179 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BCAH820_0091  CDS  NC_011773  89700  92135  2436  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  YP_002449117  n/a    unclonable  4.7884e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0092  CDS  NC_011773  92232  93608  1377  DNA repair protein RadA  YP_002449118  n/a    unclonable  6.92971e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0093  CDS  NC_011773  93612  94685  1074  DNA integrity scanning protein DisA  YP_002449119  n/a    unclonable  2.14187e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0094  CDS  NC_011773  94846  95331  486  hypothetical protein  YP_002449120  n/a    unclonable  5.126e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0095  CDS  NC_011773  95451  95957  507  PilT protein domain protein  YP_002449121  n/a    unclonable  6.33572e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0096  CDS  NC_011773  95974  96654  681  2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase  YP_002449122  n/a    unclonable  1.25768e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0097  CDS  NC_011773  96769  97245  477  2-C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase  YP_002449123  n/a    unclonable  7.2227e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0098  CDS  NC_011773  97317  98792  1476  glutamyl-tRNA synthetase  YP_002449124  n/a    unclonable  4.11563e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0099  CDS  NC_011773  99225  99890  666  serine O-acetyltransferase  YP_002449125  n/a    unclonable  2.6707700000000002e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0100  CDS  NC_011773  99871  101268  1398  cysteinyl-tRNA synthetase  YP_002449126  n/a    unclonable  5.67266e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0101  CDS  NC_011773  101271  101678  408  hypothetical protein  YP_002449127  n/a    unclonable  1.28353e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0102  CDS  NC_011773  101675  102418  744  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  YP_002449128  n/a    unclonable  4.238e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0103  CDS  NC_011773  102422  102934  513  hypothetical protein  YP_002449129  n/a    unclonable  1.28353e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0104  CDS  NC_011773  103002  103658  657  RNA polymerase factor sigma-70  YP_002449130  n/a    unclonable  2.05753e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0105  CDS  NC_011773  103969  104148  180  preprotein translocase subunit SecE  YP_002449131  n/a    unclonable  3.53288e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0106  CDS  NC_011773  104280  104570  291  transcription antitermination protein NusG  YP_002449132  n/a    unclonable  6.209200000000001e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0107  CDS  NC_011773  104608  104814  207  transcription antitermination protein NusG  YP_002449133  n/a    unclonable  5.02279e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0108  CDS  NC_011773  104982  105407  426  50S ribosomal protein L11  YP_002449134  n/a    unclonable  9.878e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0109  CDS  NC_011773  105585  106277  693  50S ribosomal protein L1  YP_002449135  n/a    unclonable  2.9844e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0110  CDS  NC_011773  106510  107010  501  50S ribosomal protein L10  YP_002449136  n/a    unclonable  9.02318e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0111  CDS  NC_011773  107078  107437  360  50S ribosomal protein L7/L12  YP_002449137  n/a    unclonable  4.6816200000000005e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0112  CDS  NC_011773  107514  108113  600  ybxB protein  YP_002449138  n/a    unclonable  8.23527e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0113  CDS  NC_011773  108407  108532  126  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  YP_002449139  n/a    unclonable  1.12263e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0114  CDS  NC_011773  108549  111941  3393  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  YP_002449140  n/a    unclonable  3.65239e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0115  CDS  NC_011773  111979  115590  3612  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  YP_002449141  n/a    unclonable  9.839749999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0116  CDS  NC_011773  115704  115952  249  hypothetical protein  YP_002449142  n/a    unclonable  1.74724e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0117  CDS  NC_011773  116067  116489  423  30S ribosomal protein S12  YP_002449143  n/a    unclonable  4.27577e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0118  CDS  NC_011773  116519  116989  471  30S ribosomal protein S7  YP_002449144  n/a    unclonable  4.49729e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0119  CDS  NC_011773  117197  119275  2079  elongation factor G  YP_002449145  n/a    unclonable  1.92544e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0120  CDS  NC_011773  119393  120580  1188  elongation factor Tu  YP_002449146  n/a    unclonable  7.73817e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0121  CDS  NC_011773  120979  121287  309  30S ribosomal protein S10  YP_002449147  n/a    unclonable  2.5859e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0122  CDS  NC_011773  121322  121954  633  50S ribosomal protein L3  YP_002449148  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0123  CDS  NC_011773  121980  122603  624  50S ribosomal protein L4  YP_002449149  n/a    unclonable  1.21989e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0124  