61 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Aave_0159  CDS  NC_008752  175361  177367  2007  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  YP_968545  normal  0.0741814  unclonable  3.22464e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_0940  CDS  NC_008752  1022791  1024431  1641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_969312  unclonable  9.58657e-07  normal  0.647876  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_1717  CDS  NC_008752  1877105  1877641  537  Arc domain-containing protein  YP_970078  decreased coverage  2.98141e-07  unclonable  1.00109e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_1718  CDS  NC_008752  1877991  1878941  951  hypothetical protein  YP_970079  hitchhiker  6.62496e-05  unclonable  1.24796e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_1719  CDS  NC_008752  1879411  1879734  324  hypothetical protein  YP_970080  hitchhiker  0.000173431  unclonable  8.61294e-09  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_1720  CDS  NC_008752  1879731  1880030  300  hypothetical protein  YP_970081  hitchhiker  0.000140414  unclonable  9.426e-09  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_1910  CDS  NC_008752  2066933  2068207  1275  hypothetical protein  YP_970268  unclonable  8.86145e-08  decreased coverage  0.000282496  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2241  CDS  NC_008752  2461328  2462938  1611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_970593  unclonable  6.11014e-07  hitchhiker  5.21325e-06  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2259  CDS  NC_008752  2485814  2486761  948  gluconolactonase  YP_970611  normal  0.0162749  unclonable  1.78231e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2260  CDS  NC_008752  2486779  2487849  1071  aldose 1-epimerase  YP_970612  hitchhiker  0.00420753  unclonable  1.81907e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2261  CDS  NC_008752  2487681  2492042  4362  hypothetical protein  YP_970613  normal  0.229571  unclonable  6.83365e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2262  CDS  NC_008752  2492143  2493699  1557  glutamate-cysteine ligase  YP_970614  normal  0.0149794  unclonable  1.42325e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2263  CDS  NC_008752  2493721  2495439  1719  thiamine pyrophosphate protein  YP_970615  unclonable  1.36096e-06  unclonable  1.6429e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2264  CDS  NC_008752  2495594  2496751  1158  hypothetical protein  YP_970616  unclonable  1.52095e-07  unclonable  1.48287e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2265  CDS  NC_008752  2496748  2497350  603  hypothetical protein  YP_970617  unclonable  1.16311e-08  hitchhiker  2.42252e-07  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2335  CDS  NC_008752  2562387  2563124  738  putative phage repressor  YP_970685  hitchhiker  0.00049871  unclonable  1.60936e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2336  CDS  NC_008752  2563204  2563464  261  hypothetical protein  YP_970686  hitchhiker  0.000126248  unclonable  1.32594e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2337  CDS  NC_008752  2563457  2563756  300  hypothetical protein  YP_970687  hitchhiker  0.000138283  unclonable  1.35301e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2338  CDS  NC_008752  2563756  2564112  357  hypothetical protein  YP_970688  hitchhiker  3.87966e-05  unclonable  1.42325e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2339  CDS  NC_008752  2564109  2565011  903  hypothetical protein  YP_970689  hitchhiker  4.44343e-05  unclonable  1.81907e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2340  CDS  NC_008752  2565005  2565796  792  hypothetical protein  YP_970690  decreased coverage  2.89954e-05  unclonable  1.85697e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2341    NC_008752  2565850  2566032  183      hitchhiker  0.000101278  unclonable  1.31248e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2342  CDS  NC_008752  2566025  2566282  258  hypothetical protein  YP_970691  hitchhiker  0.00011614  unclonable  1.29915e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2343  CDS  NC_008752  2566325  2567464  1140  hypothetical protein  YP_970692  normal  0.0268158  unclonable  2.15974e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2344  CDS  NC_008752  2567631  2568074  444  hypothetical protein  YP_970693  hitchhiker  0.00444987  unclonable  1.85697e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2345  CDS  NC_008752  2568279  2568785  507  hypothetical protein  YP_970694  hitchhiker  0.00537437  unclonable  2.01289e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2346  CDS  NC_008752  2568775  2569239  465  hypothetical protein  YP_970695  hitchhiker  0.00450599  unclonable  1.62621e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2347  CDS  NC_008752  2569236  2569499  264  hypothetical protein  YP_970696  hitchhiker  0.00243814  unclonable  1.48287e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2348  CDS  NC_008752  2569499  2569990  492  hypothetical protein  YP_970697  hitchhiker  0.0016319  unclonable  1.56083e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2349  CDS  NC_008752  2569990  2570307  318  hypothetical protein  YP_970698  hitchhiker  