164 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Glov_0002  CDS  NC_010814  1870  2988  1119  DNA polymerase III, beta subunit  YP_001950261  unclonable  1.38199e-06  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0027  CDS  NC_010814  28298  30844  2547  DNA gyrase, A subunit  YP_001950285  unclonable  0.000124476  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0211  CDS  NC_010814  196004  197455  1452  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  YP_001950462  unclonable  3.24038e-06  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0223  CDS  NC_010814  205816  206403  588  transcriptional regulator, TetR family  YP_001950474  unclonable  8.53805e-08  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0346  CDS  NC_010814  317317  318105  789  tRNA pseudouridine synthase A  YP_001950594  unclonable  2.24311e-07  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0347  CDS  NC_010814  318224  319324  1101  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  YP_001950595  unclonable  1.14034e-06  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0348  CDS  NC_010814  319392  320483  1092  3-isopropylmalate dehydrogenase  YP_001950596  unclonable  1.28786e-06  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0364  CDS  NC_010814  336214  337830  1617  MscS Mechanosensitive ion channel  YP_001950612  unclonable  5.49474e-06  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0399  CDS  NC_010814  376846  378036  1191  beta-lactamase domain protein  YP_001950647  unclonable  1.65819e-06  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0400  CDS  NC_010814  378223  379575  1353  DNA repair protein RadA  YP_001950648  unclonable  1.97198e-06  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0401  CDS  NC_010814  379651  380007  357  transcriptional regulator, TraR/DksA family  YP_001950649  unclonable  1.9993e-08  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0415  CDS  NC_010814  396089  396412  324  protein of unknown function YGGT  YP_001950663  unclonable  3.37721e-08  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0416  CDS  NC_010814  396573  397364  792  Inositol-phosphate phosphatase  YP_001950664  unclonable  1.98572e-07  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0417  CDS  NC_010814  397361  397696  336  hypothetical protein  YP_001950665  unclonable  4.09151e-08  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0484  CDS  NC_010814  460420  461586  1167  2-alkenal reductase  YP_001950732  unclonable  1.48342e-06  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0499  CDS  NC_010814  474287  475618  1332  hypothetical protein  YP_001950747  unclonable  1.65819e-06  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0501  CDS  NC_010814  476820  477650  831  Uroporphyrinogen-III synthase  YP_001950749  unclonable  1.90734e-07  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0554  CDS  NC_010814  523321  524178  858  peptidase M48 Ste24p  YP_001950802  unclonable  1.77743e-07  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0665  CDS  NC_010814  671690  672925  1236  cell division protein FtsA  YP_001950911  unclonable  1.56077e-06  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0692  CDS  NC_010814  703019  703564  546  cob(I)alamin adenosyltransferase  YP_001950938  unclonable  9.6318e-08  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0693  CDS  NC_010814  703672  704070  399  hypothetical protein  YP_001950939  unclonable  5.15646e-08  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0699  CDS  NC_010814  708771  709688  918  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  YP_001950945  unclonable  3.2571e-07  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0700  CDS  NC_010814  709791  713288  3498  transcription-repair coupling factor  YP_001950946  unclonable  0.00154056  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0753  CDS  NC_010814  763197  764399  1203  putative PAS/PAC sensor protein  YP_001950999  unclonable  1.71105e-06  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0754  CDS  NC_010814  764579  767035  2457  penicillin-binding protein, 1A family  YP_001951000  unclonable  0.000281003  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0756  CDS  NC_010814  774047  776272  2226  ribonuclease, Rne/Rng family  YP_001951002  unclonable  6.9675e-05  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0763  CDS  NC_010814  783641  784093  453  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  YP_001951009  unclonable  3.66044e-08  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0838    NC_010814  858742  862056  3315      unclonable  0.00135022  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0980  CDS  NC_010814  1018753  1019796  1044  rod shape-determining protein MreB  YP_001951223  unclonable  6.6828e-07  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0981  CDS  NC_010814  1019968  1022742  2775  isoleucyl-tRNA synthetase  YP_001951224  unclonable  0.000415379  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0982  CDS  NC_010814  1022744  1023232  489  lipoprotein signal peptidase  YP_001951225  unclonable  1.03329e-07  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0983  CDS  NC_010814  1023331  1023540  210  hypothetical protein  YP_001951226  unclonable  4.00943e-08  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0984  CDS  NC_010814  1023611  1024021  411  hypothetical protein  YP_001951227  unclonable  6.05763e-08  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0985  CDS  NC_010814  1024091  1024987  897  HhH-GPD family protein  YP_001951228  unclonable  3.91323e-07  