64 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Hore_00510  CDS  NC_011899  56965  59133  2169  RNA binding S1 domain protein  YP_002507807  unclonable  2.09068e-13  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00520  CDS  NC_011899  59206  59580  375  RNA binding S1 domain protein  YP_002507808  unclonable  6.85433e-19  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00590  CDS  NC_011899  68192  69574  1383  Sodium:solute symporter  YP_002507815  unclonable  1.30807e-15  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00880  CDS  NC_011899  106731  108086  1356  DNA repair protein RadA  YP_002507844  unclonable  1.21912e-15  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_01030  CDS  NC_011899  120826  121026  201  preprotein translocase, SecE subunit  YP_002507859  unclonable  2.89094e-19  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_01040  CDS  NC_011899  121067  121597  531  NusG antitermination factor  YP_002507860  unclonable  2.96245e-18  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_01050  CDS  NC_011899  121626  122048  423  ribosomal protein L11  YP_002507861  unclonable  1.27734e-18  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_01060  CDS  NC_011899  122123  122830  708  ribosomal protein L1  YP_002507862  unclonable  8.74523e-18  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_01140  CDS  NC_011899  132890  134959  2070  translation elongation factor G  YP_002507870  unclonable  7.11404e-14  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_01150  CDS  NC_011899  134987  136180  1194  elongation factor Tu  YP_002507871  unclonable  7.58645e-17  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_02300  CDS  NC_011899  236182  238194  2013  DNA ligase, NAD-dependent  YP_002507986  unclonable  1.39643e-13  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_05390  CDS  NC_011899  586610  586741  132  hypothetical protein  YP_002508292  unclonable  3.42806e-19  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_05480  CDS  NC_011899  596826  598409  1584  DEAD/DEAH box helicase domain protein  YP_002508300  unclonable  4.71221e-15  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_05490  CDS  NC_011899  598545  598751  207  putative cold-shock DNA-binding domain protein  YP_002508301  unclonable  3.94484e-19  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_05500  CDS  NC_011899  599086  600315  1230  putative transcriptional regulator, MerR family  YP_002508302  unclonable  2.97959e-16  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_05560  CDS  NC_011899  606317  606922  606  hypothetical protein  YP_002508308  unclonable  1.15855e-17  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_05570  CDS  NC_011899  607023  607199  177  hypothetical protein  YP_002508309  unclonable  6.99569e-19  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_05580  CDS  NC_011899  607292  609232  1941  Threonyl-tRNA synthetase  YP_002508310  unclonable  5.88041e-14  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_05880  CDS  NC_011899  641956  642645  690  cell wall hydrolase SleB  YP_002508340  unclonable  1.84059e-17  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_05890  CDS  NC_011899  642724  642966  243  transcriptional regulator, AbrB family  YP_002508341  unclonable  5.83606e-19  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_06520  CDS  NC_011899  707243  707818  576  hypothetical protein  YP_002508404  unclonable  7.7531e-18  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_06620  CDS  NC_011899  717803  718468  666  glycosyl transferase family 2  YP_002508414  unclonable  1.74936e-17  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_06630  CDS  NC_011899  718472  719224  753  hypothetical protein  YP_002508415  unclonable  2.80482e-17  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_07290  CDS  NC_011899  789345  790679  1335  signal recognition particle protein  YP_002508481  unclonable  5.3957e-16  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_07300  CDS  NC_011899  790714  790980  267  ribosomal protein S16  YP_002508482  unclonable  5.83606e-19  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_07310  CDS  NC_011899  790995  791222  228  nucleic acid binding protein, containing KH domain  YP_002508483  unclonable  4.97111e-19  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_08870  CDS  NC_011899  955560  956015  456  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  YP_002508638  unclonable  1.67396e-18  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_08880  CDS  NC_011899  956038  957216  1179  aminotransferase class V  YP_002508639  unclonable  2.80371e-16  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_09490  CDS  NC_011899  1024430  1025704  1275  extracellular solute-binding protein family 1  YP_002508700  unclonable  2.48456e-16  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_10080  CDS  NC_011899  1098454  1098684  231  ribosomal protein L28  YP_002508759  unclonable  8.81205e-19  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_11900  CDS  NC_011899  1284645  1285214  570  2'-5' RNA ligase  YP_002508935  unclonable  5.56695e-18  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_12880  CDS  NC_011899  1382678  1382941  264  ribosomal protein S20  YP_002509033  unclonable  4.40535e-19  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_12890  CDS  NC_011899  1383066  1384079  1014  DNA