54 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
GM21_0075  CDS  NC_012918  97978  98535  558  hypothetical protein  YP_003019920  n/a    unclonable  7.95667e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0076  CDS  NC_012918  98532  100382  1851  Radical SAM domain protein  YP_003019921  n/a    unclonable  1.37421e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0077  CDS  NC_012918  100819  102669  1851  hypothetical protein  YP_003019922  n/a    unclonable  1.09082e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0190  CDS  NC_012918  226378  227112  735  pentapeptide repeat protein  YP_003020033  n/a    unclonable  3.37345e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0191  CDS  NC_012918  227195  227395  201  cold-shock DNA-binding domain protein  YP_003020034  n/a    unclonable  8.97537e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0192  CDS  NC_012918  227502  231053  3552  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  YP_003020035  n/a    unclonable  2.02232e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0339  CDS  NC_012918  417902  418738  837  diaminopimelate epimerase  YP_003020178  n/a    unclonable  3.69201e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0340  CDS  NC_012918  418872  419081  210  hypothetical protein  YP_003020179  n/a    unclonable  9.72751e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0561  CDS  NC_012918  686899  687489  591  hypothetical protein  YP_003020393  n/a    unclonable  1.01609e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0616  CDS  NC_012918  747631  749574  1944  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  YP_003020448  n/a    unclonable  6.1691e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0617  CDS  NC_012918  749927  750370  444  heat shock protein Hsp20  YP_003020449  n/a    unclonable  2.23773e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0618  CDS  NC_012918  750381  752834  2454  ATP-dependent protease La  YP_003020450  n/a    unclonable  1.26983e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0619  CDS  NC_012918  752831  753802  972  thiamine-monophosphate kinase  YP_003020451  n/a    unclonable  5.18956e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0620  CDS  NC_012918  753813  754211  399  protein of unknown function UPF0047  YP_003020452  n/a    unclonable  1.17685e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0621  CDS  NC_012918  754268  754762  495  TPR repeat-containing protein  YP_003020453  n/a    unclonable  1.20092e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0622  CDS  NC_012918  754954  755442  489  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  YP_003020454  n/a    unclonable  9.8276e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0623  CDS  NC_012918  755452  755688  237  TRASH domain protein  YP_003020455  n/a    unclonable  7.34319e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0624  CDS  NC_012918  755711  756355  645  putative translaldolase  YP_003020456  n/a    unclonable  2.04318e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0625  CDS  NC_012918  756482  757093  612  SNARE associated Golgi protein  YP_003020457  n/a    unclonable  2.21493e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0626  CDS  NC_012918  757275  758921  1647  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  YP_003020458  n/a    unclonable  1.19382e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0627  CDS  NC_012918  758923  760755  1833  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  YP_003020459  n/a    unclonable  1.07944e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0628  CDS  NC_012918  760810  761514  705  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  YP_003020460  n/a    unclonable  8.53561e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0629  CDS  NC_012918  761559  762326  768  PP-loop domain protein  YP_003020461  n/a    unclonable  1.4975e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0630  CDS  NC_012918  762685  763680  996  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  YP_003020462  n/a    unclonable  1.84787e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0631  CDS  NC_012918  763772  764191  420  transcriptional regulator, TraR/DksA family  YP_003020463  n/a    unclonable  4.19152e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0632  CDS  NC_012918  764273  765619  1347  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  YP_003020464  n/a    unclonable  3.30586e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0669  CDS  NC_012918  802950  803732  783  transcriptional regulator, IclR family  YP_003020501  n/a    unclonable  1.45954e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0670  CDS  NC_012918  803773  804396  624  dephospho-CoA kinase  YP_003020502  n/a    unclonable  1.06845e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0924  CDS  NC_012918  1099243  1099719  477  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  YP_003020749  n/a    unclonable  5.73808e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0925  CDS  NC_012918  1099986  1101176  1191  tryptophan synthase subunit beta  YP_003020750  n/a    unclonable  2.74109e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_0926  CDS  NC_012918  1101416  1102105  690  hypothetical protein  YP_003020751  n/a    unclonable  7.084e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_1070  CDS  NC_012918  1254809  1255717  909  NAD-dependent dehydrogenase subunit  YP_003020889  n/a    unclonable  1.36021e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_1071  CDS  NC_012918  1255722  1256363  642  NAD-dependent dehydrogenase subunit  YP_003020890  n/a    unclonable  9.47177e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_1072  CDS  NC_012918  1256368  1257801  1434  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  YP_003020891  n/a    unclonable  3.41725e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_1073  CDS  NC_012918  1257798  1259309  1512  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  YP_003020892  n/a    unclonable  3.15376e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_1074  CDS  NC_012918  1259370  1260128  759  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  YP_003020893  n/a    unclonable  5.56717e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_1075  CDS  NC_012918  1260296  1262785  2490  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  YP_003020894  n/a    unclonable  2.46099e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_1076  CDS  NC_012918  1262840  1263610  771  hypothetical protein  YP_003020895  n/a    unclonable  4.83756e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_1243  CDS  NC_012918  1450559  1451443  885  hypothetical protein  YP_003021062  n/a    unclonable  2.14845e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_1529  CDS  NC_012918  1792492  1794831  2340  DNA topoisomerase I  YP_003021343  n/a    unclonable  6.23259e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_1530  CDS  NC_012918  1795125  1796432  1308  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase Gid  YP_003021344  n/a    unclonable  6.80299e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_1531  CDS  NC_012918  1796472  1796696  225  hypothetical protein  YP_003021345  n/a    unclonable  5.60299e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_1532  CDS  NC_012918  1796708  1797289  582  Maf-like protein  YP_003021346  n/a    unclonable  1.2886e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_1533  CDS  NC_012918  1797299  1797991  693  alanine racemase domain protein  YP_003021347  n/a    unclonable  1.84787e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_1534  CDS  NC_012918  1798052  1798282  231  hypothetical protein  YP_003021348  n/a    unclonable  7.2684e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_1535  CDS  NC_012918  1798293  1798676  384  hypothetical protein  YP_003021349  n/a    unclonable  8.97537e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_1536  CDS  NC_012918  1799022  1800644  1623  ABC transporter related  YP_003021350  n/a    unclonable  1.28069e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_1537  CDS  NC_012918  1800755  1801147  393  hypothetical protein  YP_003021351  n/a    unclonable  1.25022e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_2000  CDS  NC_012918  2318202  2319719  1518  hypothetical protein  YP_003021810  n/a    unclonable  6.94208e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_2001  CDS  NC_012918  2319864  2322254  2391  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  YP_003021811  n/a    unclonable  7.77001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_2082  CDS  NC_012918  2416653  2416988  336  hypothetical protein  YP_003021892  n/a    unclonable  1.07944e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_2558  CDS  NC_012918  2986316  2987371  1056  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  YP_003022357  n/a    unclonable  8.15048e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_2559  CDS  NC_012918  2987438  2987851  414  nucleoside diphosphate kinase  YP_003022358  n/a    unclonable  2.17056e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
GM21_2888  CDS  NC_012918  3357856  3358944  1089  RelA/SpoT domain protein  YP_003022677  n/a    unclonable  3.55841e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>