67 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Cyan7425_0266  CDS  NC_011884  68344  69024  681  protein of unknown function DUF820  YP_002481022  unclonable  1.32368e-06  decreased coverage  0.00423088  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0288  CDS  NC_011884  89856  93674  3819  replicative DNA helicase  YP_002481043  unclonable  0.00145922  normal  0.0196343  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0631  CDS  NC_011884  436554  437198  645  hypothetical protein  YP_002481380  unclonable  7.69552e-07  normal  0.221346  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0632  CDS  NC_011884  437290  437916  627  acyltransferase, putative  YP_002481381  unclonable  5.52746e-07  normal  0.226749  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0633  CDS  NC_011884  437863  438414  552  transposase  YP_002481382  unclonable  4.52222e-07  normal  0.45297  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0634  CDS  NC_011884  438428  438808  381  transposase  YP_002481383  unclonable  3.59175e-07  normal  0.423888  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_0861  CDS  NC_011884  682304  683836  1533  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  YP_002481608  unclonable  3.6456e-06  decreased coverage  1.14007e-06  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_1004  CDS  NC_011884  820997  821611  615  30S ribosomal protein S4  YP_002481751  unclonable  9.50762e-07  normal  0.0219645  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_1068  CDS  NC_011884  886341  887141  801  transposase IS4 family protein  YP_002481815  unclonable  3.19943e-06  unclonable  1.31837e-10  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_1069  CDS  NC_011884  887607  889583  1977  Carbohydrate-selective porin OprB  YP_002481816  unclonable  3.90313e-05  unclonable  2.85099e-10  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_1251  CDS  NC_011884  1090397  1091047  651  Methyltransferase type 11  YP_002481991  unclonable  4.94899e-07  normal  0.377886  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_1252  CDS  NC_011884  1091227  1091970  744  protein of unknown function DUF820  YP_002481992  unclonable  8.09595e-07  normal  0.287908  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_1416  CDS  NC_011884  1249745  1250362  618  protein of unknown function UPF0016  YP_002482150  unclonable  8.5126e-07  normal  0.0435338  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_1471  CDS  NC_011884  1311262  1311894  633  protein of unknown function DUF552  YP_002482202  unclonable  5.69683e-07  normal  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_1497  CDS  NC_011884  1333565  1335634  2070  ABC-1 domain protein  YP_002482228  unclonable  3.60105e-05  normal  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_1498  CDS  NC_011884  1335841  1336923  1083  photosystem q(b) protein  YP_002482229  unclonable  2.98258e-06  normal  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_1575  CDS  NC_011884  1420359  1422413  2055  histidine kinase  YP_002482306  unclonable  4.14678e-05  decreased coverage  7.4807e-06  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_1717  CDS  NC_011884  1557128  1559347  2220  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  YP_002482447  unclonable  4.10476e-05  hitchhiker  0.00177802  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_1734  CDS  NC_011884  1577055  1578089  1035  rod shape-determining protein MreB  YP_002482464  unclonable  5.50029e-06  normal  0.180064  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_1888  CDS  NC_011884  1773541  1775076  1536  Peptidase M23  YP_002482616  unclonable  8.47553e-06  normal  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_2214  CDS  NC_011884  2128191  2130122  1932  S-layer domain protein  YP_002482936  unclonable  9.00458e-06  normal  0.0461421  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_2265  CDS  NC_011884  2186514  2187077  564  hypothetical protein  YP_002482986  unclonable  7.61756e-07  normal  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_2266  CDS  NC_011884  2187092  2187745  654  hypothetical protein  YP_002482987  unclonable  9.4113e-07  normal  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_2433  CDS  NC_011884  2380435  2381193  759  hypothetical protein  YP_002483152  unclonable  1.996e-06  hitchhiker  9.66182e-07  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_2434  CDS  NC_011884  2381321  2382349  1029  chlorophyll a/b binding light-harvesting protein  YP_002483153  unclonable  3.46716e-06  hitchhiker  1.17955e-08  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_2435  CDS  NC_011884  2382932  2383954  1023  transport system permease protein  YP_002483154  hitchhiker  0.00130856  unclonable  5.8625e-10  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_2436  CDS  NC_011884  2383951  2384985  1035  transport system permease protein  YP_002483155  normal  0.237852  unclonable  5.41078e-10  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_2437  CDS  NC_011884  2385104  2386918  1815  ABC transporter related  YP_002483156  normal  unclonable  7.99452e-10  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_2620  CDS  NC_011884  2573135  2573632  498  hypothetical protein  YP_002483336  unclonable  1.13889e-06  normal  0.730297  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_2621  CDS  NC_011884  2573725  2574873  1149  integrase family protein  YP_002483337  unclonable  4.32273e-06  normal  0.433776  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_2704  CDS  NC_011884  2655525  2656568  1044  hypothetical protein  YP_002483412  unclonable  1.7343e-06  hitchhiker  2.44824e-09  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_2705  CDS  NC_011884  2656603  2657229  627  Peptidase M23  YP_002483413  unclonable  7.8524e-07  unclonable  8.57144e-11  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_2706  CDS  NC_011884  2657397  2658314  918  histone deacetylase superfamily  YP_002483414  hitchhiker  0.000210159  unclonable  1.20446e-10  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_2707  CDS  NC_011884  