85 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Emin_0074  CDS  NC_010644  79027  79851  825  hypothetical protein  YP_001874978  hitchhiker  1.9401e-06  unclonable  2.56434e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0075  CDS  NC_010644  79856  80881  1026  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl) glucosamine N-acyltransferase  YP_001874979  hitchhiker  3.67072e-08  unclonable  3.11276e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0076  CDS  NC_010644  80897  81730  834  UDP-3-0-acyl N-acetylglucosamine deacetylase  YP_001874980  unclonable  8.94961e-10  unclonable  1.57778e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0077  CDS  NC_010644  81723  82199  477  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  YP_001874981  unclonable  3.5396e-10  unclonable  1.10697e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0078  CDS  NC_010644  82276  83079  804  acyl-(acyl-carrier-protein)--UDP-N- acetylglucosamine O-acyltransferase  YP_001874982  hitchhiker  2.06474e-08  unclonable  1.71134e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0120  CDS  NC_010644  126683  128029  1347  outer membrane efflux protein  YP_001875023  unclonable  1.65447e-09  hitchhiker  5.61163e-13  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0212  CDS  NC_010644  224825  228328  3504  DNA polymerase III, alpha subunit  YP_001875111  unclonable  2.2067e-06  normal  0.693797  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0306  CDS  NC_010644  328400  329047  648  two component LuxR family transcriptional regulator  YP_001875203  unclonable  1.61342e-10  hitchhiker  1.59266e-06  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0348  CDS  NC_010644  373493  373849  357  ribosomal protein L20  YP_001875244  unclonable  2.03448e-10  normal  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0376  CDS  NC_010644  400872  401396  525  hypothetical protein  YP_001875270  unclonable  2.72235e-10  hitchhiker  7.82624e-11  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0377  CDS  NC_010644  401621  403636  2016  sulfatase  YP_001875271  unclonable  2.64889e-08  hitchhiker  1.48489e-14  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0378  CDS  NC_010644  403637  404194  558  LemA family protein  YP_001875272  unclonable  4.07408e-10  decreased coverage  1.42653e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0392  CDS  NC_010644  419219  419746  528  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  YP_001875286  unclonable  3.36485e-10  hitchhiker  7.27713e-08  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0499  CDS  NC_010644  547015  548508  1494  transcription termination factor Rho  YP_001875392  unclonable  6.19502e-09  normal  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0500  CDS  NC_010644  548684  549748  1065  hypothetical protein  YP_001875393  unclonable  1.37929e-09  normal  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0501  CDS  NC_010644  549751  550656  906  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol kinase  YP_001875394  unclonable  7.6215e-10  normal  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0502  CDS  NC_010644  550643  550939  297  SpoVG family protein  YP_001875395  unclonable  1.8214e-10  normal  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0594  CDS  NC_010644  646294  650355  4062  hypothetical protein  YP_001875486  unclonable  9.64512e-06  unclonable  1.84208e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0644  CDS  NC_010644  711520  712623  1104  hypothetical protein  YP_001875536  unclonable  2.39983e-09  normal  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0685  CDS  NC_010644  759565  760089  525  hypothetical protein  YP_001875577  unclonable  1.48844e-10  hitchhiker  7.94287e-15  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0686  CDS  NC_010644  760086  760886  801  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  YP_001875578  unclonable  5.62829e-10  hitchhiker  2.64678e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0687  CDS  NC_010644  760876  761967  1092  1-hydroxy-2-methyl-2-(E)-butenyl 4-diphosphate synthase  YP_001875579  unclonable  1.12855e-09  hitchhiker  3.25567e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0688  CDS  NC_010644  762049  762285  237  hypothetical protein  YP_001875580  unclonable  1.14623e-10  hitchhiker  1.05106e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0689  CDS  NC_010644  762301  763431  1131  peptidase M50  YP_001875581  unclonable  1.48024e-09  hitchhiker  3.25567e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0690  CDS  NC_010644  763444  764631  1188  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase  YP_001875582  unclonable  2.32742e-09  unclonable  6.50055e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0691  CDS  NC_010644  764628  765443  816  phosphatidate cytidylyltransferase  YP_001875583  unclonable  1.1055e-09  unclonable  2.72637e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0692  CDS  NC_010644  765625  767271  1647  hypothetical protein  YP_001875584  unclonable  1.40435e-08  unclonable  7.26108e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0693  CDS  NC_010644  767528  768781  1254  diaminopimelate decarboxylase  YP_001875585  normal  0.0357164  