polymerase III, delta subunit  YP_002509034  unclonable  6.02263e-17  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_14170  CDS  NC_011899  1505466  1506605  1140  cell cycle protein  YP_002509161  unclonable  5.73666e-16  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_14280  CDS  NC_011899  1514931  1515941  1011  ApbE family lipoprotein  YP_002509172  unclonable  3.71424e-17  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_14290  CDS  NC_011899  1515925  1516344  420  hypothetical protein  YP_002509173  unclonable  8.90798e-19  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_14300  CDS  NC_011899  1516638  1517633  996  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  YP_002509174  unclonable  4.06573e-17  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_14700  CDS  NC_011899  1564409  1565032  624  transcriptional regulator, TetR family  YP_002509214  unclonable  3.73009e-18  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_15440  CDS  NC_011899  1652667  1654118  1452  Glutamate mutase subunit E  YP_002509288  unclonable  2.46977e-15  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_15450  CDS  NC_011899  1654132  1655526  1395  conserved hypothetical protein TIGR01319  YP_002509289  unclonable  2.32195e-15  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_15760  CDS  NC_011899  1687724  1689682  1959  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  YP_002509320  unclonable  5.21315e-14  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_16320  CDS  NC_011899  1754569  1755336  768  Transcriptional regulator IclR  YP_002509376  unclonable  7.446e-18  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_16330  CDS  NC_011899  1755447  1756313  867  L-serine ammonia-lyase, alpha subunit  YP_002509377  unclonable  1.59813e-17  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_16440  CDS  NC_011899  1766491  1769028  2538  preprotein translocase, SecA subunit  YP_002509388  unclonable  2.73245e-12  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_16450  CDS  NC_011899  1769252  1770889  1638  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  YP_002509389  unclonable  1.01373e-14  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_16460  CDS  NC_011899  1771183  1771737  555  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  YP_002509390  unclonable  6.80231e-18  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_16470  CDS  NC_011899  1772081  1772284  204  putative cold-shock DNA-binding domain protein  YP_002509391  unclonable  8.46303e-19  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_16480  CDS  NC_011899  1772401  1773132  732  amidophosphoribosyltransferase  YP_002509392  unclonable  2.58809e-17  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_18380  CDS  NC_011899  1963189  1964052  864  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  YP_002509582  unclonable  1.26924e-17  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_18390  CDS  NC_011899  1964076  1964426  351  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  YP_002509583  unclonable  4.40535e-19  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_18400  CDS  NC_011899  1964583  1965419  837  beta-lactamase domain protein  YP_002509584  unclonable  1.03744e-17  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_18770  CDS  NC_011899  2005123  2005857  735  extracellular solute-binding protein family 3  YP_002509621  unclonable  1.74936e-17  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_18780  CDS  NC_011899  2006060  2007535  1476  glutamyl-tRNA synthetase  YP_002509622  unclonable  2.57278e-15  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_19990  CDS  NC_011899  2155646  2156623  978  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  YP_002509741  unclonable  9.09791e-17  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_20780  CDS  NC_011899  2246010  2246318  309  conserved hypothetical protein TIGR00103  YP_002509818  unclonable  8.81205e-19  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_20790  CDS  NC_011899  2246334  2248100  1767  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  YP_002509819  unclonable  1.5496e-14  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_20800  CDS  NC_011899  2248850  2249329  480  tRNA-adenosine deaminase  YP_002509820  unclonable  2.3528e-18  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_21250  CDS  NC_011899  2314936  2315856  921  hypothetical protein  YP_002509865  unclonable  2.05547e-17  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_21260  CDS  NC_011899  2315925  2316182  258  SpoVG family protein  YP_002509866  unclonable  2.58874e-19  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_21270  CDS  NC_011899  2316213  2317259  1047  AIR synthase related protein domain protein  YP_002509867  unclonable  5.0242e-17  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_R0063  tRNA  NC_011899  2248661  2248754  94  tRNA-Ser    unclonable  1.63155e-19  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_R0064  tRNA  NC_011899  2248781  2248873  93  tRNA-Ser    unclonable  1.59858e-19  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_R0065  tRNA  NC_011899  2249379  2249455  77  tRNA-Arg    unclonable  1.68192e-19  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_R0085  ncRNA  NC_011899  2248395  2248497  103      unclonable  1.917e-19  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>