23 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Rpic_0438  CDS  NC_010682  467686  469287  -  1602  phage integrase  YP_001898025  normal  0.0285557  unclonable  0.0000000000000141533  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0439  CDS  NC_010682  469794  470816  +  1023  ATPase  YP_001898026  unclonable  0.00000000906876  unclonable  0.0000000000000120536  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_1477  CDS  NC_010682  1570679  1571272  -  594  Resolvase domain  YP_001899048  normal  0.79192  unclonable  0.0000000000000150315  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_1478  CDS  NC_010682  1571511  1571789  +  279  hypothetical protein  YP_001899049  normal  0.690305  unclonable  0.0000000000000121771  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_1854  CDS  NC_010682  1946055  1946339  +  285  addiction module toxin, RelE/StbE family  YP_001899422  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3168  CDS  NC_010682  3320311  3320427  +  117  hypothetical protein  YP_001900722  normal  0.118191  unclonable  0.00000000000000919607  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3169  CDS  NC_010682  3320534  3320830  +  297  plasmid maintenance system killer  YP_001900723  normal  0.0238227  unclonable  0.0000000000000109044  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3170  CDS  NC_010682  3320844  3321974  +  1131  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  YP_001900724  normal  0.19493  unclonable  0.0000000000000213391  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3171  CDS  NC_010682  3321984  3322454  +  471  hypothetical protein  YP_001900725  decreased coverage  0.00448166  unclonable  0.0000000000000130626  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3172  CDS  NC_010682  3322510  3325497  -  2988  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  YP_001900726  normal  1  unclonable  0.0000000000000957293  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3173  CDS  NC_010682  3325497  3326681  -  1185  restriction modification system, type I  YP_001900727  normal  1  unclonable  0.0000000000000252983  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3174  CDS  NC_010682  3326681  3328354  -  1674  UvrD/REP helicase  YP_001900728  normal  0.938492  unclonable  0.0000000000000324964  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3175  CDS  NC_010682  3328351  3330255  -  1905  SMC domain protein  YP_001900729  normal  0.0609812  unclonable  0.0000000000000447606  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3176  CDS  NC_010682  3330252  3331763  -  1512  N-6 DNA methylase  YP_001900730  decreased coverage  0.00238415  unclonable  0.0000000000000309055  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3177  CDS  NC_010682  3331760  3332551  -  792  hypothetical protein  YP_001900731  decreased coverage  0.000000104058  unclonable  0.0000000000000181804  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3286  CDS  NC_010682  3429209  3429517  -  309  50S ribosomal protein L24  YP_001900840  unclonable  0.000000000751448  decreased coverage  0.000000509284  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3287  CDS  NC_010682  3429529  3429897  -  369  50S ribosomal protein L14  YP_001900841  unclonable  0.00000000157529  decreased coverage  0.000000579661  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3295  CDS  NC_010682  3433325  3433639  -  315  50S ribosomal protein L23  YP_001900849  unclonable  0.00000000040814  hitchhiker  0.0000223362  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3296  CDS  NC_010682  3433636  3434256  -  621  50S ribosomal protein L4  YP_001900850  unclonable  0.00000000157529  hitchhiker  0.0000757839  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3908  CDS  NC_010678  153991  154494  -  504  thioesterase superfamily protein  YP_001892442  unclonable  0.000000000524164  normal  0.88258  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_R0014  tRNA  NC_010682  1083008  1083083  +  76  tRNA-Ala    unclonable  0.000000000183317  normal  0.441681  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_R0015  tRNA  NC_010682  1083203  1083278  +  76  tRNA-Glu    unclonable  0.000000000183317  normal  0.335079  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_R0064  rRNA  NC_010678  818863  820393  -  1531  16S ribosomal RNA    unclonable  0.000000106232  normal  0.460801  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>