129 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Teth514_0062  CDS  NC_010320  64485  64736  252  AbrB family transcriptional regulator  YP_001661720  unclonable  1.63043e-11  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0063  CDS  NC_010320  64914  65498  585  nucleoside recognition domain-containing protein  YP_001661721  unclonable  7.80152e-11  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0064  CDS  NC_010320  65504  66025  522  nucleoside recognition domain-containing protein  YP_001661722  unclonable  6.55497e-11  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0065  CDS  NC_010320  66106  67509  1404  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  YP_001661723  unclonable  4.49224e-09  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0066  CDS  NC_010320  67845  69743  1899  methionyl-tRNA synthetase  YP_001661724  unclonable  5.21971e-08  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0113  CDS  NC_010320  109583  110011  429  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  YP_001661771  unclonable  5.98589e-11  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0186  CDS  NC_010320  189215  189703  489  AsnC family transcriptional regulator  YP_001661841  unclonable  6.83645e-11  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0414  CDS  NC_010320  425284  426111  828  transcriptional antiterminator, BglG  YP_001662060  unclonable  6.57249e-10  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0415  CDS  NC_010320  426243  427394  1152  trans-homoaconitate synthase  YP_001662061  unclonable  2.79687e-09  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0438  CDS  NC_010320  452228  453244  1017  alanine racemase  YP_001662084  unclonable  8.64233e-10  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0439  CDS  NC_010320  453299  453976  678  two component transcriptional regulator  YP_001662085  unclonable  2.23011e-10  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0440  CDS  NC_010320  453987  455387  1401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  YP_001662086  unclonable  1.1534e-08  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0441  CDS  NC_010320  455485  456939  1455  hypothetical protein  YP_001662087  unclonable  1.31637e-08  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0442  CDS  NC_010320  456944  457456  513  hypothetical protein  YP_001662088  unclonable  1.87912e-10  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0443  CDS  NC_010320  457552  458091  540  hypothetical protein  YP_001662089  unclonable  1.58208e-10  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0444  CDS  NC_010320  458648  459151  504  rubrerythrin  YP_001662090  unclonable  1.56568e-10  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0445  CDS  NC_010320  459426  460613  1188  S-adenosylmethionine synthetase  YP_001662091  unclonable  3.09499e-09  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0467  CDS  NC_010320  480076  480309  234  hypothetical protein  YP_001662113  unclonable  1.82221e-11  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0468  CDS  NC_010320  480650  481432  783  extracellular solute-binding protein  YP_001662114  unclonable  3.61301e-10  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0477  CDS  NC_010320  487955  490648  2694  preprotein translocase subunit SecA  YP_001662123  unclonable  2.53416e-06  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0485  CDS  NC_010320  499537  500478  942  carbamate kinase  YP_001662131  unclonable  6.18454e-10  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0486  CDS  NC_010320  500772  501356  585  membrane protein-like protein  YP_001662132  unclonable  9.83919e-11  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0501  CDS  NC_010320  515005  515835  831  hypothetical protein  YP_001662147  unclonable  8.73287e-10  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0502  CDS  NC_010320  515837  516682  846  ferredoxin-NADP(+) reductase subunit alpha  YP_001662148  unclonable  9.86289e-10  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0503    NC_010320  516672  518064  1393      unclonable  6.39398e-09  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0506  CDS  NC_010320  520243  521136  894  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  YP_001662150  unclonable  4.24697e-10  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0574  CDS  NC_010320  596970  598013  1044  integrase catalytic subunit  YP_001662218  unclonable  2.57634e-09  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0588  CDS  NC_010320  610218  610901  684  two component transcriptional regulator  YP_001662232  unclonable  4.51147e-10  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0589  CDS  NC_010320  610904  612316  1413  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  YP_001662233  unclonable  1.45863e-08  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0590  CDS  NC_010320  612581  613942  1362  2-alkenal reductase  YP_001662234  unclonable  7.22472e-09  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0696  CDS  NC_010320  728132  728554  423  hypothetical protein  YP_001662339  unclonable  9.83919e-11  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0755  CDS  NC_010320  783566  784597  1032  integrase catalytic subunit  YP_001662395  unclonable  1.47635e-09  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0810  CDS  NC_010320  842540  844039  1500  lysyl-tRNA synthetase  YP_001662449  unclonable  7.14975e-09  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0811  