24 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Hlac_1190  CDS  NC_012029  1195191  1196015  825  transposase IS4 family protein  YP_002565854  unclonable  2.39561e-08  hitchhiker  5.51344e-06  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_1191  CDS  NC_012029  1196302  1197354  1053  periplasmic solute binding protein  YP_002565855  unclonable  4.11642e-08  hitchhiker  6.25153e-06  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_1192  CDS  NC_012029  1197351  1198130  780  ABC transporter related  YP_002565856  unclonable  8.37637e-09  hitchhiker  4.50172e-06  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_1193  CDS  NC_012029  1198127  1199107  981  ABC-3 protein  YP_002565857  unclonable  2.46923e-08  hitchhiker  6.00855e-06  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_1194  CDS  NC_012029  1199112  1201610  2499  hypothetical protein  YP_002565858  unclonable  1.34903e-05  hitchhiker  1.45799e-05  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_1195  CDS  NC_012029  1201722  1203431  1710  hypothetical protein  YP_002565859  unclonable  5.12165e-07  hitchhiker  9.7996e-06  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_1196  CDS  NC_012029  1203592  1204278  687  transcriptional regulator, TetR family  YP_002565860  unclonable  2.147e-09  hitchhiker  6.00855e-06  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_1197  CDS  NC_012029  1204312  1205004  693  metal dependent phosphohydrolase  YP_002565861  unclonable  2.67676e-09  hitchhiker  5.95914e-06  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_1198  CDS  NC_012029  1205156  1206604  1449  hypothetical protein  YP_002565862  unclonable  1.67019e-07  hitchhiker  7.59697e-06  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_1199  CDS  NC_012029  1206743  1207690  948  cation diffusion facilitator family transporter  YP_002565863  unclonable  1.35405e-08  hitchhiker  5.09926e-06  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_1200  CDS  NC_012029  1207776  1208489  714  hypothetical protein  YP_002565864  unclonable  3.95565e-09  hitchhiker  4.39593e-06  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_1201  CDS  NC_012029  1209080  1210387  1308  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  YP_002565865  unclonable  6.45757e-08  hitchhiker  6.00855e-06  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_1202  CDS  NC_012029  1210609  1211028  420  hypothetical protein  YP_002565866  unclonable  1.42447e-09  hitchhiker  3.87981e-06  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_1203  CDS  NC_012029  1211170  1211655  486  membrane-flanked domain protein  YP_002565867  unclonable  3.01885e-09  hitchhiker  4.03438e-06  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_1204  CDS  NC_012029  1211652  1213550  1899  membrane-flanked domain protein  YP_002565868  unclonable  1.58592e-06  hitchhiker  8.93365e-06  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_1205  CDS  NC_012029  1213586  1214731  1146  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  YP_002565869  unclonable  3.95395e-08  hitchhiker  7.19291e-06  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_1206  CDS  NC_012029  1214957  1216024  1068  Squalene/phytoene synthase  YP_002565870  unclonable  2.04086e-08  hitchhiker  6.00855e-06  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_1207  CDS  NC_012029  1216077  1218065  1989  DEAD/DEAH box helicase domain protein  YP_002565871  unclonable  2.29661e-06  hitchhiker  9.14405e-06  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_1208  CDS  NC_012029  1218155  1218760  606  response regulator receiver protein  YP_002565872  unclonable  2.44573e-09  hitchhiker  5.95914e-06  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_1209  CDS  NC_012029  1218915  1220414  1500  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  YP_002565873  unclonable  2.06103e-07  hitchhiker  8.52941e-06  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_1210  CDS  NC_012029  1221066  1222097  1032  hypothetical protein  YP_002565874  unclonable  2.84182e-08  hitchhiker  6.81004e-06  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_1211  CDS  NC_012029  1222192  1222419  228  hypothetical protein  YP_002565875  unclonable  7.00147e-10  hitchhiker  4.46578e-06  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_1212  CDS  NC_012029  1222965  1223963  999  transposase IS4 family protein  YP_002565876  unclonable  2.62262e-08  hitchhiker  7.30642e-06  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_R0025  tRNA  NC_012029  1222533  1222707  175  tRNA-Trp    unclonable  4.93252e-10  hitchhiker  4.64585e-06  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>