28 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Dvul_0235  CDS  NC_008751  288966  290699  +  1734  30S ribosomal protein S1  YP_965686  unclonable  0.00000120876  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0247  CDS  NC_008751  305103  305879  -  777  extracellular solute-binding protein  YP_965698  unclonable  0.0000000342463  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0277  CDS  NC_008751  347533  348036  -  504  OmpA/MotB domain-containing protein  YP_965727  unclonable  0.0000000132403  hitchhiker  0.000103139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0278  CDS  NC_008751  348236  349627  -  1392  WD40 domain-containing protein  YP_965728  hitchhiker  0.00000605867  unclonable  0.0000100324  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0279  CDS  NC_008751  349683  350348  -  666  TonB family protein  YP_965729  normal  0.219995  unclonable  0.00000796861  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_0678  CDS  NC_008751  841212  842396  -  1185  amidohydrolase  YP_966128  unclonable  0.000000231632  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_1187  CDS  NC_008751  1456065  1457321  +  1257  hypothetical protein  YP_966634  unclonable  0.000000236385  decreased coverage  0.000174597  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2176  CDS  NC_008751  2530073  2531473  +  1401  hypothetical protein  YP_967619  unclonable  0.000000312867  normal  1  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2321  CDS  NC_008751  2705772  2706638  +  867  hypothetical protein  YP_967764  unclonable  0.0000000630874  unclonable  0.0000139899  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2322  CDS  NC_008751  2706771  2708159  -  1389  FAD dependent oxidoreductase  YP_967765  hitchhiker  0.0000572952  unclonable  0.0000196984  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2323  CDS  NC_008751  2708439  2709776  -  1338  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  YP_967766  normal  0.123075  unclonable  0.0000172862  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2324  CDS  NC_008751  2710269  2711855  +  1587  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  YP_967767  normal  0.578416  unclonable  0.0000207214  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2325  CDS  NC_008751  2711870  2712436  +  567  hypothetical protein  YP_967768  normal  0.176439  unclonable  0.0000156265  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2326  CDS  NC_008751  2712448  2714871  +  2424  1A family penicillin-binding protein  YP_967769  normal  0.774073  unclonable  0.0000291309  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2327  CDS  NC_008751  2715036  2715488  +  453  cupin 2 domain-containing protein  YP_967770  normal  1  unclonable  0.0000139899  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2574  CDS  NC_008751  3005719  3006189  -  471  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  YP_968017  hitchhiker  0.00000346796  unclonable  0.0000116597  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2575  CDS  NC_008751  3006170  3006868  -  699  nuclease  YP_968018  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2576  CDS  NC_008751  3007289  3007885  +  597  hypothetical protein  YP_968019  hitchhiker  0.000123504  unclonable  0.0000129022  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2577  CDS  NC_008751  3008033  3009148  -  1116  radical SAM domain-containing protein  YP_968020  normal  0.014973  unclonable  0.0000162693  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2578    NC_008751  3009145  3010024  -  880      normal  0.04354  unclonable  0.0000132993  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2579  CDS  NC_008751  3010027  3010293  -  267  transposase IS3/IS911 family protein  YP_968021  normal  0.0712611  unclonable  0.0000116597  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2580  CDS  NC_008751  3010767  3011786  +  1020  KpsF/GutQ family protein  YP_968022  normal  0.597133  unclonable  0.0000162693  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2581  CDS  NC_008751  3012106  3012942  +  837  ABC-2 type transporter  YP_968023  normal  0.817053  unclonable  0.0000138463  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2582  CDS  NC_008751  3012939  3013604  +  666  ABC transporter related  YP_968024  normal  1  unclonable  0.0000122652  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2583  CDS  NC_008751  3013591  3014901  +  1311  capsule polysaccharide export protein-like protein  YP_968025  normal  1  unclonable  0.0000174654  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2584  CDS  NC_008751  3014906  3016723  +  1818  polysaccharide export protein  YP_968026  normal  1  unclonable  0.0000240824  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2585  CDS  NC_008751  3017332  3018435  +  1104  nucleotidyl transferase  YP_968027  normal  1  unclonable  0.0000196984  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Dvul_2909  CDS  NC_008751  3408444  3409370  +  927  GTP-binding protein Era  YP_968347  unclonable  0.0000000618187  normal  0.386752  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>