13 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Veis_0676  CDS  NC_008786  755779  757560  1782  hypothetical protein  YP_995476  unclonable  3.31835e-07  decreased coverage  0.00015571  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_1562  CDS  NC_008786  1747533  1748501  969  hypothetical protein  YP_996339  normal  unclonable  1.77519e-05  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_1563  CDS  NC_008786  1748507  1749589  1083  NAD/NADP octopine/nopaline dehydrogenase  YP_996340  normal  unclonable  1.58964e-05  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_1564  CDS  NC_008786  1749574  1749915  342  hypothetical protein  YP_996341  normal  unclonable  1.30098e-05  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_1565  CDS  NC_008786  1750522  1752081  1560  N-6 DNA methylase  YP_996342  normal  0.236926  unclonable  1.84799e-05  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_1566  CDS  NC_008786  1752078  1753289  1212  restriction modification system DNA specificity subunit  YP_996343  normal  0.0293394  unclonable  1.92379e-05  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_1567  CDS  NC_008786  1753286  1754356  1071  putative DNA-binding protein  YP_996344  normal  0.0208212  unclonable  1.60594e-05  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_1568  CDS  NC_008786  1754362  1757310  2949  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  YP_996345  normal  0.0336191  unclonable  2.49551e-05  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_1569  CDS  NC_008786  1757307  1757618  312  hypothetical protein  YP_996346  normal  0.184826  unclonable  1.16524e-05  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_1570  CDS  NC_008786  1757634  1758452  819  hypothetical protein  YP_996347  normal  0.553131  unclonable  1.35434e-05  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_3255  CDS  NC_008786  3629360  3632074  2715  hypothetical protein  YP_998003  unclonable  8.65942e-06  normal  0.0918503  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_3517  CDS  NC_008786  3889250  3889825  576  Type II site-specific deoxyribonuclease  YP_998255  unclonable  3.01458e-09  normal  0.451307  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Veis_3892  CDS  NC_008786  4283910  4284347  438  hypothetical protein  YP_998617  unclonable  2.75458e-09  normal  0.0124142  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>