24 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Bphy_0567  CDS  NC_010622  642761  642967  207  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  YP_001856804  unclonable  1.01913e-11  hitchhiker  0.000143899  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_1855  CDS  NC_010622  2120192  2120809  618  ATP dependent DNA ligase  YP_001858080  unclonable  8.4113e-11  hitchhiker  1.91097e-14  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_1856  CDS  NC_010622  2120849  2121064  216  YcfA family protein  YP_001858081  unclonable  1.14921e-11  unclonable  3.10223e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_1857  CDS  NC_010622  2121120  2121536  417  hypothetical protein  YP_001858082  unclonable  2.60993e-11  unclonable  3.98436e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_1858  CDS  NC_010622  2121909  2122289  381  hypothetical protein  YP_001858083  hitchhiker  5.72747e-09  unclonable  3.75184e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_2582  CDS  NC_010622  2904069  2917223  13155  YadA domain-containing protein  YP_001858800  normal  unclonable  2.93422e-11  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_2668  CDS  NC_010622  3009423  3010616  1194  cell division protein FtsZ  YP_001858886  unclonable  5.09241e-10  normal  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_2875  CDS  NC_010622  3229618  3230565  948  N-acetyl-gamma-glutamyl-phosphate reductase  YP_001859093  hitchhiker  5.50108e-08  unclonable  4.26492e-15  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_2876  CDS  NC_010622  3231130  3231786  657  lysine exporter protein LysE/YggA  YP_001859094  unclonable  5.4165e-11  unclonable  3.25534e-15  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3089  CDS  NC_010622  3468600  3469013  414  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_001859303  hitchhiker  5.07937e-09  unclonable  1.44798e-15  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3370  CDS  NC_010623  307971  308936  966  hypothetical protein  YP_001859570  unclonable  7.01469e-10  unclonable  2.10555e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3371  CDS  NC_010623  308936  309595  660  hypothetical protein  YP_001859571  hitchhiker  3.16339e-05  unclonable  1.45401e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3372  CDS  NC_010623  309684  310010  327  hypothetical protein  YP_001859572  hitchhiker  0.000709587  unclonable  1.05543e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3373  CDS  NC_010623  310206  310604  399  hypothetical protein  YP_001859573  hitchhiker  0.00189147  unclonable  1.30239e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3374  CDS  NC_010623  310622  311032  411  antirestriction protein  YP_001859574  hitchhiker  0.000803428  unclonable  1.57531e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3375  CDS  NC_010623  311041  311256  216  hypothetical protein  YP_001859575  hitchhiker  0.00112074  unclonable  1.09864e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_3984  CDS  NC_010623  961370  961702  333  hypothetical protein  YP_001860153  unclonable  1.63101e-11  normal  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_6047  CDS  NC_010625  590554  592149  1596  levansucrase  YP_001862155  unclonable  1.64133e-08  hitchhiker  2.66409e-06  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_6642  CDS  NC_010625  1235820  1236980  1161  porin  YP_001862716  unclonable  7.30188e-10  normal  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7133  CDS  NC_010625  1788988  1790667  1680  hypothetical protein  YP_001863180  unclonable  7.37025e-09  decreased coverage  3.53312e-07  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_7187  CDS  NC_010625  1839683  1839958  276  hypothetical protein  YP_001863234  unclonable  7.70139e-12  normal  0.990213  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_R0047  tRNA  NC_010622  1544904  1544979  76  tRNA-Glu    unclonable  6.69443e-12  normal  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_R0048  tRNA  NC_010622  1545046  1545122  77  tRNA-Asp    unclonable  6.11669e-12  normal  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Bphy_R0049  tRNA  NC_010622  1545199  1545274  76  tRNA-Glu    unclonable  6.56103e-12  normal  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>