62 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Fnod_0027    NC_009718  31579  32766  1188      unclonable  7.14263e-10  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0028  CDS  NC_009718  33078  33278  201  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  YP_001409557  unclonable  6.70362e-12  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0046  CDS  NC_009718  48483  49520  1038  chemotaxis-specific methylesterase  YP_001409574  unclonable  3.24346e-10  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0113  CDS  NC_009718  115724  116263  540  pyruvate/ketoisovalerate oxidoreductase, gamma subunit  YP_001409637  unclonable  8.76196e-11  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0114  CDS  NC_009718  116470  117618  1149  hypothetical protein  YP_001409638  unclonable  1.05969e-09  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0115  CDS  NC_009718  117717  118502  786  hypothetical protein  YP_001409639  unclonable  1.60092e-10  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0157  CDS  NC_009718  158176  161511  3336  permease YjgP/YjgQ family protein  YP_001409681  unclonable  6.84055e-05  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0439  CDS  NC_009718  477028  477288  261  stage V sporulation protein S  YP_001409961  unclonable  1.58934e-11  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0466  CDS  NC_009718  503082  503495  414  ferric uptake regulator family protein  YP_001409988  unclonable  1.90383e-11  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0467  CDS  NC_009718  503597  504100  504  rubrerythrin  YP_001409989  unclonable  2.49666e-11  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0468  CDS  NC_009718  504145  504501  357  desulfoferrodoxin ferrous iron-binding region  YP_001409990  unclonable  1.14138e-11  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0469  CDS  NC_009718  504573  505268  696  hypothetical protein  YP_001409991  unclonable  4.29599e-11  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0550  CDS  NC_009718  607557  608732  1176  glycosyl transferase family protein  YP_001410070  unclonable  1.02779e-09  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0551  CDS  NC_009718  608846  610069  1224  major facilitator transporter  YP_001410071  unclonable  1.14988e-09  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0552  CDS  NC_009718  610105  610335  231  hypothetical protein  YP_001410072  unclonable  5.76672e-12  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0553  CDS  NC_009718  610416  611738  1323  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  YP_001410073  unclonable  1.05969e-09  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0574  CDS  NC_009718  635508  635912  405  hypothetical protein  YP_001410090  unclonable  4.04361e-11  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0598  CDS  NC_009718  665999  667282  1284  major facilitator transporter  YP_001410110  unclonable  1.70409e-09  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0599  CDS  NC_009718  667466  668494  1029  peptidase M42 family protein  YP_001410111  unclonable  4.4001e-10  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0625  CDS  NC_009718  689547  690425  879  cytochrome b5  YP_001410137  unclonable  1.73616e-10  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0626  CDS  NC_009718  690704  691930  1227  extracellular solute-binding protein  YP_001410138  unclonable  8.92518e-10  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0676  CDS  NC_009718  737441  738646  1206  major facilitator transporter  YP_001410188  unclonable  1.2095e-09  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0735  CDS  NC_009718  798356  799390  1035  transcription elongation factor NusA  YP_001410247  unclonable  3.02084e-10  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0736  CDS  NC_009718  799431  799889  459  hypothetical protein  YP_001410248  unclonable  2.39746e-11  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0740  CDS  NC_009718  802790  803788  999  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, type I  YP_001410252  unclonable  3.97695e-10  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0741  CDS  NC_009718  804109  805053  945  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  YP_001410253  unclonable  2.78551e-10  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0781  CDS  NC_009718  858832  860019  1188  extracellular solute-binding protein  YP_001410291  unclonable  7.29506e-10  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0835  CDS  NC_009718  913832  914371  540  hypothetical protein  YP_001410345  unclonable  6.35204e-11  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0884  CDS  NC_009718  957804  959540  1737  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  YP_001410393  unclonable  2.2902e-08  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0950  CDS  NC_009718  1038417  1039529  1113  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase  YP_001410457  unclonable  3.51749e-10  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_0951  CDS  NC_009718  1039513  1041000  1488  putative membrane-associated zinc metalloprotease  