17 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Swit_1539  CDS  NC_009511  1711586  1713793  2208  TonB-dependent receptor  YP_001262040  unclonable  2.17846e-11  hitchhiker  0.00247373  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_1656  CDS  NC_009511  1841254  1843548  2295  TonB-dependent receptor  YP_001262157  unclonable  3.45148e-11  decreased coverage  0.00188078  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_2180  CDS  NC_009511  2443984  2444475  492  hypothetical protein  YP_001262677  normal  0.0163358  unclonable  2.74139e-07  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_2181  CDS  NC_009511  2444536  2445246  711  hypothetical protein  YP_001262678  normal  0.104271  unclonable  2.88247e-07  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_2182  CDS  NC_009511  2445406  2446089  684  hypothetical protein  YP_001262679  normal  0.181107  unclonable  2.9708e-07  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_2183  CDS  NC_009511  2446153  2446428  276  plasmid maintenance system killer  YP_001262680  normal  0.454111  unclonable  2.58126e-07  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_3044  CDS  NC_009511  3339647  3341974  2328  TonB-dependent receptor  YP_001263532  decreased coverage  8.26445e-10  unclonable  1.13602e-06  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_3045  CDS  NC_009511  3342080  3343882  1803  monooxygenase, FAD-binding  YP_001263533  hitchhiker  0.000523244  unclonable  9.29922e-07  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_3046  CDS  NC_009511  3343931  3344827  897  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_001263534  normal  0.0342349  unclonable  6.41858e-07  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_3047  CDS  NC_009511  3344880  3345716  837  phytanoyl-CoA dioxygenase  YP_001263535  normal  0.158689  unclonable  6.48427e-07  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_3256  CDS  NC_009511  3584104  3586296  2193  TonB-dependent receptor  YP_001263740  unclonable  3.66625e-11  decreased coverage  7.30384e-05  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_3312  CDS  NC_009511  3641267  3643621  2355  TonB-dependent receptor  YP_001263796  unclonable  3.45148e-11  hitchhiker  6.7501e-06  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_3313  CDS  NC_009511  3643741  3644550  810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001263797  hitchhiker  6.6443e-10  unclonable  2.22131e-07  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_3314  CDS  NC_009511  3644559  3646973  2415  TonB-dependent receptor  YP_001263798  hitchhiker  2.57561e-05  unclonable  4.38861e-07  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_3471  CDS  NC_009511  3816688  3817311  624  hypothetical protein  YP_001263955  unclonable  1.50109e-14  unclonable  6.61648e-07  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_3472  CDS  NC_009511  3817319  3818386  1068  hypothetical protein  YP_001263956  hitchhiker  6.45952e-10  unclonable  7.76593e-07  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Swit_4173  CDS  NC_009511  4590627  4592918  2292  TonB-dependent receptor  YP_001264651  unclonable  1.21747e-10  normal  0.086797  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>