2658453  2659826  1374  serine/threonine protein kinase with FHA domain protein  YP_002483415  normal  0.0226952  unclonable  1.87188e-10  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_3125  CDS  NC_011884  3102471  3102698  228  hypothetical protein  YP_002483814  unclonable  3.55537e-07  normal  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_3126  CDS  NC_011884  3102753  3102905  153  hypothetical protein  YP_002483815  unclonable  3.38135e-07  normal  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_3127  CDS  NC_011884  3102988  3103728  741  hypothetical protein  YP_002483816  unclonable  1.22169e-06  normal  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_3128  CDS  NC_011884  3103958  3104317  360  hypothetical protein  YP_002483817  unclonable  6.42433e-07  normal  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_3129  CDS  NC_011884  3104646  3105062  417  hypothetical protein  YP_002483818  unclonable  7.8524e-07  normal  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_3130  CDS  NC_011884  3105149  3105310  162  hypothetical protein  YP_002483819  unclonable  4.94899e-07  normal  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_3131  CDS  NC_011884  3105322  3105804  483  hypothetical protein  YP_002483820  unclonable  9.70145e-07  normal  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_3195  CDS  NC_011884  3158032  3161409  3378  adenine specific DNA methyltransferase  YP_002483884  unclonable  0.000607783  normal  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_3263  CDS  NC_011884  3225749  3225877  129  hypothetical protein  YP_002483951  unclonable  4.34411e-07  normal  0.477079  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_3447  CDS  NC_011884  3399050  3399988  939  hypothetical protein  YP_002484132  unclonable  9.13149e-07  unclonable  2.79403e-10  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_3448  CDS  NC_011884  3400039  3400641  603  protein of unknown function DUF820  YP_002484133  hitchhiker  8.60534e-06  unclonable  2.24185e-10  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_3649  CDS  NC_011884  3624403  3625626  1224  4-hydroxy-3-methylbut-2-en-1-yl diphosphate synthase  YP_002484330  unclonable  2.5402e-06  normal  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_3650  CDS  NC_011884  3625751  3627031  1281  carboxyl-terminal protease  YP_002484331  unclonable  2.41587e-06  normal  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_4006  CDS  NC_011884  4038867  4039358  492  hypothetical protein  YP_002484681  unclonable  7.39108e-07  unclonable  1.31837e-10  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_4007  CDS  NC_011884  4039348  4040217  870  hypothetical protein  YP_002484682  unclonable  2.01643e-06  unclonable  1.4722e-10  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_4008  CDS  NC_011884  4040239  4040634  396  hypothetical protein  YP_002484683  hitchhiker  0.00151752  unclonable  1.20446e-10  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_4131  CDS  NC_011884  4179068  4179805  738  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  YP_002484806  unclonable  1.03032e-06  normal  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_4132  CDS  NC_011884  4179922  4181187  1266  S-adenosylmethionine synthetase  YP_002484807  unclonable  3.71992e-06  normal  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_4240  CDS  NC_011884  4296366  4297370  1005  phosphoribulokinase  YP_002484914  unclonable  3.29747e-06  hitchhiker  1.74575e-05  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_4241  CDS  NC_011884  4297580  4298815  1236  domain of unknown function DUF1745  YP_002484915  unclonable  4.32273e-06  hitchhiker  4.52646e-06  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_4247  CDS  NC_011884  4302428  4304317  1890  S-layer domain protein  YP_002484921  unclonable  1.42849e-05  unclonable  4.25549e-10  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_4400  CDS  NC_011884  4467567  4467932  366  hypothetical protein  YP_002485071  unclonable  5.05081e-07  normal  0.726686  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_4429  CDS  NC_011884  4502101  4503042  942  phosphoribulokinase  YP_002485100  unclonable  7.82103e-06  normal  0.086912  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_4514  CDS  NC_011884  4590865  4592208  1344  carboxyl-terminal protease  YP_002485185  unclonable  2.95237e-06  normal  0.684404  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_4519  CDS  NC_011884  4596028  4598472  2445  protein of unknown function DUF608  YP_002485190  unclonable  6.99051e-05  normal  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_4643  CDS  NC_011884  4725251  4726381  1131  glycosyl transferase group 1  YP_002485310  unclonable  1.7343e-06  normal  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_4644  CDS  NC_011884  4726625  4727023  399  hypothetical protein  YP_002485311  unclonable  2.90983e-07  normal  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_4754  CDS  NC_011884  4841592  4841804  213  hypothetical protein  YP_002485420  hitchhiker  0.00159897  unclonable  3.12004e-10  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_4755  CDS  NC_011884  4842135  4842944  810  hypothetical protein  YP_002485421  unclonable  2.67092e-06  unclonable  3.55384e-10  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_4756  CDS  NC_011884  4843938  4844138  201  hypothetical protein  YP_002485422  normal  0.0124756  unclonable  2.08991e-10  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_4789  CDS  NC_011884  4873557  4877138  3582  WD-40 repeat protein  YP_002485454  unclonable  0.00121677  normal  0.726129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_4822  CDS  NC_011884  4908325  4909407  1083  Squalene/phytoene synthase  YP_002485487  unclonable  1.93666e-06  normal  0.636776  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Cyan7425_5093  CDS  NC_011884  5186081  5186617  537  cob(I)yrinic acid a,c-diamide adenosyltransferase  YP_002485748  unclonable  7.8524e-07  normal  0.0403651  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>