0.00258079  unclonable  1.56083e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2350  CDS  NC_008752  2570311  2570913  603  hypothetical protein  YP_970699  normal  0.0494504  unclonable  1.83812e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2351  CDS  NC_008752  2570987  2571313  327  hypothetical protein  YP_970700  normal  0.15574  unclonable  1.42325e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2352  CDS  NC_008752  2571459  2572127  669  hypothetical protein  YP_970701  normal  unclonable  1.74557e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2353  CDS  NC_008752  2572130  2573713  1584  putative terminase large subunit protein  YP_970702  normal  0.158978  unclonable  2.53606e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2354  CDS  NC_008752  2573787  2574209  423  hypothetical protein  YP_970703  normal  0.800105  unclonable  1.46781e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2355  CDS  NC_008752  2574196  2576535  2340  hypothetical protein  YP_970704  normal  0.512259  unclonable  4.18473e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2356  CDS  NC_008752  2576532  2577224  693  hypothetical protein  YP_970705  normal  0.0765973  unclonable  1.69328e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2357  CDS  NC_008752  2577221  2577643  423  hypothetical protein  YP_970706  normal  0.187401  unclonable  1.74557e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2358  CDS  NC_008752  2577649  2578029  381  hypothetical protein  YP_970707  normal  0.255904  unclonable  1.60936e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2359  CDS  NC_008752  2578016  2578429  414  hypothetical protein  YP_970708  normal  0.107687  unclonable  1.54434e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2360  CDS  NC_008752  2578644  2579156  513  hypothetical protein  YP_970709  normal  0.0425703  unclonable  1.54434e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2361  CDS  NC_008752  2579153  2579500  348  hypothetical protein  YP_970710  normal  0.0963888  unclonable  1.42325e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2362  CDS  NC_008752  2579595  2580242  648  hypothetical protein  YP_970711  normal  0.0896802  unclonable  1.51345e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2363  CDS  NC_008752  2580272  2581258  987  hypothetical protein  YP_970712  normal  0.240593  unclonable  1.93357e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2364  CDS  NC_008752  2581258  2581461  204  hypothetical protein  YP_970713  normal  0.154851  unclonable  1.3945e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2365  CDS  NC_008752  2581515  2582630  1116  hypothetical protein  YP_970714  normal  0.267971  unclonable  2.20383e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2366  CDS  NC_008752  2582666  2583124  459  hypothetical protein  YP_970715  normal  0.525857  unclonable  1.57717e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2367  CDS  NC_008752  2583203  2583574  372  hypothetical protein  YP_970716  normal  0.484006  unclonable  1.54434e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2368  CDS  NC_008752  2583581  2584201  621  hypothetical protein  YP_970717  normal  unclonable  1.76384e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2369  CDS  NC_008752  2584192  2584821  630  hypothetical protein  YP_970718  normal  unclonable  1.76384e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2370  CDS  NC_008752  2584893  2585309  417  hypothetical protein  YP_970719  normal  unclonable  1.3945e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2371  CDS  NC_008752  2585328  2586377  1050  hypothetical protein  YP_970720  normal  unclonable  2.11653e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2372  CDS  NC_008752  2586379  2588388  2010  hypothetical protein  YP_970721  normal  unclonable  3.29046e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2373  CDS  NC_008752  2588388  2588786  399  hypothetical protein  YP_970722  normal  0.288735  unclonable  1.72785e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2374  CDS  NC_008752  2588827  2591403  2577  hypothetical protein  YP_970723  normal  0.0196318  unclonable  5.06144e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2375  CDS  NC_008752  2591400  2593331  1932  hypothetical protein  YP_970724  hitchhiker  0.00246528  unclonable  3.74805e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2376  CDS  NC_008752  2593328  2593768  441  hypothetical protein  YP_970725  hitchhiker  3.44469e-06  unclonable  1.78231e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2377  CDS  NC_008752  2593960  2595000  1041  chromosome partitioning ATPase  YP_970726  unclonable  3.29135e-08  unclonable  2.36411e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2769  CDS  NC_008752  3043575  3044084  510  hypothetical protein  YP_971111  unclonable  8.78874e-09  normal  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_2770  CDS  NC_008752  3044123  3044515  393  hypothetical protein  YP_971112  unclonable  4.36346e-09  normal  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Aave_4106  CDS  NC_008752  4563618  4564685  1068  ATPase domain-containing protein  YP_972421  decreased coverage  1.14229e-06  unclonable  1.19877e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>