unclonable  3.07983e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0694  CDS  NC_010644  769050  769601  552  nitroreductase  YP_001875586  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0695  CDS  NC_010644  769977  770447  471  hypothetical protein  YP_001875587  normal  unclonable  1.08436e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0747  CDS  NC_010644  821835  822089  255  SWIB/MDM2 domain-containing protein  YP_001875639  unclonable  1.04692e-10  hitchhiker  1.99042e-11  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0748  CDS  NC_010644  822180  823784  1605  phosphoenolpyruvate carboxykinase  YP_001875640  unclonable  4.35432e-09  hitchhiker  1.04521e-10  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0762  CDS  NC_010644  839813  840304  492  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  YP_001875654  unclonable  6.89185e-10  hitchhiker  1.05745e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0763  CDS  NC_010644  840366  840935  570  OmpA/MotB domain-containing protein  YP_001875655  unclonable  6.7511e-10  unclonable  1.30394e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0764  CDS  NC_010644  841018  842172  1155  hypothetical protein  YP_001875656  unclonable  3.48546e-09  hitchhiker  3.45564e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0765  CDS  NC_010644  842214  842726  513  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  YP_001875657  unclonable  4.73938e-10  hitchhiker  1.49827e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0766  CDS  NC_010644  842778  843365  588  endopeptidase Clp  YP_001875658  unclonable  4.55068e-10  hitchhiker  1.46896e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0767  CDS  NC_010644  843772  845565  1794  hypothetical protein  YP_001875659  unclonable  1.33413e-08  hitchhiker  9.29658e-14  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0793  CDS  NC_010644  868732  869235  504  Ferritin Dps family protein  YP_001875685  unclonable  4.8868e-10  normal  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0814  CDS  NC_010644  895166  897514  2349  hypothetical protein  YP_001875706  unclonable  3.61392e-08  hitchhiker  8.76173e-13  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0815  CDS  NC_010644  897720  898250  531  hypothetical protein  YP_001875707  unclonable  3.32927e-10  hitchhiker  9.70181e-14  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0855  CDS  NC_010644  944726  945418  693  HNH endonuclease  YP_001875747  unclonable  1.64704e-10  hitchhiker  5.78298e-10  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0856  CDS  NC_010644  945551  946387  837  hypothetical protein  YP_001875748  unclonable  2.5622e-10  hitchhiker  6.17137e-10  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0878  CDS  NC_010644  966685  967110  426  flavodoxin  YP_001875770  unclonable  1.47271e-10  hitchhiker  4.57533e-10  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0879  CDS  NC_010644  967212  968990  1779  ABC transporter related  YP_001875771  unclonable  7.88557e-09  decreased coverage  3.12557e-10  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0880  CDS  NC_010644  968987  970726  1740  ABC transporter related  YP_001875772  unclonable  1.05658e-08  decreased coverage  3.23108e-10  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0911  CDS  NC_010644  1009802  1010482  681  cyclic nucleotide-binding protein  YP_001875803  unclonable  6.10478e-10  hitchhiker  3.86547e-15  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0912  CDS  NC_010644  1010556  1011266  711  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  YP_001875804  unclonable  5.19227e-10  hitchhiker  4.16733e-15  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0917  CDS  NC_010644  1016293  1017465  1173  aminotransferase class I and II  YP_001875807  hitchhiker  3.88923e-08  unclonable  5.8197e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0918  CDS  NC_010644  1017473  1018624  1152  peptidase M20  YP_001875808  hitchhiker  4.00462e-08  unclonable  4.70833e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0919  CDS  NC_010644  1018634  1019203  570  hypothetical protein  YP_001875809  hitchhiker  8.57942e-09  unclonable  2.11793e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0920  CDS  NC_010644  1019312  1020622  1311  amino acid/peptide transporter  YP_001875810  unclonable  3.08736e-09  unclonable  5.10372e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0921  CDS  NC_010644  1020784  1022439  1656  PTS system, glucose-like IIB subunint  YP_001875811  hitchhiker  1.71728e-07  unclonable  9.61967e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0922  CDS  NC_010644  1022491  1023924  1434  amino acid/peptide transporter  YP_001875812  hitchhiker  3.22625e-05  unclonable  8.27442e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0923  CDS  NC_010644  1024075  1024281  207  hypothetical protein  YP_001875813  hitchhiker  0.000140661  unclonable  1.69325e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0924  CDS  NC_010644  1024431  1026059  1629  chaperonin GroEL  YP_001875814  hitchhiker  0.00446655  unclonable  9.72258e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0931  CDS  NC_010644  1032990  1034198  1209  hypothetical protein  YP_001875821  