105 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Ccel_0164  CDS  NC_011898  187761  188000  240  transcriptional regulator, AbrB family  YP_002504532  unclonable  6.9654e-11  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0165  CDS  NC_011898  188368  188955  588  nucleoside recognition domain protein  YP_002504533  unclonable  5.54794e-10  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0369  CDS  NC_011898  420696  420959  264  hypothetical protein  YP_002504734  unclonable  9.0387e-11  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0438  CDS  NC_011898  501546  503537  1992  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  YP_002504800  unclonable  5.30778e-07  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0442  CDS  NC_011898  507604  508362  759  30S ribosomal protein S2  YP_002504804  unclonable  5.1714e-10  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0450  CDS  NC_011898  513835  515121  1287  membrane-associated zinc metalloprotease  YP_002504812  unclonable  1.60258e-08  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0499  CDS  NC_011898  576490  580260  3771  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  YP_002504861  unclonable  0.000277776  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0500  CDS  NC_011898  580364  581164  801  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  YP_002504862  unclonable  1.06724e-09  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0501  CDS  NC_011898  581303  582103  801  hypothetical protein  YP_002504863  unclonable  1.20399e-09  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0513  CDS  NC_011898  592543  593412  870  Patatin  YP_002504875  unclonable  8.55028e-10  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0527  CDS  NC_011898  613548  615188  1641  SpoIID/LytB domain protein  YP_002504889  unclonable  9.20143e-08  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0528  CDS  NC_011898  615248  616612  1365  aspartate kinase  YP_002504890  unclonable  1.80899e-08  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0536  CDS  NC_011898  622362  623687  1326  protein-export membrane protein SecD  YP_002504898  unclonable  2.45038e-08  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0597  CDS  NC_011898  689346  689816  471  protein of unknown function DUF552  YP_002504958  unclonable  3.29372e-10  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0623  CDS  NC_011898  719243  721087  1845  hypothetical protein  YP_002504984  unclonable  5.04443e-07  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0699  CDS  NC_011898  807801  809684  1884  amino acid transporter-like protein  YP_002505058  unclonable  4.94308e-07  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0709  CDS  NC_011898  820611  821957  1347  signal recognition particle protein  YP_002505068  unclonable  3.38232e-08  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0739  CDS  NC_011898  860434  862464  2031  cellulosome protein dockerin type I  YP_002505097  unclonable  5.88173e-07  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0746  CDS  NC_011898  869844  872291  2448  copper-translocating P-type ATPase  YP_002505104  unclonable  1.16614e-05  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0749  CDS  NC_011898  874457  876088  1632  hydroxylamine reductase  YP_002505107  unclonable  1.13817e-07  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0750  CDS  NC_011898  876246  877142  897  glycoside hydrolase family 11  YP_002505108  unclonable  1.69346e-09  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0794  CDS  NC_011898  915262  915696  435  50S ribosomal protein L13  YP_002505152  unclonable  3.46357e-10  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0830  CDS  NC_011898  950124  950450  327  SH3 type 3 domain protein  YP_002505187  unclonable  1.24614e-10  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0831  CDS  NC_011898  950550  950801  252  hypothetical protein  YP_002505188  unclonable  7.54763e-11  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0832  CDS  NC_011898  950810  951505  696  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  YP_002505189  unclonable  7.73006e-10  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0845  CDS  NC_011898  963262  964020  759  Resolvase domain protein  YP_002505200  unclonable  6.78199e-10  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0846  CDS  NC_011898  964057  965040  984  hypothetical protein  YP_002505201  unclonable  2.77763e-09  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0897  CDS  NC_011898  1074607  1075968  1362  MATE efflux family protein  YP_002505249  unclonable  2.62958e-08  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0906  CDS  NC_011898  1083822  1084859  1038  hypothetical protein  YP_002505258  unclonable  1.36327e-08  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_1034  CDS  NC_011898  1287008  1287955  948  transcriptional regulator, DeoR family  YP_002505376  unclonable  3.16866e-09  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_1074  CDS  NC_011898  1328304  1329032  729  transcriptional regulator, GntR family  YP_002505413  unclonable  1.20399e-09  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_1147  CDS  NC_011898  1410226  1411071  846  Bacitracin resistance protein BacA  YP_002505484  unclonable  3.33302e-09  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_1238  CDS  NC_011898  1522660  1526028  3369  Carbohydrate binding family 6  YP_002505574  unclonable  0.000137164  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_1239  