53 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CBUD_0210  CDS  NC_009727  194260  195126  867  RNA polymerase factor sigma-32  YP_001423635  unclonable  2.19279e-07  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0423  CDS  NC_009727  405184  407016  1833  aspartyl-tRNA synthetase  YP_001423843  unclonable  9.68757e-06  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0509  CDS  NC_009727  486459  486917  459  hypothetical protein  YP_001423923  unclonable  3.93887e-08  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0515  CDS  NC_009727  493659  494717  1059  rod shape-determining protein MreB  YP_001423929  unclonable  3.44491e-07  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0571  CDS  NC_009727  552827  552940  114  hypothetical protein  YP_001423980  unclonable  6.31982e-09  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0572  CDS  NC_009727  552925  553377  453  17 kDa common-antigen  YP_001423981  unclonable  1.92664e-08  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0623  CDS  NC_009727  605533  607944  2412  outer membrane protein assembly factor  YP_001424030  unclonable  6.61464e-05  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0624  CDS  NC_009727  608022  608519  498  outer membrane protein  YP_001424031  unclonable  2.91301e-08  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0625  CDS  NC_009727  608529  609557  1029  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase  YP_001424032  unclonable  4.21673e-07  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0646  CDS  NC_009727  632015  633505  1491  hypothetical membrane spanning protein  YP_001424052  unclonable  3.05005e-06  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_0991  CDS  NC_009727  974401  975630  1230  aspartokinase  YP_001424371  unclonable  4.71315e-07  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1182  CDS  NC_009727  1154327  1154809  483  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  YP_001424546  unclonable  3.09577e-08  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1183  CDS  NC_009727  1154882  1155220  339  hypothetical protein  YP_001424547  unclonable  2.24129e-08  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1185  CDS  NC_009727  1155402  1156415  1014  tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate transferase  YP_001424549  unclonable  3.51603e-07  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1256  CDS  NC_009727  1236674  1238041  1368  sterol delta-7-reductase  YP_001424615  unclonable  1.27228e-06  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1273  CDS  NC_009727  1256582  1257724  1143  cysteine desulfhydrase  YP_001424628  unclonable  1.90468e-07  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1274  CDS  NC_009727  1257953  1258291  339  glycine-rich RNA-binding protein  YP_001424629  unclonable  8.37257e-09  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1275  CDS  NC_009727  1258362  1259090  729  acyltransferase family protein  YP_001424630  unclonable  3.38877e-08  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1309  CDS  NC_009727  1300061  1301380  1320  RmuC family protein  YP_001424662  unclonable  1.09458e-06  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1310  CDS  NC_009727  1301794  1302702  909  haloalkane dehalogenase  YP_001424663  unclonable  1.7212e-07  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1313  CDS  NC_009727  1308462  1309898  1437  sensor protein  YP_001424666  unclonable  2.54318e-06  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1343  CDS  NC_009727  1339526  1341124  1599  Na+/H+ antiporter  YP_001424696  unclonable  2.20901e-06  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1344  CDS  NC_009727  1341577  1342323  747  OmpA-like transmembrane domain protein  YP_001424697  unclonable  5.32147e-08  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1388  CDS  NC_009727  1386869  1387216  348  hypothetical protein  YP_001424740  unclonable  1.92664e-08  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1414  CDS  NC_009727  1404945  1405454  510  translation initiation factor IF-3  YP_001424762  unclonable  2.8541e-08  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1415  CDS  NC_009727  1405537  1407519  1983  threonyl-tRNA synthetase  YP_001424763  unclonable  9.39714e-06  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1511  CDS  NC_009727  1506886  1507236  351  iojap protein family  YP_001424855  unclonable  2.52813e-08  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1536  CDS  NC_009727  1535969  1536682  714  cytidylate kinase  YP_001424880  unclonable  5.88366e-08  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1618  CDS  NC_009727  1621094  1621498  405  histone H1 homolog  YP_001424956  unclonable  1.81367e-08  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1631  CDS  NC_009727  1630386  1631126  741  tRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  YP_001424969  unclonable  1.08471e-07  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1632  CDS  NC_009727  1631123  1631470  348  50S ribosomal protein L19  YP_001424970  unclonable  1.60789e-08  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1683  CDS  NC_009727  1675570  1675917  348  50S ribosomal protein L21  YP_001425019  unclonable  1.96723e-08  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1742  CDS  NC_009727  1740331  1740642  312  DNA-binding protein fis  YP_001425075  unclonable  8.72165e-09  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1769  CDS  NC_009727  1766982  1767701  720  outer membrane porin P1  YP_001425101  unclonable  9.80639e-08  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1770  CDS  NC_009727  1767676  1767792  117  hypothetical protein  YP_001425102  unclonable  1.00365e-08  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1771  CDS  NC_009727  1767965  1769866  1902  heat shock protein 90  YP_001425103  unclonable  1.71528e-05  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1773  CDS  NC_009727  1769921  1770196  276  hypothetical protein  YP_001425105  unclonable  2.79639e-08  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1774  CDS  NC_009727  1770286  1770981  696  outer membrane protein  YP_001425106  unclonable  1.06277e-07  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1775  CDS  NC_009727  1770981  1771100  120  hypothetical protein  YP_001425107  unclonable  8.4603e-09  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1823  CDS  NC_009727  1813908  1814384  477  single-strand DNA binding protein  YP_001425151  unclonable  5.00943e-08  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1832  CDS  NC_009727  1820797  1821156  360  30S ribosomal protein S13  YP_001425160  unclonable  1.54353e-08  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1832a  CDS  NC_009727  1821161  1821256  96  hypothetical protein  YP_002268369  unclonable  5.06962e-09  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1859  CDS  NC_009727  1836095  1836517  423  30S ribosomal protein S12  YP_001425187  unclonable  2.97311e-08  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1913  CDS  NC_009727  1889333  1889806  474  homing endonuclease, 23S rRNA intron  YP_001425231  unclonable  1.54353e-08  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1915  tRNA  NC_009727  1892892  1892967  76  tRNA-Ala    unclonable  7.64546e-09  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1916  tRNA  NC_009727  1892972  1893048  77  tRNA-Ile    unclonable  8.28574e-09  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1917  rRNA  NC_009727  1893237  1894693  1457  Small Subunit Ribosomal RNA; ssuRNA; 16S ribosomal RNA    unclonable  2.07946e-06  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1965  CDS  NC_009727  1945427  1946338  912  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase  YP_001425275  unclonable  1.62027e-07  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1966  CDS  NC_009727  1946498  1947679  1182  cell division protein FtsZ  YP_001425276  unclonable  3.88917e-07  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_1967  CDS  NC_009727  1947680  1948921  1242  cell division protein  YP_001425277  unclonable  4.43484e-07  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_2058  CDS  NC_009727  2033062  2033817  756  hypothetical protein  YP_001425364  unclonable  6.4405e-08  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_2059  CDS  NC_009727  2033927  2034529  603  putative deoxyribonucleotide triphosphate pyrophosphatase  YP_001425365  unclonable  2.52813e-08  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
CBUD_2184  CDS  NC_009727  2149437  2150693  1257  transcription termination factor Rho  YP_001425486  unclonable  3.92995e-07  n/a    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>