CDS  NC_010320  844432  844998  567  GTP cyclohydrolase I  YP_001662450  unclonable  6.76289e-11  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0812  CDS  NC_010320  845011  845823  813  dihydropteroate synthase  YP_001662451  unclonable  2.34542e-10  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0844  CDS  NC_010320  881351  882808  1458  glutamyl-tRNA synthetase  YP_001662483  unclonable  1.94011e-08  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0850  CDS  NC_010320  886863  887507  645  RNA polymerase factor sigma-70  YP_001662489  unclonable  5.58431e-10  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0851  CDS  NC_010320  887786  888988  1203  elongation factor Tu  YP_001662490  unclonable  7.84672e-09  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0852    NC_010320  889172  889318  147      unclonable  2.86593e-11  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0853  CDS  NC_010320  889351  889506  156  preprotein translocase, SecE subunit  YP_001662491  unclonable  2.44118e-11  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0854  CDS  NC_010320  889582  890106  525  transcription antitermination protein NusG  YP_001662492  unclonable  9.07525e-11  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0855  CDS  NC_010320  890153  890575  423  50S ribosomal protein L11  YP_001662493  unclonable  6.62355e-11  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0856  CDS  NC_010320  890622  891314  693  50S ribosomal protein L1  YP_001662494  unclonable  1.85888e-10  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0861  CDS  NC_010320  900082  900336  255  putative L7Ae-like ribosomal protein  YP_001662499  unclonable  3.01408e-11  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0862  CDS  NC_010320  900364  900765  402  30S ribosomal protein S12  YP_001662500  unclonable  5.41183e-11  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0863  CDS  NC_010320  900845  901315  471  30S ribosomal protein S7  YP_001662501  unclonable  7.41191e-11  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0864  CDS  NC_010320  901365  903434  2070  elongation factor G  YP_001662502  unclonable  3.06199e-07  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0865  CDS  NC_010320  903449  904651  1203  elongation factor Tu  YP_001662503  unclonable  2.88327e-09  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0866  CDS  NC_010320  904843  905151  309  30S ribosomal protein S10  YP_001662504  unclonable  6.10931e-11  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0901  CDS  NC_010320  923223  923654  432  50S ribosomal protein L13  YP_001662539  unclonable  1.18039e-10  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0902  CDS  NC_010320  923669  924061  393  30S ribosomal protein S9  YP_001662540  unclonable  7.9624e-11  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0911  CDS  NC_010320  936941  937441  501  cation antiporter  YP_001662548  unclonable  4.89084e-11  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0972  CDS  NC_010320  992027  993391  1365  Na+/H+ antiporter NhaC  YP_001662609  unclonable  7.30047e-09  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_0975  CDS  NC_010320  995708  997000  1293  homoserine dehydrogenase  YP_001662612  unclonable  4.87265e-09  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1041  CDS  NC_010320  1074046  1074651  606  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  YP_001662676  unclonable  6.85221e-10  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1141  CDS  NC_010320  1181978  1182571  594  metal dependent phosphohydrolase  YP_001662774  unclonable  1.47329e-10  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1142  CDS  NC_010320  1182640  1183113  474  ferric uptake regulator family protein  YP_001662775  unclonable  7.6439e-11  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1180  CDS  NC_010320  1215581  1217161  1581  alpha amylase, catalytic region  YP_001662810  unclonable  2.65218e-08  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1209  CDS  NC_010320  1249108  1250733  1626  alpha-glucan phosphorylase  YP_001662839  unclonable  8.41932e-09  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1232  CDS  NC_010320  1273383  1274510  1128  hypothetical protein  YP_001662862  unclonable  2.19074e-09  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1239  CDS  NC_010320  1281170  1282519  1350  SNF2-related protein  YP_001662869  unclonable  2.94279e-09  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1240  CDS  NC_010320  1282524  1282982  459  hypothetical protein  YP_001662870  unclonable  5.86496e-11  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1294  CDS  NC_010320  1330993  1331649  657  putative transcriptional regulator  YP_001662923  unclonable  1.97629e-10  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1346  CDS  NC_010320  1382299  1383045  747  DNA repair protein RecO  YP_001662972  unclonable  2.64775e-10  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1347  CDS  NC_010320  1383060  1383470  411  ubiquitin-associated domain-containing protein  YP_001662973  unclonable  6.90799e-11  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1348  CDS  NC_010320  1383580  1384968  1389  glycyl-tRNA synthetase  YP_001662974  unclonable  1.02075e-08  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1429  CDS  NC_010320  1463875  1464678  804  cell wall hydrolase, SleB  YP_001663054  unclonable  4.99844e-10  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1430  