30 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
MmarC7_0001  CDS  NC_009637  120  2243  2124  hypothetical protein  YP_001329225  normal  0.426286  unclonable  1.68459e-08  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0002  CDS  NC_009637  2225  4108  1884  UvrD/REP helicase  YP_001329226  hitchhiker  0.00501949  unclonable  1.52261e-08  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0003  CDS  NC_009637  4131  5381  1251  hypothetical protein  YP_001329227  hitchhiker  0.00559809  unclonable  1.11615e-08  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0004  CDS  NC_009637  5395  7932  2538  hypothetical protein  YP_001329228  decreased coverage  0.00169415  unclonable  3.10884e-08  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_0005  CDS  NC_009637  8074  10704  2631  hypothetical protein  YP_001329229  normal  0.424895  unclonable  3.47223e-08  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_1355  CDS  NC_009637  1314926  1316779  1854  hypothetical protein  YP_001330569  normal  unclonable  4.93272e-08  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_1356  CDS  NC_009637  1316798  1317553  756  hypothetical protein  YP_001330570  normal  0.964982  unclonable  2.34576e-08  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_1357  CDS  NC_009637  1317566  1317805  240  hypothetical protein  YP_001330571  normal  unclonable  1.65033e-08  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_1358  CDS  NC_009637  1317815  1318360  546  hypothetical protein  YP_001330572  normal  unclonable  1.88149e-08  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_1359  CDS  NC_009637  1318445  1320451  2007  hypothetical protein  YP_001330573  normal  unclonable  4.37253e-08  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_1360  CDS  NC_009637  1320489  1321892  1404  hypothetical protein  YP_001330574  normal  0.117671  unclonable  2.89708e-08  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_1361  CDS  NC_009637  1321983  1323224  1242  polysaccharide biosynthesis protein  YP_001330575  normal  0.483225  unclonable  2.56808e-08  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_1467  CDS  NC_009637  1428463  1429683  1221  periplasmic binding protein  YP_001330679  unclonable  1.2515e-09  normal  0.0723513  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_1792  CDS  NC_009637  1754985  1756178  1194  hypothetical protein  YP_001330997  normal  0.0323827  unclonable  7.01935e-09  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_1793  CDS  NC_009637  1756224  1757060  837  hypothetical protein  YP_001330998  decreased coverage  0.00382966  unclonable  7.01935e-09  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_1794  CDS  NC_009637  1757142  1757618  477  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  YP_001330999  normal  0.109434  unclonable  5.07783e-09  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_1795  CDS  NC_009637  1757673  1759373  1701  sodium/hydrogen exchanger  YP_001331000  normal  0.315073  unclonable  1.10445e-08  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_1796  CDS  NC_009637  1759547  1760893  1347  MATE efflux family protein  YP_001331001  normal  unclonable  9.11844e-09  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_1797    NC_009637  1761137  1761346  210      normal  0.431948  unclonable  4.2345e-09  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_1798  CDS  NC_009637  1761404  1761679  276  hypothetical protein  YP_001331002  normal  0.392965  unclonable  4.8761e-09  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_1799  CDS  NC_009637  1761797  1762126  330  sodium/calcium exchanger membrane region  YP_001331003  normal  0.416854  unclonable  5.28791e-09  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_1800  CDS  NC_009637  1763030  1763320  291  hypothetical protein  YP_001331004  normal  0.0855456  unclonable  5.56204e-09  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_1801  CDS  NC_009637  1763372  1763677  306  hypothetical protein  YP_001331005  normal  0.0311488  unclonable  5.56204e-09  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_1802  CDS  NC_009637  1764719  1765993  1275  hypothetical protein  YP_001331006  normal  0.0194967  unclonable  9.02281e-09  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_1803  CDS  NC_009637  1766005  1767789  1785  parallel beta-helix repeat-containing protein  YP_001331007  normal  0.0567689  unclonable  9.68755e-09  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_1804  CDS  NC_009637  1767925  1768170  246  hypothetical protein  YP_001331008  normal  0.0533644  unclonable  4.58965e-09  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_1805  CDS  NC_009637  1768192  1768932  741  extracellular solute-binding protein  YP_001331009  normal  0.0545186  unclonable  6.60342e-09  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_1806  CDS  NC_009637  1769552  1770313  762  extracellular solute-binding protein  YP_001331010  normal  0.0263139  unclonable  6.6734e-09  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_1807  CDS  NC_009637  1770623  1771228  606  resolvase domain-containing protein  YP_001331011  normal  0.261116  unclonable  6.03181e-09  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
MmarC7_1808  CDS  NC_009637  1771234  1772601  1368  hypothetical protein  YP_001331012  normal  0.138667  unclonable  1.03957e-08  Methanococcus maripaludis C7  Archaea 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>