13 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Pnap_0330  CDS  NC_008781  334415  334783  369  50S ribosomal protein L14  YP_980574  unclonable  1.52451e-08  hitchhiker  0.00105962  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0650  CDS  NC_008781  688495  689604  1110  porin  YP_980890  unclonable  3.49197e-07  normal  0.162286  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0657  CDS  NC_008781  696891  698540  1650  chaperonin GroEL  YP_980897  unclonable  1.138e-06  decreased coverage  0.00270634  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_0658  CDS  NC_008781  698644  698934  291  co-chaperonin GroES  YP_980898  unclonable  9.33767e-09  decreased coverage  0.00156326  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_1613  CDS  NC_008781  1700324  1701325  1002  histone deacetylase superfamily protein  YP_981848  unclonable  1.52208e-07  normal  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_1781  CDS  NC_008781  1893611  1896340  2730  pyruvate dehydrogenase subunit E1  YP_982012  unclonable  0.000127285  decreased coverage  0.000322845  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_2237  CDS  NC_008781  2388552  2388932  381  hypothetical protein  YP_982466  unclonable  3.64101e-08  unclonable  1.19533e-10  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_2291  CDS  NC_008781  2432256  2432792  537  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  YP_982520  unclonable  4.27362e-08  normal  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_2732  CDS  NC_008781  2878069  2878350  282  hypothetical protein  YP_982955  unclonable  2.12095e-08  normal  0.0124813  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_2789  CDS  NC_008781  2932409  2933041  633  OmpA/MotB domain-containing protein  YP_983012  unclonable  2.6968e-08  hitchhiker  0.00127263  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_2963  CDS  NC_008781  3126737  3128818  2082  ATP-dependent DNA helicase RecQ  YP_983183  unclonable  9.79868e-06  decreased coverage  0.000575313  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_3412  CDS  NC_008781  3617374  3618558  1185  cell division protein FtsZ  YP_983630  unclonable  6.69167e-07  normal  0.43069  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4472  CDS  NC_008758  34170  34868  699  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  YP_973490  unclonable  1.16025e-11  unclonable  2.19652e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>