1557  hypothetical protein  YP_003101591  unclonable  7.13597e-08  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_3867  CDS  NC_013093  4533480  4534139  660  putative transcriptional regulator, TetR family  YP_003101592  unclonable  3.71985e-09  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_3868  CDS  NC_013093  4534228  4535076  849  putative esterase  YP_003101593  unclonable  5.71996e-09  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_3869  CDS  NC_013093  4535465  4536478  1014  hypothetical protein  YP_003101594  unclonable  8.20088e-09  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_4166  CDS  NC_013093  4900890  4901810  921  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  YP_003101867  unclonable  1.09629e-08  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_4167  CDS  NC_013093  4902799  4903947  1149  hypothetical protein  YP_003101868  unclonable  2.67335e-08  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_4911  CDS  NC_013093  5849711  5854111  4401  Beta-ketoacyl synthase  YP_003102583  unclonable  0.000703058  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_4950  CDS  NC_013093  5903864  5904598  735  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  YP_003102622  unclonable  1.01187e-08  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_5500  CDS  NC_013093  6530198  6531400  1203  helix-turn-helix domain protein  YP_003103164  unclonable  1.65306e-08  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_5501  CDS  NC_013093  6532862  6533632  771  protein of unknown function DUF540  YP_003103165  unclonable  3.95042e-09  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_5780  CDS  NC_013093  6817206  6818273  1068  hypothetical protein  YP_003103439  unclonable  1.90201e-08  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_5781  CDS  NC_013093  6818311  6819327  1017  hypothetical protein  YP_003103440  unclonable  1.16441e-08  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>