18 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Tgr7_0171  CDS  NC_011901  184786  187212  2427  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  YP_002512257  unclonable  2.89521e-05  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0502  CDS  NC_011901  536400  536819  420  Os01g0355500; hypothetical protein  YP_002512586  unclonable  2.43773e-07  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_1948  CDS  NC_011901  2069293  2069892  600  hypothetical protein  YP_002514016  unclonable  1.87906e-07  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_2405  CDS  NC_011901  2550145  2551347  1203  tyrosyl-tRNA synthetase  YP_002514470  unclonable  2.33958e-06  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_2406  CDS  NC_011901  2551412  2552965  1554  Peptidase M23  YP_002514471  unclonable  2.97595e-06  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_2780  CDS  NC_011901  2921657  2922667  1011  hypothetical protein  YP_002514841  unclonable  9.60474e-07  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_2781  CDS  NC_011901  2923165  2924232  1068  hypothetical protein  YP_002514842  unclonable  7.11113e-07  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_2782  CDS  NC_011901  2924645  2924926  282  hypothetical protein  YP_002514843  unclonable  9.31172e-08  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_2783  CDS  NC_011901  2924929  2925213  285  plasmid stabilization system  YP_002514844  unclonable  8.25631e-08  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_2784  CDS  NC_011901  2925347  2926366  1020  putative porin  YP_002514845  unclonable  6.3685e-07  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_2785    NC_011901  2926922  2927364  443      unclonable  1.47768e-07  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_2786  CDS  NC_011901  2927410  2927730  321  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  YP_002514846  unclonable  9.4081e-08  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_2787  CDS  NC_011901  2928234  2928590  357  hypothetical protein  YP_002514847  unclonable  1.22053e-07  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_2788  CDS  NC_011901  2928656  2929048  393  ribosomal protein S9  YP_002514848  unclonable  1.40519e-07  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_2789  CDS  NC_011901  2929108  2929536  429  50S ribosomal protein L13  YP_002514849  unclonable  1.37696e-07  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_2790  CDS  NC_011901  2930048  2930353  306  ferredoxin, 2Fe-2S  YP_002514850  unclonable  1.27071e-07  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_3240  CDS  NC_011901  3387069  3387959  891  Phosphoribulokinase  YP_002515295  unclonable  9.13358e-07  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_R0045  tRNA  NC_011901  2928129  2928202  74  tRNA-Gln    unclonable  5.00622e-08  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>