CDS  NC_011773  122603  122893  291  50S ribosomal protein L23  YP_002449150  n/a    unclonable  2.40944e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0125  CDS  NC_011773  122922  123752  831  50S ribosomal protein L2  YP_002449151  n/a    unclonable  2.14187e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0126  CDS  NC_011773  123813  124091  279  30S ribosomal protein S19  YP_002449152  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0127  CDS  NC_011773  124109  124450  342  50S ribosomal protein L22  YP_002449153  n/a    unclonable  4.10741e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0128  CDS  NC_011773  124454  125113  660  30S ribosomal protein S3  YP_002449154  n/a    unclonable  1.11451e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0129  CDS  NC_011773  125115  125549  435  50S ribosomal protein L16  YP_002449155  n/a    unclonable  4.87351e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0130  CDS  NC_011773  125539  125739  201  50S ribosomal protein L29  YP_002449156  n/a    unclonable  1.72927e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0131  CDS  NC_011773  125760  126023  264  30S ribosomal protein S17  YP_002449157  n/a    unclonable  2.17978e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0132  CDS  NC_011773  126067  126435  369  50S ribosomal protein L14  YP_002449158  n/a    unclonable  3.09851e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0133  CDS  NC_011773  126474  126785  312  50S ribosomal protein L24  YP_002449159  n/a    unclonable  2.5334e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0134  CDS  NC_011773  126812  127351  540  50S ribosomal protein L5  YP_002449160  n/a    unclonable  7.52131e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0135  CDS  NC_011773  127385  127570  186  30S ribosomal protein S14  YP_002449161  n/a    unclonable  1.93198e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0136  CDS  NC_011773  127600  127998  399  30S ribosomal protein S8  YP_002449162  n/a    unclonable  5.126e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0137  CDS  NC_011773  128031  128570  540  50S ribosomal protein L6  YP_002449163  n/a    unclonable  8.83996e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0138  CDS  NC_011773  128602  128964  363  50S ribosomal protein L18  YP_002449164  n/a    unclonable  3.4273e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0139  CDS  NC_011773  128986  129486  501  30S ribosomal protein S5  YP_002449165  n/a    unclonable  6.93712e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0140  CDS  NC_011773  129500  129682  183  50S ribosomal protein L30  YP_002449166  n/a    unclonable  1.71148e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0141  CDS  NC_011773  129716  130156  441  50S ribosomal protein L15  YP_002449167  n/a    unclonable  6.02363e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0142  CDS  NC_011773  130156  131223  1068  preprotein translocase, SecY subunit  YP_002449168  n/a    unclonable  6.58947e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0143  CDS  NC_011773  131261  131458  198  preprotein translocase subunit SecY  YP_002449169  n/a    unclonable  2.5334e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0144  CDS  NC_011773  131516  132166  651  adenylate kinase  YP_002449170  n/a    unclonable  1.24496e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0145  CDS  NC_011773  132202  132912  711  methionine aminopeptidase  YP_002449171  n/a    unclonable  1.25768e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0146  CDS  NC_011773  132981  133199  219  translation initiation factor IF-1  YP_002449172  n/a    unclonable  1.72927e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0147  CDS  NC_011773  133235  133348  114  50S ribosomal protein L36  YP_002449173  n/a    unclonable  1.12263e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0666  CDS  NC_011773  638493  640112  1620  L-lactate permease  YP_002449639  n/a    unclonable  1.48305e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0728  CDS  NC_011773  703319  705718  2400  immune inhibitor A metalloprotease  YP_002449701  n/a    unclonable  9.74275e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0839  CDS  NC_011773  797014  797967  954  hypothetical protein  YP_002449791  n/a    unclonable  9.582780000000001e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0986  CDS  NC_011773  953191  954780  1590  surface-layer N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  YP_002449938  n/a    unclonable  8.46837e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0987  CDS  NC_011773  954975  955868  894  hypothetical protein  YP_002449939  n/a    unclonable  6.86692e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0988  CDS  NC_011773  956072  956218  147  hypothetical protein  YP_002449940  n/a    unclonable  2.3727200000000002e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0989  CDS  NC_011773  956453  957448  996  putative proline racemase  YP_002449941  n/a    unclonable  1.0492400000000001e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0990  CDS  NC_011773  957468  958445  978  ornithine cyclodeaminase  YP_002449942  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0991  CDS  NC_011773  958831  959130  300  hypothetical protein  YP_002449943  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0992  CDS  NC_011773  959803  960474  672  hypothetical protein  YP_002449944  n/a    unclonable  1.56365e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0993  CDS  NC_011773  960827  961477  651  hypothetical protein  YP_002449945  n/a    unclonable  