51 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
HY04AAS1_0054  CDS  NC_011126  48367  49437  1071  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  YP_002120724  unclonable  2.50606e-13  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0103  CDS  NC_011126  96036  97595  1560  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  YP_002120773  unclonable  1.50576e-11  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0132  CDS  NC_011126  118794  119132  339  nitrogen regulatory protein P-II  YP_002120802  unclonable  1.99717e-15  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0186  CDS  NC_011126  165861  166052  192  transcriptional antiterminator, BglG  YP_002120856  unclonable  2.4901e-15  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0187  CDS  NC_011126  166140  166517  378  hypothetical protein  YP_002120857  unclonable  7.51184e-15  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0253  CDS  NC_011126  224187  224924  738  NusG antitermination factor  YP_002120921  unclonable  1.16635e-13  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0254  CDS  NC_011126  224935  225372  438  50S ribosomal protein L11  YP_002120922  unclonable  1.49943e-14  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0260  CDS  NC_011126  236341  236748  408  30S ribosomal protein S12  YP_002120928  unclonable  2.00867e-14  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0275  CDS  NC_011126  245845  246210  366  50S ribosomal protein L14  YP_002120943  unclonable  4.28064e-15  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0287  CDS  NC_011126  251827  252600  774  methionine aminopeptidase, type I  YP_002120955  unclonable  3.63229e-14  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0288  CDS  NC_011126  252602  252844  243  translation initiation factor IF-1  YP_002120956  unclonable  1.07247e-15  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0289  CDS  NC_011126  252854  252967  114  ribosomal protein L36  YP_002120957  unclonable  4.62447e-16  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0290  CDS  NC_011126  252982  253362  381  30S ribosomal protein S13  YP_002120958  unclonable  3.53572e-15  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0291  CDS  NC_011126  253375  253767  393  30S ribosomal protein S11  YP_002120959  unclonable  6.93018e-15  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0307  CDS  NC_011126  265542  268358  2817  molybdopterin oxidoreductase  YP_002120975  unclonable  5.12628e-08  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0319  CDS  NC_011126  278070  279551  1482  hypothetical protein  YP_002120987  unclonable  6.84718e-12  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0339  CDS  NC_011126  297010  298656  1647  Hydroxylamine reductase  YP_002121007  unclonable  3.73839e-11  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0352  CDS  NC_011126  310247  311593  1347  hypothetical protein  YP_002121020  unclonable  2.57502e-12  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0450  CDS  NC_011126  392645  393103  459  single-strand binding protein  YP_002121118  unclonable  6.2046e-15  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0619  CDS  NC_011126  552746  554767  2022  TonB-dependent receptor  YP_002121284  unclonable  4.12727e-10  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0644  CDS  NC_011126  578310  579041  732  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  YP_002121309  unclonable  3.86152e-14  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0680  CDS  NC_011126  610872  612188  1317  tRNA modification GTPase TrmE  YP_002121345  unclonable  1.80906e-12  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0718  CDS  NC_011126  653955  656009  2055  K+-transporting ATPase, B subunit  YP_002121383  unclonable  2.20331e-10  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0735  CDS  NC_011126  670248  670685  438  heat shock protein Hsp20  YP_002121400  unclonable  3.7192e-15  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0743  CDS  NC_011126  676669  677175  507  histidine triad (HIT) protein  YP_002121408  unclonable  1.20261e-14  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0744  CDS  NC_011126  677218  677421  204  30S ribosomal protein S21  YP_002121409  unclonable  9.79578e-16  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0794  CDS  NC_011126  734922  736343  1422  Carbohydrate-selective porin OprB  YP_002121459  unclonable  4.21873e-12  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0795  CDS  NC_011126  736560  738059  1500  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  YP_002121460  unclonable  7.74883e-12  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0798  CDS  NC_011126  739728  740498  771  TraT complement resistance family protein  YP_002121463  unclonable  4.91779e-14  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0823  CDS  NC_011126  764311  765729  1419  Cytochrome-c oxidase  YP_002121488  unclonable  4.3936e-12  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0824  CDS  NC_011126  765742  766632  891  cytochrome c class I  YP_002121489  unclonable  7.80419e-14  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0927  CDS  NC_011126  874553  875404  852  tRNA pseudouridine synthase B  YP_002121592  unclonable  2.24094e-13  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0936  CDS  NC_011126  881696  882997  1302  ammonium transporter  YP_002121601  unclonable  3.77465e-12  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0937  CDS  NC_011126  883019  884164  1146  hypothetical protein  YP_002121602  unclonable  1.17538e-12  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0938  CDS  NC_011126  884197  884328  132  putative diguanylate phosphodiesterase  YP_002121603  unclonable  1.16247e-15  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0939  CDS  NC_011126  884469  885818  1350  hypothetical protein  YP_002121604  unclonable  4.62454e-12  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0960  CDS  NC_011126  900156  901493  1338  hypothetical protein  YP_002121625  unclonable  7.66698e-12  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0966  CDS  NC_011126  904765  905385  621  MotA/TolQ/ExbB proton channel  YP_002121631  unclonable  2.71628e-14  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_0984  CDS  NC_011126  921448  922185  738  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG  YP_002121648  unclonable  6.19324e-14  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_1007  CDS  NC_011126  942311  942745  435  ribosomal protein L13  YP_002121671  unclonable  1.49943e-14  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_1051  CDS  NC_011126  981959  982228  270  histone family protein DNA-binding protein  YP_002121715  unclonable  4.97636e-15  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_1052  CDS  NC_011126  982287  982739  453  hypothetical protein  YP_002121716  unclonable  2.03128e-14  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_1261  CDS  NC_011126  1167353  1168873  1521  hypothetical protein  YP_002121924  unclonable  2.14476e-11  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_1359  CDS  NC_011126  1272330  1273739  1410  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  YP_002122022  unclonable  4.9629e-12  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_1403  CDS  NC_011126  1317147  1319024  1878  molecular chaperone DnaK  YP_002122066  unclonable  2.03004e-10  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_1508  CDS  NC_011126  1422974  1423195  222  hypothetical protein  YP_002122169  unclonable  1.31146e-15  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_1533  CDS  NC_011126  1449410  1449961  552  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  YP_002122194  unclonable  1.81643e-14  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_1583  CDS  NC_011126  1500292  1502709  2418  phosphoenolpyruvate synthase  YP_002122242  unclonable  5.80674e-09  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_1614  CDS  NC_011126  1534243  1535238  996  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  YP_002122273  unclonable  2.35869e-13  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_1615  CDS  NC_011126  1535226  1536122  897  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  YP_002122274  unclonable  1.31585e-13  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
HY04AAS1_1630  CDS  NC_011126  1549626  1550447  822  hypothetical protein  YP_002122289  unclonable  1.64262e-13  n/a    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>