19 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Bcenmc03_0289  CDS  NC_010508  317548  318831  1284  major facilitator transporter  YP_001763591  hitchhiker  3.69004e-05  unclonable  5.14998e-11  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0290  CDS  NC_010508  318926  319855  930  LysR family transcriptional regulator  YP_001763592  hitchhiker  3.53581e-07  unclonable  4.04999e-11  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0291  CDS  NC_010508  320041  320874  834  OmpW family protein  YP_001763593  decreased coverage  2.51819e-09  unclonable  4.17391e-11  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0292  CDS  NC_010508  320893  322134  1242  hypothetical protein  YP_001763594  hitchhiker  0.00023062  unclonable  6.23109e-11  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0293  CDS  NC_010508  322283  323704  1422  hypothetical protein  YP_001763595  normal  0.0932383  unclonable  7.16846e-11  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0431  CDS  NC_010508  463579  464247  669  hypothetical protein  YP_001763731  normal  0.0528081  unclonable  7.3878e-11  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_0965  CDS  NC_010508  1065482  1065685  204  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  YP_001764264  unclonable  1.19944e-12  normal  0.392298  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_1058  CDS  NC_010508  1163480  1163803  324  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  YP_001764357  unclonable  8.88322e-13  normal  0.523648  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_1548  CDS  NC_010508  1713397  1714209  813  curculin domain-containing protein  YP_001764845  unclonable  8.8677e-12  normal  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_1893  CDS  NC_010508  2103328  2105751  2424  DnaB domain-containing protein  YP_001765176  unclonable  1.00629e-08  unclonable  8.08467e-11  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_3784  CDS  NC_010515  697744  699540  1797  hypothetical protein  YP_001777425  unclonable  1.99073e-10  decreased coverage  0.00029228  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_4266  CDS  NC_010515  1221268  1221603  336  XRE family transcriptional regulator  YP_001777904  unclonable  7.73837e-14  hitchhiker  4.79642e-06  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_4633  CDS  NC_010515  1629052  1629357  306  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  YP_001778261  unclonable  2.92632e-13  decreased coverage  2.43295e-05  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_4687  CDS  NC_010515  1691682  1692227  546  hypothetical protein  YP_001778311  hitchhiker  1.47737e-06  unclonable  1.86083e-12  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_4688  CDS  NC_010515  1692696  1695206  2511  hypothetical protein  YP_001778312  hitchhiker  0.000356334  unclonable  7.39764e-12  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6699  CDS  NC_010512  779823  780347  525  metal dependent phosphohydrolase  YP_001774308  unclonable  1.01178e-12  normal  0.0898754  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6700  CDS  NC_010512  780357  781034  678  hypothetical protein  YP_001774309  unclonable  2.56546e-12  normal  0.135394  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_6701  CDS  NC_010512  781188  781658  471  hypothetical protein  YP_001774310  unclonable  5.6634e-13  normal  0.0829425  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Bcenmc03_R0058  tRNA  NC_010508  2307036  2307111  76  tRNA-Ala    unclonable  3.57472e-13  normal  0.478437  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>