1.30541e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0994  CDS  NC_011773  961529  961690  162  hypothetical protein  YP_002449946  n/a    unclonable  1.68827e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0995  CDS  NC_011773  961789  962127  339  hypothetical protein  YP_002449947  n/a    unclonable  4.03653e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0996  CDS  NC_011773  962446  964032  1587  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  YP_002449948  n/a    unclonable  4.41324e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0997  CDS  NC_011773  964134  965084  951  oligopeptide ABC transporter, permease protein  YP_002449949  n/a    unclonable  5.28482e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0998  CDS  NC_011773  965091  965942  852  oligopeptide ABC transporter, permease protein  YP_002449950  n/a    unclonable  3.8284200000000003e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_0999  CDS  NC_011773  965969  966961  993  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  YP_002449951  n/a    unclonable  8.83996e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_1000  CDS  NC_011773  966954  967925  972  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  YP_002449952  n/a    unclonable  5.90335e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_1001  CDS  NC_011773  968314  968457  144  hypothetical protein  YP_002449953  n/a    unclonable  2.12521e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_1002  CDS  NC_011773  968508  969326  819  hypothetical protein  YP_002449954  n/a    unclonable  2.91659e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_1003  CDS  NC_011773  969755  971080  1326  alpha-ketoglutarate permease  YP_002449955  n/a    unclonable  2.8952e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_1004  CDS  NC_011773  971306  972895  1590  sensor histidine kinase  YP_002449956  n/a    unclonable  4.68776e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_1005  CDS  NC_011773  972915  973592  678  response regulator  YP_002449957  n/a    unclonable  1.38637e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_1006  CDS  NC_011773  973589  974557  969  tricarboxylate-binding protein  YP_002449958  n/a    unclonable  4.27577e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_1007  CDS  NC_011773  975480  976031  552  site-specific recombinase  YP_002449959  n/a    unclonable  8.22552e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_1008  CDS  NC_011773  976114  977166  1053  cytosine-specific methyltransferase NlaX  YP_002449960  n/a    unclonable  6.02363e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_1009  CDS  NC_011773  977268  978809  1542  type II restriction-modification system restriction subunit  YP_002449961  n/a    unclonable  3.61014e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_1010  CDS  NC_011773  978796  980070  1275  hypothetical protein  YP_002449962  n/a    unclonable  9.68074e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_1011  CDS  NC_011773  980221  981366  1146  restriction endonuclease  YP_002449963  n/a    unclonable  5.3934100000000005e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_1090  CDS  NC_011773  1044814  1045275  462  hypothetical protein  YP_002450042  n/a    unclonable  2.0164300000000002e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_1091  CDS  NC_011773  1045593  1046594  1002  hypothetical protein  YP_002450043  n/a    unclonable  1.54384e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_1092  CDS  NC_011773  1046614  1046871  258  hypothetical protein  YP_002450044  n/a    unclonable  7.07847e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_1093  CDS  NC_011773  1047061  1047444  384  hypothetical protein  YP_002450045  n/a    unclonable  1.1259e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_1094  CDS  NC_011773  1047937  1048881  945  glyoxalase family protein  YP_002450046  n/a    unclonable  7.65984e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_1862  CDS  NC_011773  1759477  1760721  1245  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  YP_002450813  n/a    unclonable  6.72375e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_2028  CDS  NC_011773  1933893  1935053  1161  putative protease  YP_002450978  n/a    unclonable  2.6707700000000002e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_2276  CDS  NC_011773  2163396  2165297  1902  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  YP_002451226  n/a    unclonable  4.55004e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_2543  CDS  NC_011773  2415921  2417153  1233  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  YP_002451493  n/a    unclonable  1.7515e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_2943  CDS  NC_011773  2774295  2775122  828  polysaccharide deacetylase  YP_002451893  n/a    unclonable  5.02279e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_3811  CDS  NC_011773  3647398  3648630  1233  aspartate kinase I  YP_002452761  n/a    unclonable  3.6837e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_3812  CDS  NC_011773  3648654  3649700  1047  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  YP_002452762  n/a    unclonable  1.82392e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_3813  CDS  NC_011773  3649851  3650450  600  dipicolinate synthase subunit B  YP_002452763  n/a    unclonable  3.09851e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
BCAH820_3814  CDS  NC_011773  3650447  3651349  903  dipicolinate synthase subunit A  YP_002452764  n/a    unclonable  8.15193e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>