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0986  CDS  NC_010814  1024971  1026143  1173  hypothetical protein  YP_001951229  unclonable  1.03126e-06  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0987  CDS  NC_010814  1026279  1026794  516  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  YP_001951230  unclonable  6.37333e-08  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0988  CDS  NC_010814  1026871  1027374  504  hypothetical protein  YP_001951231  unclonable  5.15646e-08  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0990  CDS  NC_010814  1028559  1029893  1335  protein of unknown function DUF512  YP_001951233  unclonable  9.32101e-07  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_0991  CDS  NC_010814  1029960  1030190  231  RNA chaperone Hfq  YP_001951234  unclonable  7.48773e-09  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1044  CDS  NC_010814  1084893  1086149  1257  hypothetical protein  YP_001951287  unclonable  9.6075e-07  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1091  CDS  NC_010814  1138940  1140598  1659  hypothetical protein  YP_001951334  unclonable  8.08246e-06  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1149  CDS  NC_010814  1200315  1202885  2571  molybdopterin oxidoreductase  YP_001951391  unclonable  0.000213682  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1176  CDS  NC_010814  1229111  1230004  894  transcriptional regulator, LysR family  YP_001951418  unclonable  4.0335e-07  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1206  CDS  NC_010814  1251605  1252498  894  transcriptional regulator, LysR family  YP_001951448  unclonable  4.0335e-07  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1207  CDS  NC_010814  1252535  1253206  672  exsB protein  YP_001951449  unclonable  2.26628e-07  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1208  CDS  NC_010814  1253590  1254936  1347  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  YP_001951450  unclonable  2.78283e-06  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1269  CDS  NC_010814  1319196  1320191  996  hypothetical protein  YP_001951511  unclonable  2.2202e-07  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1270  CDS  NC_010814  1320283  1321107  825  hypothetical protein  YP_001951512  unclonable  1.79578e-07  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1313  CDS  NC_010814  1358186  1359124  939  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  YP_001951554  unclonable  2.61036e-07  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1314  CDS  NC_010814  1359158  1359793  636  Fibronectin type III domain protein  YP_001951555  unclonable  1.46829e-07  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1315  CDS  NC_010814  1359991  1360998  1008  hypothetical protein  YP_001951556  unclonable  5.24828e-07  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1316  CDS  NC_010814  1361187  1362014  828  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  YP_001951557  unclonable  2.71836e-07  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1329  CDS  NC_010814  1373679  1375277  1599  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  YP_001951570  unclonable  5.33085e-06  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1330  CDS  NC_010814  1375372  1376229  858  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  YP_001951571  unclonable  3.87324e-07  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1341  CDS  NC_010814  1390817  1391188  372  30S ribosomal protein S12  YP_001951582  unclonable  3.69822e-08  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1454  CDS  NC_010814  1506896  1510183  3288  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  YP_001951693  unclonable  0.000744178  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1457  CDS  NC_010814  1515876  1518698  2823  hypothetical protein  YP_001951696  unclonable  0.000415379  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1514  CDS  NC_010814  1586485  1588113  1629  hypothetical protein  YP_001951750  unclonable  1.54767e-05  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1515  CDS  NC_010814  1588177  1590786  2610  polysaccharide export protein  YP_001951751  unclonable  0.000317972  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1598  CDS  NC_010814  1689795  1691135  1341  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  YP_001951834  unclonable  2.69909e-06  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1605  CDS  NC_010814  1697546  1698964  1419  Phosphoglucomutase  YP_001951841  unclonable  1.65819e-06  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1615  CDS  NC_010814  1718459  1718866  408  hypothetical protein  YP_001951851  unclonable  5.53478e-08  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1616  CDS  NC_010814  1719111  1720115  1005  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, type I  YP_001951852  unclonable  5.14015e-07  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1673  CDS  NC_010814  1782387  1782653  267  30S ribosomal protein S15  YP_001951909  unclonable  2.47174e-08  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1721  CDS  NC_010814  1822836  1826807  3972  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  YP_001951957  unclonable  0.00699469  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1743  CDS  NC_010814  1854753  1855223  471  hypothetical protein  YP_001951979  unclonable  6.91154e-08  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1744  CDS  NC_010814  1855348  1856478  1131  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  YP_001951980  unclonable  1.05238e-06  