17 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Rpic12D_0207  CDS  NC_012856  218003  220915  2913  UvrD/REP helicase  YP_002980188  unclonable  0.00182272  decreased coverage  5.25372e-08  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_2282  CDS  NC_012856  2413568  2413807  240  transcriptional regulator, XRE family  YP_002982228  hitchhiker  0.000103293  unclonable  3.02962e-11  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_2283  CDS  NC_012856  2413882  2414760  879  putative phage repressor  YP_002982229  hitchhiker  0.00298807  unclonable  4.71179e-11  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_2284  CDS  NC_012856  2415360  2415671  312  hypothetical protein  YP_002982230  hitchhiker  0.00647318  unclonable  4.43578e-11  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_2285  CDS  NC_012856  2415675  2415836  162  hypothetical protein  YP_002982231  hitchhiker  0.00141927  unclonable  3.97085e-11  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_2286  CDS  NC_012856  2415849  2416205  357  hypothetical protein  YP_002982232  hitchhiker  0.000194351  unclonable  4.66406e-11  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_2287  CDS  NC_012856  2416212  2416373  162  hypothetical protein  YP_002982233  hitchhiker  0.0004525  unclonable  4.71179e-11  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_2288  CDS  NC_012856  2416399  2417232  834  pentapeptide repeat protein  YP_002982234  hitchhiker  0.00748476  unclonable  6.82389e-11  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_2289  CDS  NC_012856  2417262  2417459  198  hypothetical protein  YP_002982235  normal  0.0241353  unclonable  4.39085e-11  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_2290  CDS  NC_012856  2417478  2417624  147  hypothetical protein  YP_002982236  normal  0.0203537  unclonable  4.1344e-11  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_2291  CDS  NC_012856  2417628  2417786  159  hypothetical protein  YP_002982237  normal  0.0448463  unclonable  4.09251e-11  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_2292  CDS  NC_012856  2417786  2417977  192  hypothetical protein  YP_002982238  normal  0.0547559  unclonable  3.93062e-11  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_2293  CDS  NC_012856  2417994  2418257  264  hypothetical protein  YP_002982239  normal  0.0567352  unclonable  3.81377e-11  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_2939  CDS  NC_012856  3090650  3090958  309  50S ribosomal protein L24  YP_002982881  unclonable  6.8942e-08  hitchhiker  3.99132e-06  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_2950  CDS  NC_012856  3095714  3096367  654  50S ribosomal protein L3  YP_002982892  unclonable  2.76942e-07  decreased coverage  1.34206e-07  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4021  CDS  NC_012857  596836  597645  810  alpha/beta hydrolase fold protein  YP_002983943  unclonable  1.97083e-07  normal  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4022  CDS  NC_012857  597785  598288  504  thioesterase superfamily protein  YP_002983944  unclonable  8.09189e-08  normal  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>