unclonable  1.57278e-09  hitchhiker  8.51396e-12  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0932  CDS  NC_010644  1034508  1035947  1440  tryptophanase  YP_001875822  unclonable  3.08736e-09  hitchhiker  3.50683e-10  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_0933  CDS  NC_010644  1036165  1037748  1584  hypothetical protein  YP_001875823  unclonable  3.56044e-09  hitchhiker  4.76431e-10  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_1212  CDS  NC_010644  1307336  1308310  975  hypothetical protein  YP_001876099  unclonable  9.0453e-10  decreased coverage  1.89634e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_1333  CDS  NC_010644  1435481  1436857  1377  thiamine biosynthesis protein ThiH  YP_001876220  hitchhiker  0.000230637  unclonable  1.1198e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_1334  CDS  NC_010644  1436895  1437368  474  thioesterase superfamily protein  YP_001876221  hitchhiker  1.51833e-08  unclonable  3.30735e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_1335  CDS  NC_010644  1437433  1438011  579  adenylate cyclase  YP_001876222  unclonable  6.0402e-10  unclonable  3.44452e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_1336  CDS  NC_010644  1438173  1438382  210  hypothetical protein  YP_001876223  unclonable  3.16491e-10  hitchhiker  1.86992e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_1523  CDS  NC_010644  1614958  1615365  408  ATP synthase F1, epsilon subunit  YP_001876407  hitchhiker  2.21531e-06  unclonable  1.83775e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_1524  CDS  NC_010644  1615615  1616094  480  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  YP_001876408  decreased coverage  5.84644e-08  unclonable  2.69753e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_1525  CDS  NC_010644  1616181  1617242  1062  recA protein  YP_001876409  decreased coverage  2.45316e-08  unclonable  4.38442e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_1526  CDS  NC_010644  1617355  1619874  2520  ATPase  YP_001876410  hitchhiker  0.00101266  unclonable  2.18976e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_1527  CDS  NC_010644  1619968  1620414  447  nucleoside-diphosphate kinase  YP_001876411  hitchhiker  0.000566951  unclonable  1.91396e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_1528  CDS  NC_010644  1620418  1621275  858  hypothetical protein  YP_001876412  hitchhiker  0.00143851  unclonable  2.75726e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_1529  CDS  NC_010644  1621275  1622162  888  glucokinase regulatory-like protein  YP_001876413  hitchhiker  0.00174969  unclonable  2.72637e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_1530  CDS  NC_010644  1622194  1623258  1065  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  YP_001876414  hitchhiker  0.00297497  unclonable  3.51633e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_1531  CDS  NC_010644  1623255  1624691  1437  glycoside hydrolase family 3 protein  YP_001876415  hitchhiker  0.000631966  unclonable  5.75811e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_1532  CDS  NC_010644  1624678  1625364  687  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  YP_001876416  hitchhiker  9.19754e-06  unclonable  2.03359e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_1533  CDS  NC_010644  1625645  1626571  927  hypothetical protein  YP_001876417  unclonable  2.25718e-09  unclonable  2.41348e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_1534  CDS  NC_010644  1626867  1628864  1998  excinuclease ABC, B subunit  YP_001876418  hitchhiker  6.0622e-06  unclonable  1.05391e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_1535  CDS  NC_010644  1628861  1629421  561  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  YP_001876419  normal  0.0161043  unclonable  1.21273e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_1536  CDS  NC_010644  1629679  1631709  2031  thimet oligopeptidase  YP_001876420  normal  0.100985  unclonable  4.6585e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_1537  CDS  NC_010644  1631785  1632354  570  arginine decarboxylase, pyruvoyl-dependent  YP_001876421  normal  0.0318772  unclonable  9.14268e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_1538  CDS  NC_010644  1632360  1633229  870  agmatinase  YP_001876422  normal  0.04187  unclonable  1.26381e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_1539  CDS  NC_010644  1633335  1633970  636  hypothetical protein  YP_001876423  normal  0.0267091  unclonable  1.26381e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_1540  CDS  NC_010644  1634231  1634860  630  hypothetical protein  YP_001876424  normal  0.0151027  unclonable  1.25045e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_1541  CDS  NC_010644  1636045  1636173  129  hypothetical protein  YP_001876425  hitchhiker  2.79009e-05  unclonable  6.76459e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_1542  CDS  NC_010644  1636266  1637150  885  parB-like partition protein  YP_001876426  decreased coverage  1.60995e-08  unclonable  1.80022e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Emin_R0046  tRNA  NC_010644  1625464  1625535  72  tRNA-Val    hitchhiker  5.14041e-08  unclonable  8.86692e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>