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1754  CDS  NC_010814  1864619  1865884  1266  acetate kinase  YP_001951990  unclonable  1.22438e-06  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1776  CDS  NC_010814  1892984  1894960  1977  sodium/hydrogen exchanger  YP_001952012  unclonable  3.81991e-05  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1777  CDS  NC_010814  1895051  1896082  1032  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  YP_001952013  unclonable  1.24944e-06  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1875  CDS  NC_010814  1997061  1997354  294  hypothetical protein  YP_001952111  unclonable  1.93919e-08  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1876  CDS  NC_010814  1997422  1998570  1149  class II aldolase/adducin family protein  YP_001952112  unclonable  5.46395e-07  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1877  CDS  NC_010814  1998570  1999391  822  Peptidase M23  YP_001952113  unclonable  1.21356e-07  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1878  CDS  NC_010814  1999527  2000246  720  type IV pilus assembly PilZ  YP_001952114  unclonable  1.1309e-07  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1879  CDS  NC_010814  2000450  2000788  339  nitrogen regulatory protein P-II  YP_001952115  unclonable  2.57329e-08  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1880  CDS  NC_010814  2000819  2002231  1413  glutamine synthetase, type I  YP_001952116  unclonable  1.93133e-06  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1881  CDS  NC_010814  2002361  2003038  678  peptidase M50  YP_001952117  unclonable  1.48344e-07  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1887  CDS  NC_010814  2007767  2010298  2532  bifunctional aconitate hydratase 2/2-methylisocitrate dehydratase  YP_001952123  unclonable  0.000227098  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1920  CDS  NC_010814  2044807  2046174  1368  carboxyl-terminal protease  YP_001952156  unclonable  2.16068e-06  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1921  CDS  NC_010814  2046270  2047466  1197  Peptidase M23  YP_001952157  unclonable  1.18753e-06  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1926  CDS  NC_010814  2050524  2050802  279  histone family protein DNA-binding protein  YP_001952162  unclonable  2.01993e-08  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1927  CDS  NC_010814  2050897  2052156  1260  ATP-dependent protease ATP-binding subunit ClpX  YP_001952163  unclonable  9.22573e-07  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1928  CDS  NC_010814  2052158  2052751  594  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  YP_001952164  unclonable  8.03868e-08  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1929  CDS  NC_010814  2052765  2054087  1323  trigger factor  YP_001952165  unclonable  2.16068e-06  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1932  CDS  NC_010814  2058009  2059256  1248  serine hydroxymethyltransferase  YP_001952168  unclonable  1.67671e-06  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1933  CDS  NC_010814  2059351  2059800  450  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  YP_001952169  unclonable  6.91154e-08  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1936  CDS  NC_010814  2061495  2062232  738  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  YP_001952172  unclonable  2.45701e-07  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1937  CDS  NC_010814  2062255  2062692  438  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  YP_001952173  unclonable  7.79901e-08  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_1970  CDS  NC_010814  2092591  2093637  1047  hypothetical protein  YP_001952206  unclonable  9.04058e-07  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_2018  CDS  NC_010814  2147480  2148355  876  hypothetical protein  YP_001952254  unclonable  4.0335e-07  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_2071  CDS  NC_010814  2206946  2207356  411  PilT protein domain protein  YP_001952307  unclonable  6.12015e-08  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_2076  CDS  NC_010814  2210020  2210973  954  protein of unknown function DUF1566  YP_001952312  unclonable  3.00588e-07  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_2077  CDS  NC_010814  2211361  2211570  210  hypothetical protein  YP_001952313  unclonable  1.11793e-08  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_2078  CDS  NC_010814  2211583  2212059  477  transcription elongation factor GreA  YP_001952314  unclonable  2.87405e-08  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_2097  CDS  NC_010814  2235180  2236820  1641  4-phytase  YP_001952333  unclonable  7.75897e-06  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_2098  CDS  NC_010814  2236817  2238517  1701  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  YP_001952334  unclonable  1.20088e-05  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_2107  CDS  NC_010814  2246472  2247092  621  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  YP_001952343  unclonable  1.16567e-07  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_2108  CDS  NC_010814  2247195  2247458  264  30S ribosomal protein S20  YP_001952344  unclonable  2.04078e-08  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_2109  CDS  NC_010814  2247629  2250136  2508  Spore coat protein CotH  YP_001952345  unclonable  0.00013644  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Glov_2145  CDS  NC_010814  2291004  2292725  1722  ribosomal protein S1  YP_001952381  unclonable  1.42665e-05  n/a    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>