39 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Pmob_0001  CDS  NC_010003  53  1417  1365  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_001567073  unclonable  2.97027e-07  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_0007  CDS  NC_010003  4112  5650  1539  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_001567079  unclonable  6.49932e-07  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_0008  CDS  NC_010003  5655  6632  978  ABC transporter periplasmic-binding protein  YP_001567080  unclonable  4.06397e-08  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_0009  CDS  NC_010003  6976  7725  750  deoxyribose-phosphate aldolase  YP_001567081  unclonable  9.86742e-09  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_0010  CDS  NC_010003  7792  7989  198  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  YP_001567082  unclonable  1.02405e-09  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_0011  CDS  NC_010003  8317  8874  558  elongation factor P  YP_001567083  unclonable  5.91354e-09  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_0027  CDS  NC_010003  23726  24967  1242  extracellular solute-binding protein  YP_001567099  unclonable  9.08101e-08  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_0028  CDS  NC_010003  25072  25974  903  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_001567100  unclonable  3.78352e-08  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_0029  CDS  NC_010003  25988  26839  852  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_001567101  unclonable  5.11748e-08  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_0037  CDS  NC_010003  34069  34368  300  stage V sporulation protein S  YP_001567109  unclonable  5.56639e-09  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_0038  CDS  NC_010003  34762  35640  879  periplasmic binding protein  YP_001567110  unclonable  3.9007e-08  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_0056  CDS  NC_010003  50651  51985  1335  hypothetical protein  YP_001567128  unclonable  3.21928e-07  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_0057  CDS  NC_010003  52090  53046  957  S-layer domain-containing protein  YP_001567129  unclonable  5.66138e-08  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_0150  CDS  NC_010003  154121  154393  273  stage V sporulation protein S  YP_001567220  unclonable  2.95872e-09  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_0265  CDS  NC_010003  281796  282926  1131  extracellular ligand-binding receptor  YP_001567332  unclonable  8.54786e-08  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_0289  CDS  NC_010003  306902  308215  1314  extracellular solute-binding protein  YP_001567354  unclonable  1.9091e-07  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_0314  CDS  NC_010003  336912  337694  783  membrane protein-like protein  YP_001567379  unclonable  3.744e-08  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_0319  CDS  NC_010003  344052  345371  1320  signal recognition particle protein  YP_001567384  unclonable  2.88102e-07  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_0608  CDS  NC_010003  659744  660571  828  hypothetical protein  YP_001567665  unclonable  1.10203e-08  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_0709  CDS  NC_010003  759825  760352  528  translation initiation factor IF-3  YP_001567757  unclonable  9.66721e-09  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_0710  CDS  NC_010003  760376  760588  213  ribosomal protein L35  YP_001567758  unclonable  1.79366e-09  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_0711  CDS  NC_010003  760634  760999  366  50S ribosomal protein L20  YP_001567759  unclonable  4.038e-09  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_0712  CDS  NC_010003  761190  761795  606  adenylyl-sulfate kinase  YP_001567760  unclonable  9.0997e-09  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_0731  CDS  NC_010003  782892  783905  1014  permease  YP_001567778  unclonable  9.36228e-08  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_1428  CDS  NC_010003  1532278  1534794  2517  alpha amylase catalytic region  YP_001568454  unclonable  2.63704e-05  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_1438  CDS  NC_010003  1548949  1550151  1203  extracellular solute-binding protein  YP_001568464  unclonable  1.72655e-07  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_1539  CDS  NC_010003  1670218  1671456  1239  major facilitator transporter  YP_001568563  unclonable  1.51531e-07  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_1550  CDS  NC_010003  1683735  1684883  1149  hypothetical protein  YP_001568574  unclonable  1.14409e-07  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_1575  CDS  NC_010003  1715536  1717389  1854  extracellular solute-binding protein  YP_001568594  unclonable  5.89717e-06  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_1649  CDS  NC_010003  1804436  1806238  1803  molecular chaperone DnaK  YP_001568666  unclonable  2.28474e-06  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_1806  CDS  NC_010003  1984162  1984377  216  50S ribosomal protein L31  YP_001568818  unclonable  5.45345e-09  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_1807  CDS  NC_010003  1984444  1984875  432  hypothetical protein  YP_001568819  unclonable  1.59704e-08  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_1845  CDS  NC_010003  2029416  2030396  981  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsX  YP_001568857  unclonable  8.45855e-08  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_1910  CDS  NC_010003  2114931  2115203  273  histone family protein DNA-binding protein  YP_001568920  unclonable  3.11196e-09  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_1911  CDS  NC_010003  2115275  2115946  672  metallophosphoesterase  YP_001568921  unclonable  1.47352e-08  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_1939  CDS  NC_010003  2149251  2150408  1158  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase  YP_001568949  unclonable  1.41215e-07  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_1940  CDS  NC_010003  2150405  2151928  1524  membrane-associated zinc metalloprotease  YP_001568950  unclonable  7.40913e-07  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_1960  CDS  NC_010003  2168877  2169353  477  glutamine amidotransferase class-II  YP_001568970  unclonable  7.22641e-09  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Pmob_R0025  tRNA  NC_010003  660680  660754  75  tRNA-Glu    unclonable  4.33123e-10  n/a    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>