39 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Sare_0001  CDS  NC_009953  148  1923  1776  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_001534928  hitchhiker  0.000633656  unclonable  2.92755e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0002  CDS  NC_009953  2705  3838  1134  DNA polymerase III, beta subunit  YP_001534929  hitchhiker  0.00244113  unclonable  1.86271e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0003  CDS  NC_009953  3877  4749  873  6-phosphogluconate dehydrogenase-like protein  YP_001534930  hitchhiker  0.00595784  unclonable  1.31137e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0004  CDS  NC_009953  4766  5896  1131  recombination protein F  YP_001534931  normal  0.366352  unclonable  1.75389e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0005  CDS  NC_009953  5889  6494  606  hypothetical protein  YP_001534932  normal  unclonable  1.27236e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_0006  CDS  NC_009953  6485  7066  582  hypothetical protein  YP_001534933  normal  unclonable  1.4647e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_1148  CDS  NC_009953  1298597  1299283  687  IclR family transcriptional regulator  YP_001536047  normal  0.554824  unclonable  3.76636e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_1149  CDS  NC_009953  1299333  1300778  1446  isopropylmalate isomerase large subunit  YP_001536048  normal  unclonable  5.97548e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_1150  CDS  NC_009953  1300794  1301381  588  isopropylmalate isomerase small subunit  YP_001536049  normal  unclonable  3.54633e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_1151  CDS  NC_009953  1301554  1302183  630  histone family protein DNA-binding protein  YP_001536050  normal  unclonable  3.47409e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_1152  CDS  NC_009953  1302306  1303196  891  NUDIX hydrolase  YP_001536051  normal  unclonable  3.96101e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_1153  CDS  NC_009953  1303338  1305647  2310  polyphosphate kinase  YP_001536052  normal  0.862565  unclonable  8.56651e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_1154  CDS  NC_009953  1305701  1305898  198  hypothetical protein  YP_001536053  normal  0.212488  unclonable  2.75653e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_1155  CDS  NC_009953  1305909  1306553  645  hypothetical protein  YP_001536054  normal  0.113394  unclonable  3.76636e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_1156  CDS  NC_009953  1306689  1307414  726  phospholipid/glycerol acyltransferase  YP_001536055  normal  0.255381  unclonable  4.37844e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_1157  CDS  NC_009953  1307411  1308409  999  glycerol-3-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  YP_001536056  normal  0.0724883  unclonable  4.65009e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_1158  CDS  NC_009953  1308406  1309527  1122  cystathionine gamma-lyase  YP_001536057  normal  0.0760832  unclonable  5.19282e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_1159  CDS  NC_009953  1309721  1309921  201  hypothetical protein  YP_001536058  normal  0.0339608  unclonable  3.43885e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_1160  CDS  NC_009953  1309926  1310771  846  helix-turn-helix domain-containing protein  YP_001536059  normal  0.190961  unclonable  4.84081e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_1161  CDS  NC_009953  1311055  1311273  219  hypothetical protein  YP_001536060  normal  0.462417  unclonable  3.47409e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_1162  CDS  NC_009953  1311600  1312682  1083  D-alanine--D-alanine ligase  YP_001536061  normal  unclonable  5.24603e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_1163  CDS  NC_009953  1312757  1313431  675  hypothetical protein  YP_001536062  normal  unclonable  3.2705e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_1164  CDS  NC_009953  1313441  1313674  234  AsnC family transcriptional regulator  YP_001536063  normal  unclonable  2.32378e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_1165  CDS  NC_009953  1313771  1314724  954  thiamine monophosphate kinase  YP_001536064  normal  unclonable  3.47409e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_1166  CDS  NC_009953  1314753  1315220  468  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_001536065  normal  0.486231  unclonable  2.37165e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_1167  CDS  NC_009953  1315307  1315498  192  50S ribosomal protein L28  YP_001536066  normal  0.422025  unclonable  2.08051e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_3343  CDS  NC_009953  3858662  3862942  4281  hypothetical protein  YP_001538137  unclonable  0.00184093  hitchhiker  0.000724597  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_5101  CDS  NC_009953  5775454  5776767  1314  GntR family transcriptional regulator  YP_001539834  normal  unclonable  3.07944e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_5102  CDS  NC_009953  5776775  5777758  984  D-alanine--D-alanine ligase  YP_001539835  normal  0.842129  unclonable  2.23224e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_5103  CDS  NC_009953  5777927  5778796  870  hypothetical protein  YP_001539836  normal  unclonable  2.37165e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_5104  CDS  NC_009953  5779538  5780545  1008  parB-like partition protein  YP_001539837  normal  unclonable  2.34759e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_5105  CDS  NC_009953  5780573  5781886  1314  cobyrinic acid ac-diamide synthase  YP_001539838  normal  unclonable  2.98727e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_5106  CDS  NC_009953  5782298  5783026  729  16S rRNA methyltransferase GidB  YP_001539839  normal  unclonable  2.03893e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_5107  CDS  NC_009953  5783115  5783702  588  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  YP_001539840  normal  unclonable  1.8818e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_5108  CDS  NC_009953  5783902  5784918  1017  60 kDa inner membrane insertion protein  YP_001539841  normal  0.3246  unclonable  2.18761e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_5109  CDS  NC_009953  5784922  5785209  288  hypothetical protein  YP_001539842  normal  0.107467  unclonable  1.43514e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_5110  CDS  NC_009953  5785206  5785610  405  ribonuclease P protein component  YP_001539843  normal  0.0820058  unclonable  1.44984e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_5111  CDS  NC_009953  5785647  5785784  138  50S ribosomal protein L34  YP_001539844  normal  0.0480023  unclonable  1.24693e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Sare_R0023  tRNA  NC_009953  1298413  1298485  73  tRNA-Glu    normal  0.294422  unclonable  3.04821e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>