20 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
PSPA7_0126  CDS  NC_009656  134256  135224  969  magnesium and cobalt transport protein CorA  YP_001345522  unclonable  0.000115284  n/a    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria 
 
 
-
 
PSPA7_0589  CDS  NC_009656  609983  610957  975  serine/threonine protein kinase  YP_001345984  unclonable  0.000122432  n/a    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria 
 
 
-
 
PSPA7_0809  CDS  NC_009656  805361  806560  1200  tyrosyl-tRNA synthetase  YP_001346204  unclonable  0.00020616  n/a    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria 
 
 
-
 
PSPA7_0851  CDS  NC_009656  839770  840339  570  30S ribosomal protein S8  YP_001346237  unclonable  5.83772e-05  n/a    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria 
 
 
-
 
PSPA7_1098  CDS  NC_009656  1096092  1097405  1314  hypothetical protein  YP_001346484  unclonable  0.000441733  n/a    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria 
 
 
-
 
PSPA7_1382  CDS  NC_009656  1396150  1396878  729  thiol:disulfide interchange protein DsbC  YP_001346766  unclonable  5.49688e-05  n/a    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria 
 
 
-
 
PSPA7_1623  CDS  NC_009656  1658142  1658534  393  lactoylglutathione lyase  YP_001347007  unclonable  2.16677e-05  n/a    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria 
 
 
-
 
PSPA7_1861  CDS  NC_009656  1900658  1901419  762  putative FkbP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  YP_001347242  unclonable  7.88133e-05  n/a    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria 
 
 
-
 
PSPA7_1863  CDS  NC_009656  1901790  1902221  432  hypothetical protein  YP_001347243  unclonable  4.73047e-05  n/a    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria 
 
 
-
 
PSPA7_2050  CDS  NC_009656  2086905  2087792  888  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  YP_001347423  unclonable  9.72456e-05  n/a    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria 
 
 
-
 
PSPA7_2301  CDS  NC_009656  2357079  2357330  252  outer membrane lipoprotein OprI precursor  YP_001347672  unclonable  2.51822e-05  n/a    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria 
 
 
-
 
PSPA7_2302  tRNA  NC_009656  2357741  2357832  92  tRNA-Ser    unclonable  1.77345e-05  n/a    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria 
 
 
-
 
PSPA7_2339  CDS  NC_009656  2391292  2392872  1581  aminoglycoside response regulator  YP_001347706  unclonable  0.000320511  n/a    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria 
 
 
-
 
PSPA7_2375  CDS  NC_009656  2420133  2421044  912  hypothetical protein  YP_001347742  unclonable  0.000173875  n/a    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria 
 
 
-
 
PSPA7_4352  CDS  NC_009656  4483177  4483290  114  hypothetical protein  YP_001349705  unclonable  2.3712e-05  n/a    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria 
 
 
-
 
PSPA7_4848  CDS  NC_009656  4988733  4989962  1230  exonuclease SbcD  YP_001350184  unclonable  0.000186512  n/a    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria 
 
 
-
 
PSPA7_5214  CDS  NC_009656  5360674  5361162  489  hypothetical protein  YP_001350546  unclonable  3.10717e-05  n/a    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria 
 
 
-
 
PSPA7_5215  CDS  NC_009656  5361335  5361616  282  hypothetical protein  YP_001350547  unclonable  2.12353e-05  n/a    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria 
 
 
-
 
PSPA7_5373  CDS  NC_009656  5535652  5536086  435  bacteriophage Pf1 helix destabilizing protein  YP_001350703  unclonable  3.33298e-05  n/a    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria 
 
 
-
 
PSPA7_6155  CDS  NC_009656  6359182  6360498  1317  MFS family transporter  YP_001351466  unclonable  0.000158885  n/a    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>