36 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Aboo_0072  CDS  NC_013926  71186  73390  2205  translation elongation factor aEF-2  YP_003482446  unclonable  1.19399e-10  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0197  CDS  NC_013926  205064  210130  5067  DEAD/H associated domain protein  YP_003482571  unclonable  0.000798352  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0232  CDS  NC_013926  235738  236658  921  hypothetical protein  YP_003482606  unclonable  1.12199e-14  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0233  CDS  NC_013926  236652  237212  561  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  YP_003482607  unclonable  3.9384e-16  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0379  CDS  NC_013926  374390  376207  1818  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  YP_003482752  unclonable  6.19684e-12  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0843  CDS  NC_013926  803443  805899  2457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_003483214  unclonable  3.35755e-10  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0876  CDS  NC_013926  837149  838333  1185  flavodoxin/nitric oxide synthase  YP_003483247  unclonable  3.51493e-14  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0877  CDS  NC_013926  838330  838803  474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  YP_003483248  unclonable  7.75979e-17  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0917  CDS  NC_013926  869518  870867  1350  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  YP_003483288  unclonable  1.45882e-13  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0977  CDS  NC_013926  938192  941509  3318  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  YP_003483348  unclonable  2.8046e-07  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0981  CDS  NC_013926  945559  946380  822  ferredoxin  YP_003483352  unclonable  2.4477e-15  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0982  CDS  NC_013926  946382  948079  1698  L-aspartate oxidase  YP_003483353  unclonable  2.58616e-12  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0986  CDS  NC_013926  951508  952614  1107  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  YP_003483357  unclonable  9.27253e-15  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_0987  CDS  NC_013926  952611  953477  867  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  YP_003483358  unclonable  1.73889e-15  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_1032  CDS  NC_013926  991918  992181  264  plasmid stabilization system  YP_003483403  unclonable  2.45088e-17  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_1033  CDS  NC_013926  992178  992372  195  hypothetical protein  YP_003483404  unclonable  1.62449e-17  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_1054  CDS  NC_013926  1010818  1012002  1185  hypothetical protein  YP_003483425  unclonable  2.40066e-14  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_1060  CDS  NC_013926  1018825  1020042  1218  hypothetical protein  YP_003483431  unclonable  3.0234e-14  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_1061  CDS  NC_013926  1020046  1021008  963  hypothetical protein  YP_003483432  unclonable  3.33938e-15  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_1103  CDS  NC_013926  1058502  1060772  2271  DEAD/DEAH box helicase domain protein  YP_003483474  unclonable  1.46119e-10  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_1104  CDS  NC_013926  1060805  1061995  1191  major facilitator superfamily MFS_1  YP_003483475  unclonable  4.38266e-14  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_1361  CDS  NC_013926  1304161  1304550  390  methylmalonyl-CoA epimerase  YP_003483731  unclonable  2.7651e-17  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_1505  CDS  NC_013926  1448164  1448700  537  ribosomal protein L6P  YP_003483873  unclonable  2.66484e-16  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_1506  CDS  NC_013926  1448711  1449100  390  ribosomal protein S8  YP_003483874  unclonable  1.05998e-16  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_1507  CDS  NC_013926  1449112  1449273  162  ribosomal protein S14  YP_003483875  unclonable  1.59133e-17  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_1508  CDS  NC_013926  1449273  1449809  537  ribosomal protein L5  YP_003483876  unclonable  2.2694e-16  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_1509  CDS  NC_013926  1449806  1450516  711  Ribosomal protein S4E, central domain protein  YP_003483877  unclonable  7.86693e-16  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_1510  CDS  NC_013926  1450509  1450979  471  ribosomal protein L24  YP_003483878  unclonable  1.23231e-16  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_1511  CDS  NC_013926  1450990  1451397  408  50S ribosomal protein L14P  YP_003483879  unclonable  7.30331e-17  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_1512  CDS  NC_013926  1451394  1451723  330  ribosomal protein S17P  YP_003483880  unclonable  2.87974e-17  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_1513  CDS  NC_013926  1451720  1452001  282  Ribonuclease P, Rpp29  YP_003483881  unclonable  2.42497e-17  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_1514  CDS  NC_013926  1451998  1452192  195  ribosomal protein L29  YP_003483882  unclonable  1.42468e-17  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_1515  CDS  NC_013926  1452122  1452835  714  ribosomal protein S3  YP_003483883  unclonable  6.05815e-16  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_1516  CDS  NC_013926  1452838  1453293  456  ribosomal protein L22  YP_003483884  unclonable  9.68145e-17  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_1517  CDS  NC_013926  1453303  1453758  456  ribosomal protein S19  YP_003483885  unclonable  8.41136e-17  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Aboo_1518  CDS  NC_013926  1453764  1454468  705  ribosomal protein L2  YP_003483886  unclonable  6.90355e-16  n/a    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>