CDS  NC_011898  1526092  1529139  3048  Carbohydrate binding family 6  YP_002505575  unclonable  2.98242e-05  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_1249  CDS  NC_011898  1546692  1548752  2061  glycoside hydrolase family 9  YP_002505585  unclonable  2.27885e-06  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_1277  CDS  NC_011898  1580898  1581779  882  porphobilinogen deaminase  YP_002505613  unclonable  2.11617e-09  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_1298  CDS  NC_011898  1602832  1604265  1434  glycoside hydrolase family 8  YP_002505633  unclonable  4.71564e-08  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_1335  CDS  NC_011898  1634247  1634501  255  hypothetical protein  YP_002505669  unclonable  5.47457e-11  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_1373  CDS  NC_011898  1670929  1672866  1938  threonyl-tRNA synthetase  YP_002505707  unclonable  3.40223e-07  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_1374  CDS  NC_011898  1672973  1673401  429  hypothetical protein  YP_002505708  unclonable  3.10104e-10  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_1375  CDS  NC_011898  1673504  1674103  600  hypothetical protein  YP_002505709  unclonable  8.63864e-10  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_1376  CDS  NC_011898  1674323  1676107  1785  S-layer domain protein  YP_002505710  unclonable  5.47431e-07  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_1384  CDS  NC_011898  1682919  1684475  1557  ABC transporter related  YP_002505718  unclonable  7.21481e-08  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_1399  CDS  NC_011898  1699847  1702033  2187  DNA gyrase/topoisomerase IV subunit A  YP_002505733  unclonable  2.71013e-06  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_1462  CDS  NC_011898  1776537  1776962  426  thioesterase superfamily protein  YP_002505796  unclonable  2.24992e-10  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_1463  CDS  NC_011898  1777067  1777630  564  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  YP_002505797  unclonable  6.0117e-10  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_1643  CDS  NC_011898  1979837  1980799  963  inner-membrane translocator  YP_002505974  unclonable  3.13624e-09  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_1898  CDS  NC_011898  2254559  2255419  861  ATP-NAD/AcoX kinase  YP_002506226  unclonable  3.07238e-09  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_1981  CDS  NC_011898  2344037  2345404  1368  MATE efflux family protein  YP_002506309  unclonable  2.19259e-08  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2064  CDS  NC_011898  2422211  2423353  1143  cell division protein FtsZ  YP_002506390  unclonable  1.28315e-08  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2065  CDS  NC_011898  2423511  2424755  1245  cell division protein FtsA  YP_002506391  unclonable  1.82823e-08  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2078  CDS  NC_011898  2437671  2437940  270  Coat F domain protein  YP_002506403  unclonable  4.95082e-11  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2079  CDS  NC_011898  2437953  2438150  198  hypothetical protein  YP_002506404  unclonable  3.18495e-11  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2080  CDS  NC_011898  2438409  2439752  1344  potassium uptake protein, TrkH family  YP_002506405  unclonable  1.61963e-08  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2119  CDS  NC_011898  2483235  2486063  2829  excinuclease ABC, A subunit  YP_002506444  unclonable  1.68396e-05  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2135  CDS  NC_011898  2501237  2501734  498  protein of unknown function DUF177  YP_002506459  unclonable  6.07383e-10  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2136  CDS  NC_011898  2501858  2503051  1194  acetate kinase  YP_002506460  unclonable  2.19259e-08  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2222  CDS  NC_011898  2597164  2598099  936  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  YP_002506544  unclonable  9.08669e-10  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2358  CDS  NC_011898  2778025  2779227  1203  Ig domain protein group 2 domain protein  YP_002506672  unclonable  1.03831e-08  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2364  CDS  NC_011898  2784217  2788482  4266  S-layer domain protein  YP_002506677  unclonable  0.00153299  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2421  CDS  NC_011898  2923432  2923989  558  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  YP_002506731  unclonable  8.12868e-10  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2422  CDS  NC_011898  2924003  2924845  843  fumarate hydratase  YP_002506732  unclonable  4.32763e-09  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2423  CDS  NC_011898  2925069  2925452  384  UspA domain protein  YP_002506733  unclonable  2.66759e-10  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2442  CDS  NC_011898  2943945  2946557  2613  cellulosome protein dockerin type I  YP_002506751  unclonable  1.50479e-05  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2453  CDS  NC_011898  2962883  2964721  1839  histidine kinase  YP_002506762  unclonable  4.29093e-07  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2545  CDS  NC_011898  3069973  3071367  1395  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  YP_002506853  unclonable  2.9955e-08  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2558  CDS  NC_011898  3079822  3080622  801  septum