10 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Daci_1311  CDS  NC_010002  1456445  1458064  1620  hypothetical protein  YP_001562340  unclonable  2.57751e-10  normal  0.0121442  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_2606  CDS  NC_010002  2877100  2877681  582  prophage LambdaSo, lysozyme, putative  YP_001563629  hitchhiker  0.00071357  unclonable  3.49737e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_2607  CDS  NC_010002  2877678  2877944  267  hypothetical protein  YP_001563630  hitchhiker  0.000647667  unclonable  2.51353e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_2608  CDS  NC_010002  2877946  2878149  204  tail X family protein  YP_001563631  hitchhiker  0.00274185  unclonable  2.34283e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_2609  CDS  NC_010002  2878535  2878753  219  hypothetical protein  YP_001563632  normal  0.0316496  unclonable  2.75068e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_2610  CDS  NC_010002  2879182  2880198  1017  integrase family protein  YP_001563633  normal  0.0241311  unclonable  5.16639e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_3155  CDS  NC_010002  3471357  3472349  993  HNH endonuclease  YP_001564178  unclonable  1.47515e-11  unclonable  2.36676e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_5684  CDS  NC_010002  6322395  6322847  453  OsmC family protein  YP_001566697  unclonable  1.58569e-12  normal  0.43813  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_5758  CDS  NC_010002  6412236  6413309  1074  band 7 protein  YP_001566771  hitchhiker  7.20361e-09  unclonable  1.02011e-15  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Daci_5759  CDS  NC_010002  6413296  6414228  933  hypothetical protein  YP_001566772  hitchhiker  0.00469268  unclonable  8.69143e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>