23 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Rpic_0438  CDS  NC_010682  467686  469287  1602  phage integrase  YP_001898025  normal  0.0285557  unclonable  1.41533e-14  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_0439  CDS  NC_010682  469794  470816  1023  ATPase  YP_001898026  unclonable  9.06876e-09  unclonable  1.20536e-14  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_1477  CDS  NC_010682  1570679  1571272  594  Resolvase domain  YP_001899048  normal  0.79192  unclonable  1.50315e-14  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_1478  CDS  NC_010682  1571511  1571789  279  hypothetical protein  YP_001899049  normal  0.690305  unclonable  1.21771e-14  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_1854  CDS  NC_010682  1946055  1946339  285  addiction module toxin, RelE/StbE family  YP_001899422  normal  0.057882  unclonable  9.29031e-15  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3168  CDS  NC_010682  3320311  3320427  117  hypothetical protein  YP_001900722  normal  0.118191  unclonable  9.19607e-15  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3169  CDS  NC_010682  3320534  3320830  297  plasmid maintenance system killer  YP_001900723  normal  0.0238227  unclonable  1.09044e-14  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3170  CDS  NC_010682  3320844  3321974  1131  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  YP_001900724  normal  0.19493  unclonable  2.13391e-14  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3171  CDS  NC_010682  3321984  3322454  471  hypothetical protein  YP_001900725  decreased coverage  0.00448166  unclonable  1.30626e-14  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3172  CDS  NC_010682  3322510  3325497  2988  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  YP_001900726  normal  unclonable  9.57293e-14  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3173  CDS  NC_010682  3325497  3326681  1185  restriction modification system, type I  YP_001900727  normal  unclonable  2.52983e-14  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3174  CDS  NC_010682  3326681  3328354  1674  UvrD/REP helicase  YP_001900728  normal  0.938492  unclonable  3.24964e-14  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3175  CDS  NC_010682  3328351  3330255  1905  SMC domain protein  YP_001900729  normal  0.0609812  unclonable  4.47606e-14  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3176  CDS  NC_010682  3330252  3331763  1512  N-6 DNA methylase  YP_001900730  decreased coverage  0.00238415  unclonable  3.09055e-14  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3177  CDS  NC_010682  3331760  3332551  792  hypothetical protein  YP_001900731  decreased coverage  1.04058e-07  unclonable  1.81804e-14  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3286  CDS  NC_010682  3429209  3429517  309  50S ribosomal protein L24  YP_001900840  unclonable  7.51448e-10  decreased coverage  5.09284e-07  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3287  CDS  NC_010682  3429529  3429897  369  50S ribosomal protein L14  YP_001900841  unclonable  1.57529e-09  decreased coverage  5.79661e-07  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3295  CDS  NC_010682  3433325  3433639  315  50S ribosomal protein L23  YP_001900849  unclonable  4.0814e-10  hitchhiker  2.23362e-05  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3296  CDS  NC_010682  3433636  3434256  621  50S ribosomal protein L4  YP_001900850  unclonable  1.57529e-09  hitchhiker  7.57839e-05  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_3908  CDS  NC_010678  153991  154494  504  thioesterase superfamily protein  YP_001892442  unclonable  5.24164e-10  normal  0.88258  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_R0014  tRNA  NC_010682  1083008  1083083  76  tRNA-Ala    unclonable  1.83317e-10  normal  0.441681  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_R0015  tRNA  NC_010682  1083203  1083278  76  tRNA-Glu    unclonable  1.83317e-10  normal  0.335079  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_R0064  rRNA  NC_010678  818863  820393  1531  16S ribosomal RNA    unclonable  1.06232e-07  normal  0.460801  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>