31 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Bmul_0197  CDS  NC_010084  220876  221289  414  hypothetical protein  YP_001578389  normal  0.404878  unclonable  5.59374e-12  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_0198  CDS  NC_010084  221426  222010  585  phosphoheptose isomerase  YP_001578390  normal  0.435023  unclonable  5.88239e-12  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_0199  CDS  NC_010084  222028  222825  798  transport-associated protein  YP_001578391  normal  0.89233  unclonable  7.48386e-12  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_0200  CDS  NC_010084  222822  223193  372  cytochrome c class I  YP_001578392  normal  0.566136  unclonable  5.21394e-12  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_0201  CDS  NC_010084  223429  224826  1398  glucarate dehydratase  YP_001578393  normal  0.203534  unclonable  1.15228e-11  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_0202  CDS  NC_010084  224885  226225  1341  d-galactonate transporter  YP_001578394  normal  0.317635  unclonable  9.05697e-12  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_0203  CDS  NC_010084  226516  227151  636  hypothetical protein  YP_001578395  normal  0.847024  unclonable  6.31089e-12  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_0204  CDS  NC_010084  227176  228342  1167  hypothetical protein  YP_001578396  normal  0.20132  unclonable  8.111e-12  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_0205  CDS  NC_010084  228353  229507  1155  hypothetical protein  YP_001578397  normal  0.786669  unclonable  9.52284e-12  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_0206  CDS  NC_010084  229529  230227  699  ABC transporter related  YP_001578398  normal  0.922054  unclonable  7.713e-12  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_0207  CDS  NC_010084  230229  231431  1203  RND family efflux transporter MFP subunit  YP_001578399  normal  unclonable  1.00142e-11  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_0208  CDS  NC_010084  231742  232008  267  hypothetical protein  YP_001578400  normal  0.423236  unclonable  5.82295e-12  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_0209  CDS  NC_010084  232083  232823  741  hypothetical protein  YP_001578401  normal  0.121486  unclonable  7.11775e-12  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_0210  CDS  NC_010084  232938  233807  870  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  YP_001578402  normal  0.0476258  unclonable  7.87005e-12  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_0211  CDS  NC_010084  233884  234522  639  lysine exporter protein LysE/YggA  YP_001578403  hitchhiker  0.00252285  unclonable  6.76955e-12  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_0212  CDS  NC_010084  234598  235881  1284  major facilitator transporter  YP_001578404  hitchhiker  0.000448649  unclonable  1.15228e-11  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_0213  CDS  NC_010084  235979  236908  930  LysR family transcriptional regulator  YP_001578405  hitchhiker  7.18825e-11  unclonable  1.04245e-11  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_0214  CDS  NC_010084  237122  237955  834  OmpW family protein  YP_001578406  unclonable  1.52591e-12  unclonable  9.91303e-12  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_0215  CDS  NC_010084  237971  239218  1248  hypothetical protein  YP_001578407  hitchhiker  0.000119575  unclonable  1.18774e-11  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_0216  CDS  NC_010084  239359  240792  1434  hypothetical protein  YP_001578408  normal  0.0142102  unclonable  1.38018e-11  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_2204  CDS  NC_010084  2421137  2421460  324  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  YP_001580386  unclonable  7.66618e-14  normal  0.357698  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_2831  CDS  NC_010084  3083990  3085186  1197  cell division protein FtsZ  YP_001581012  unclonable  1.22218e-11  normal  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_2850  CDS  NC_010084  3114012  3114788  777  enoyl-CoA hydratase  YP_001581031  unclonable  1.04318e-12  normal  0.652493  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_3143  CDS  NC_010084  3435272  3436885  1614  glutamate--cysteine ligase  YP_001581324  normal  unclonable  8.27615e-12  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_3144  CDS  NC_010084  3437179  3438150  972  alcohol dehydrogenase  YP_001581325  hitchhiker  0.000700738  unclonable  5.53722e-12  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_3145  CDS  NC_010084  3438147  3439244  1098  AraC family transcriptional regulator  YP_001581326  hitchhiker  1.98948e-08  unclonable  6.12342e-12  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_3146  CDS  NC_010084  3439623  3440036  414  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_001581327  unclonable  4.51164e-14  unclonable  4.14135e-12  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_3165  CDS  NC_010086  9304  9771  468  hypothetical protein  YP_001583141  unclonable  1.04223e-16  normal  0.925717  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_R0003  tRNA  NC_010084  223294  223369  76  tRNA-Ala    normal  0.245807  unclonable  4.71702e-12  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_R0019  rRNA  NC_010084  1155520  1157045  1526  16S ribosomal RNA    unclonable  9.89523e-11  normal  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Bmul_R0028  tRNA  NC_010084  1342121  1342196  76  tRNA-Ala    unclonable  5.4137e-15  normal  0.608945  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>