YP_001410458  unclonable  2.74042e-09  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1007  CDS  NC_009718  1102616  1103977  1362  protease Do  YP_001410514  unclonable  2.15082e-09  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1008  CDS  NC_009718  1104257  1105336  1080  TPR repeat-containing protein  YP_001410515  unclonable  3.89173e-10  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1055  CDS  NC_009718  1150278  1151045  768  hypothetical protein  YP_001410561  unclonable  3.05289e-10  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1134  CDS  NC_009718  1221126  1221413  288  30S ribosomal protein S19  YP_001410638  unclonable  8.87938e-12  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1135  CDS  NC_009718  1221430  1222257  828  50S ribosomal protein L2  YP_001410639  unclonable  9.03374e-11  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1136  CDS  NC_009718  1222271  1222573  303  ribosomal protein L25/L23  YP_001410640  unclonable  7.19358e-12  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1137  CDS  NC_009718  1222570  1223241  672  50S ribosomal protein L4  YP_001410641  unclonable  8.24266e-11  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1138  CDS  NC_009718  1223349  1223972  624  50S ribosomal protein L3  YP_001410642  unclonable  8.58376e-11  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1139  CDS  NC_009718  1223993  1224301  309  30S ribosomal protein S10  YP_001410643  unclonable  3.05109e-11  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1140  CDS  NC_009718  1224401  1225603  1203  elongation factor Tu  YP_001410644  unclonable  1.9246e-09  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1141  CDS  NC_009718  1225673  1227748  2076  elongation factor G  YP_001410645  unclonable  1.61111e-07  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1142  CDS  NC_009718  1227802  1228269  468  30S ribosomal protein S7  YP_001410646  unclonable  5.63067e-11  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1143  CDS  NC_009718  1228285  1228689  405  30S ribosomal protein S12  YP_001410647  unclonable  3.69356e-11  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1208  CDS  NC_009718  1299403  1300395  993  cell envelope-related transcriptional attenuator  YP_001410712  unclonable  7.21845e-10  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1209  CDS  NC_009718  1300507  1302297  1791  molecular chaperone DnaK  YP_001410713  unclonable  2.15559e-08  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1238  CDS  NC_009718  1335468  1336247  780  30S ribosomal protein S2  YP_001410742  unclonable  3.41164e-10  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1265  CDS  NC_009718  1364471  1369030  4560  type II and III secretion system protein  YP_001410769  unclonable  0.00244048  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1468  CDS  NC_009718  1592010  1593119  1110  extracellular ligand-binding receptor  YP_001410968  unclonable  5.38626e-10  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1490  CDS  NC_009718  1618319  1619038  720  two component transcriptional regulator  YP_001410990  unclonable  1.20928e-10  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1525  CDS  NC_009718  1654000  1656777  2778  excinuclease ABC subunit A  YP_001411025  unclonable  2.67289e-06  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1724  CDS  NC_009718  1879706  1881031  1326  S-layer domain-containing protein  YP_001411216  unclonable  2.17367e-09  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1725  CDS  NC_009718  1881183  1882532  1350  hypothetical protein  YP_001411217  unclonable  1.46424e-09  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1726  CDS  NC_009718  1882696  1883991  1296  phosphopyruvate hydratase  YP_001411218  unclonable  1.27224e-09  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1729  CDS  NC_009718  1887297  1889144  1848  extracellular solute-binding protein  YP_001411221  unclonable  2.66848e-08  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1730  CDS  NC_009718  1889271  1889540  270  CopG/DNA-binding domain-containing protein  YP_001411222  unclonable  1.42301e-11  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1731  CDS  NC_009718  1889527  1889967  441  PilT domain-containing protein  YP_001411223  unclonable  3.08343e-11  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1732  CDS  NC_009718  1890025  1890225  201  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  YP_001411224  unclonable  1.01176e-11  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1733  CDS  NC_009718  1890385  1891062  678  HhH-GPD family protein  YP_001411225  unclonable  1.08213e-10  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_1762  CDS  NC_009718  1917465  1918559  1095  peptide chain release factor 2  YP_001411252  unclonable  5.12072e-10  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_R0024  tRNA  NC_009718  926951  927037  87  tRNA-Tyr    unclonable  2.91994e-12  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Fnod_R0025  tRNA  NC_009718  927069  927144  76  tRNA-Thr    unclonable  2.5626e-12  n/a    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>