site-determining protein MinD  YP_002506866  unclonable  1.69346e-09  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2789  CDS  NC_011898  3348169  3349281  1113  hypothetical protein  YP_002507067  unclonable  7.91032e-09  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2790  CDS  NC_011898  3349531  3349932  402  transcriptional regulator, XRE family  YP_002507068  unclonable  2.03467e-10  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2791  CDS  NC_011898  3349983  3350129  147  hypothetical protein  YP_002507069  unclonable  5.10303e-11  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2792  CDS  NC_011898  3350158  3350967  810  hypothetical protein  YP_002507070  unclonable  1.54726e-09  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2796  CDS  NC_011898  3353039  3354250  1212  hypothetical protein  YP_002507073  unclonable  1.82823e-08  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2797  CDS  NC_011898  3354392  3354706  315  hypothetical protein  YP_002507074  unclonable  9.22388e-11  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2852  CDS  NC_011898  3405055  3405807  753  AntA/AntB antirepressor domain protein  YP_002507126  unclonable  2.03262e-09  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2859  CDS  NC_011898  3411221  3412357  1137  hypothetical protein  YP_002507133  unclonable  7.59798e-09  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2860  CDS  NC_011898  3412350  3412673  324  rRNA biogenesis protein rrp5, putative  YP_002507134  unclonable  1.22113e-10  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2866  CDS  NC_011898  3416249  3417448  1200  Restriction endonuclease MspI  YP_002507140  unclonable  1.94297e-08  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2867  CDS  NC_011898  3417503  3418753  1251  DNA-cytosine methyltransferase  YP_002507141  unclonable  9.39229e-09  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2900  CDS  NC_011898  3456381  3457259  879  Hsp33 protein  YP_002507174  unclonable  1.74602e-09  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2901  CDS  NC_011898  3457410  3457610  201  cold-shock DNA-binding domain protein  YP_002507175  unclonable  5.81473e-11  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2921  CDS  NC_011898  3479544  3480287  744  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  YP_002507195  unclonable  8.90425e-10  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2940  CDS  NC_011898  3499733  3500530  798  NLP/P60 protein  YP_002507214  unclonable  1.04581e-09  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2941  CDS  NC_011898  3500650  3501402  753  cell wall hydrolase/autolysin  YP_002507215  unclonable  1.01461e-09  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_2997  CDS  NC_011898  3547922  3549310  1389  extracellular solute-binding protein family 1  YP_002507271  unclonable  3.66828e-08  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_3080  CDS  NC_011898  3617834  3618268  435  RNA binding S1 domain protein  YP_002507352  unclonable  2.20475e-10  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_3081  CDS  NC_011898  3618389  3618667  279  Septum formation initiator  YP_002507353  unclonable  1.12692e-10  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_3122  CDS  NC_011898  3658714  3659283  570  hypothetical protein  YP_002507393  unclonable  4.02523e-10  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_3185  CDS  NC_011898  3716111  3717286  1176  aminotransferase class I and II  YP_002507455  unclonable  1.14817e-08  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_3186  CDS  NC_011898  3717532  3718464  933  cysteine synthase A  YP_002507456  unclonable  2.13805e-09  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_3189  CDS  NC_011898  3720031  3721068  1038  biotin synthase  YP_002507459  unclonable  3.10414e-09  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_3190  CDS  NC_011898  3721141  3721512  372  protein of unknown function DUF1696  YP_002507460  unclonable  6.11457e-11  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_3227  CDS  NC_011898  3765304  3765996  693  RelA/SpoT domain protein  YP_002507497  unclonable  1.1111e-09  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_3231  CDS  NC_011898  3769904  3770458  555  BioY protein  YP_002507501  unclonable  2.66759e-10  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_3232  CDS  NC_011898  3770592  3771866  1275  hypothetical protein  YP_002507502  unclonable  1.80899e-08  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_3318  CDS  NC_011898  3860960  3862231  1272  integrase family protein  YP_002507587  unclonable  1.885e-08  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_3319  CDS  NC_011898  3862595  3863239  645  RNA polymerase factor sigma-70  YP_002507588  unclonable  4.96723e-10  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_3332  CDS  NC_011898  3875484  3876764  1281  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  YP_002507601  unclonable  1.60258e-08  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_3398  CDS  NC_011898  3942231  3945155  2925  hypothetical protein  YP_002507666  unclonable  3.54514e-05  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_3399  CDS  NC_011898  3945454  3948297  2844  hypothetical protein  YP_002507667  unclonable  2.80168e-05  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_3421  CDS  NC_011898  3975550  3976770  1221  peptidase M14 carboxypeptidase A  YP_002507689  unclonable  1.58618e-08  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>