15 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Cmaq_0166  CDS  NC_009954  194286  196706  2421  valyl-tRNA synthetase  YP_001540005  unclonable  5.60387e-08  normal  0.070078  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0273  CDS  NC_009954  310057  311964  1908  adenylylsulfate reductase subunit alpha  YP_001540111  unclonable  3.19347e-09  hitchhiker  1.391e-07  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0449  CDS  NC_009954  482871  486266  3396  DNA-directed RNA polymerase subunit B  YP_001540284  unclonable  4.90732e-06  normal  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0475  CDS  NC_009954  514215  514793  579  ZPR1-related zinc finger protein  YP_001540310  unclonable  1.08439e-12  hitchhiker  0.000534132  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0579  CDS  NC_009954  609356  610441  1086  GHMP kinase  YP_001540410  unclonable  4.95739e-11  decreased coverage  0.000433765  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0651  CDS  NC_009954  686836  687537  702  HhH-GPD family protein  YP_001540481  unclonable  1.24535e-11  normal  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0652  CDS  NC_009954  687614  689074  1461  glycoside hydrolase family protein  YP_001540482  unclonable  7.39457e-10  normal  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0710  CDS  NC_009954  744748  746613  1866  aldehyde ferredoxin oxidoreductase  YP_001540536  unclonable  3.1287e-09  unclonable  8.45227e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_0711  CDS  NC_009954  746623  747291  669  class II aldolase/adducin family protein  YP_001540537  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_1197  CDS  NC_009954  1259417  1262392  2976  isoleucyl-tRNA synthetase  YP_001541014  unclonable  1.65985e-06  hitchhiker  3.78196e-05  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_1261  CDS  NC_009954  1332917  1334425  1509  exsB protein  YP_001541078  unclonable  4.01588e-10  decreased coverage  6.45045e-10  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_1342  CDS  NC_009954  1416932  1419277  2346  DNA polymerase Pol2  YP_001541158  unclonable  2.27387e-08  normal  0.522725  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_1498  CDS  NC_009954  1576970  1577842  873  xylose isomerase domain-containing protein  YP_001541312  unclonable  1.76809e-11  normal  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_1511  CDS  NC_009954  1592062  1593135  1074  hypothetical protein  YP_001541325  unclonable  2.56098e-11  normal  0.496169  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Cmaq_1800  CDS  NC_009954  1876202  1877800  1599  glycerol kinase  YP_001541611  unclonable  7.39457e-10  normal  0.482844  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>