CDS  NC_010320  1464732  1465292  561  hypothetical protein  YP_001663055  unclonable  2.36998e-10  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1460  CDS  NC_010320  1492211  1493596  1386  radical SAM domain-containing protein  YP_001663085  unclonable  6.86349e-09  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1461  CDS  NC_010320  1493577  1494134  558  carbonic anhydrase  YP_001663086  unclonable  1.78452e-10  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1462  CDS  NC_010320  1494154  1495389  1236  preprotein translocase subunit SecD  YP_001663087  unclonable  5.72302e-09  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1467    NC_010320  1501101  1503259  2159      unclonable  3.46185e-07  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1489  CDS  NC_010320  1521548  1524181  2634  alanyl-tRNA synthetase  YP_001663112  unclonable  1.63922e-06  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1490  CDS  NC_010320  1524259  1524516  258  hypothetical protein  YP_001663113  unclonable  4.41821e-11  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1491  CDS  NC_010320  1524572  1524991  420  Holliday junction resolvase-like protein  YP_001663114  unclonable  7.48947e-11  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1492  CDS  NC_010320  1525071  1525355  285  hypothetical protein  YP_001663115  unclonable  5.1458e-11  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1493  CDS  NC_010320  1525579  1526019  441  ferric uptake regulator family protein  YP_001663116  unclonable  1.38692e-10  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1507  CDS  NC_010320  1539605  1539970  366  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  YP_001663130  unclonable  1.0883e-10  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1508  CDS  NC_010320  1540038  1540796  759  peptidase A24A domain-containing protein  YP_001663131  unclonable  5.99925e-10  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1539  CDS  NC_010320  1561845  1562444  600  hypothetical protein  YP_001663162  unclonable  1.47329e-10  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1616  CDS  NC_010320  1633378  1633845  468  ribonuclease H  YP_001663238  unclonable  1.13365e-10  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1617  CDS  NC_010320  1634023  1635015  993  site-specific tyrosine recombinase XerC  YP_001663239  unclonable  1.55402e-09  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1713  CDS  NC_010320  1720569  1721909  1341  signal recognition particle protein  YP_001663335  unclonable  8.59311e-09  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1722  CDS  NC_010320  1730679  1730906  228  acyl carrier protein  YP_001663344  unclonable  6.62355e-11  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1723  CDS  NC_010320  1730949  1731692  744  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  YP_001663345  unclonable  6.57249e-10  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1728  CDS  NC_010320  1735553  1736155  603  fatty acid biosynthesis transcriptional regulator  YP_001663350  unclonable  1.85888e-10  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1729  CDS  NC_010320  1736277  1736459  183  ribosomal protein L32  YP_001663351  unclonable  3.16991e-11  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1730  CDS  NC_010320  1736477  1736962  486  hypothetical protein  YP_001663352  unclonable  1.31873e-10  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1731  CDS  NC_010320  1737034  1738239  1206  acetate kinase  YP_001663353  unclonable  4.22881e-09  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1743  CDS  NC_010320  1748813  1749163  351  hypothetical protein  YP_001663365  unclonable  5.09251e-11  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1744  CDS  NC_010320  1749395  1749583  189  50S ribosomal protein L28  YP_001663366  unclonable  2.05787e-11  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1774  CDS  NC_010320  1781587  1782468  882  cation diffusion facilitator family transporter  YP_001663396  unclonable  1.03729e-09  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1957  CDS  NC_010320  1966054  1967097  1044  integrase catalytic subunit  YP_001663571  unclonable  1.2554e-09  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1998  CDS  NC_010320  2008095  2008571  477  transcriptional regulator NrdR  YP_001663606  unclonable  1.30508e-10  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_1999  CDS  NC_010320  2008639  2008884  246  PRC-barrel domain-containing protein  YP_001663607  unclonable  4.79009e-11  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_2000  CDS  NC_010320  2008953  2009723  771  sporulation sigma factor SigG  YP_001663608  unclonable  4.80045e-10  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_2056  CDS  NC_010320  2068061  2069302  1242  major facilitator transporter  YP_001663664  unclonable  8.77049e-09  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_2057  CDS  NC_010320  2069405  2071309  1905  threonyl-tRNA synthetase  YP_001663665  unclonable  1.36416e-07  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_2064  CDS  NC_010320  2076985  2077188  204  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  YP_001663672  unclonable  4.24325e-11  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Teth514_2065  CDS  NC_010320  2077264  2078010  747  silent information regulator protein Sir2  YP_001663673  unclonable  5.05079e-10  n/a    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>