68 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CCV52592_0003  CDS  NC_009715  1646451  1647977  1527  flavocytochrome c flavin subunit  YP_001408896  unclonable  6.66036e-06  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_0045  CDS  NC_009715  1859231  1859500  270  hypothetical protein  YP_001409098  unclonable  7.40111e-08  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_0100  CDS  NC_009715  119367  119879  513  N-terminal methylation domain-containing protein  YP_001407421  unclonable  2.52609e-07  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_0285  CDS  NC_009715  1301421  1302143  723  hypothetical protein  YP_001408560  unclonable  5.17518e-07  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_0329  CDS  NC_009715  90831  91349  519  translation initiation factor IF-3  YP_001407385  unclonable  3.59846e-07  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_0355  CDS  NC_009715  1532956  1535667  2712  translation initiation factor IF-2  YP_001408785  unclonable  0.000123126  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_0370  CDS  NC_009715  1521005  1521709  705  flagellar biosynthesis sigma factor  YP_001408770  unclonable  1.82906e-07  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_0376  CDS  NC_009715  304580  305071  492  flavodoxin FldA  YP_001407592  unclonable  1.40694e-07  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_0433  CDS  NC_009715  1693059  1694999  1941  fumarate hydratase class II (fumarase C)  YP_001408939  unclonable  1.3758e-05  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_0438  CDS  NC_009715  654052  655347  1296  glutamylglutaminyl-tRNA synthetase  YP_001407923  unclonable  3.82192e-06  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_0551    NC_009715  1713148  1713606  459      unclonable  9.71364e-08  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_0735    NC_009715  108000  108842  843      unclonable  4.10197e-07  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_0815  CDS  NC_009715  198590  199603  1014  iron ABC transporter, solute-binding protein  YP_001407490  unclonable  2.12424e-06  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_0923  CDS  NC_009715  1422180  1422611  432  TerC protein  YP_001408673  unclonable  1.73903e-07  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_0924  CDS  NC_009715  1422611  1423078  468  hypothetical protein  YP_001408674  unclonable  1.55714e-07  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1001  CDS  NC_009715  1911396  1912559  1164  aminotransferase, class II  YP_001409172  unclonable  1.56908e-06  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1002  CDS  NC_009715  1879954  1881252  1299  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  YP_001409125  unclonable  2.28048e-06  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1032  CDS  NC_009715  1896052  1896630  579  50S ribosomal protein L3  YP_001409153  unclonable  3.12086e-07  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1038  CDS  NC_009715  342302  343777  1476  hydrogenase-4 component F  YP_001407622  unclonable  4.18597e-06  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1044  CDS  NC_009715  374689  376149  1461  phosphoglyceromutase  YP_001407650  unclonable  4.97143e-06  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1077  CDS  NC_009715  974339  979492  5154  alpha-2-macroglobulin family protein  YP_001408245  unclonable  0.0094392  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1100    NC_009715  1001057  1002892  1836      unclonable  1.78966e-05  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1101  CDS  NC_009715  1537264  1538148  885  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase  YP_001408787  unclonable  3.21898e-07  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1173  CDS  NC_009715  468936  470672  1737  alpha/beta hydrolase fold  YP_001407745  unclonable  1.96015e-05  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1223  CDS  NC_009715  419382  420719  1338  UDP-glucose 6-dehydrogenase  YP_001407697  unclonable  2.60089e-06  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1250  CDS  NC_009715  392770  393645  876  putative nicotinate (nicotinamide) nucleotide adenylyltransferase  YP_001407671  unclonable  9.86216e-07  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1262  CDS  NC_009715  382786  383655  870  30S ribosomal protein S2  YP_001407659  unclonable  7.65471e-07  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1274    NC_009715  865587  868607  3021      unclonable  0.000243392  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1311  CDS  NC_009715  1913644  1914570  927  para-aminobenzoate synthase component I  YP_001409175  unclonable  4.82298e-07  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1312  CDS  NC_009715  1914761  1915411  651  superoxide dismutase (Fe)  YP_001409176  unclonable  1.8669e-07  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1321  CDS  NC_009715  305273  306814  1542  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  YP_001407593  unclonable  4.77414e-06  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1334  CDS  NC_009715  680966  681535  570  YceI  YP_001407955  unclonable  2.5527e-07  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1354  CDS  NC_009715  516868  517986  1119  trap-type mannitol/chloroaromatic compound transport system, periplasmic component  YP_001407794  unclonable  1.50608e-06  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1362  CDS  NC_009715  796144  797190  1047  L-asparaginase II  YP_001408080  unclonable  2.30453e-06  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1422  CDS  NC_009715  851559  852770  1212  threonine dehydratase  YP_001408134  unclonable  2.12424e-06  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1439  CDS  NC_009715  1519905  1521005  1101  flagellar motor switch protein FliM  YP_001408769  unclonable  9.09071e-07  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1480  CDS  NC_009715  119976  120896  921  permeases of the drug/metabolite transporter  YP_001407422  unclonable  1.01724e-06  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1549  CDS  NC_009715  181346  182716  1371  cytochrome c oxidase accessory protein CcoG  YP_001407479  unclonable  2.82303e-06  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1551  CDS  NC_009715  182729  183346  618  transcription regulator protein  YP_001407480  unclonable  2.00418e-07  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1645  CDS  NC_009715  352138  354459  2322  signal transduction protein  YP_001407632  unclonable  0.000104597  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1651  CDS  NC_009715  1642348  1642863  516  hypothetical protein  YP_001408892  unclonable  1.47979e-07  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1757  CDS  NC_009715  1540559  1542838  2280  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  YP_001408790  unclonable  4.42418e-05  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1758  CDS  NC_009715  1908701  1909453  753  hook assembly protein, flagella  YP_001409168  unclonable  3.45404e-07  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1776  CDS  NC_009715  183606  184745  1140  CmeA  YP_001407481  unclonable  1.25677e-06  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1787  CDS  NC_009715  1648103  1649008  906  LysR family transcriptional regulator  YP_001408897  unclonable  6.71509e-07  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1818  CDS  NC_009715  1187178  1188554  1377  sodium-dependent transporter  YP_001408448  unclonable  4.35894e-06  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1861  CDS  NC_009715  1143908  1145530  1623  sodium/hydrogen exchanger family protein  YP_001408404  unclonable  1.3758e-05  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1864    NC_009715  1003002  1004180  1179      unclonable  1.92115e-06  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1904  CDS  NC_009715  1040997  1043573  2577  chaperone ClpB 1  YP_001408297  unclonable  8.35524e-05  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1905  CDS  NC_009715  381043  381258  216  acetyltransferase  YP_001407657  unclonable  7.47904e-08  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1906  CDS  NC_009715  380314  381015  702  hypothetical protein  YP_001407656  unclonable  3.49044e-07  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_1941  CDS  NC_009715  1423089  1423631  543  SCO1/SenC family protein  YP_001408675  unclonable  2.40174e-07  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_2015  CDS  NC_009715  40089  40226  138  hypothetical protein  YP_001407342  unclonable  7.5578e-08  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_2086  CDS  NC_009715  1943670  1945667  1998  nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  YP_001409208  unclonable  2.85057e-05  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_2107  CDS  NC_009715  1929630  1932281  2652  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  YP_001409193  unclonable  0.000158508  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_2123  CDS  NC_009715  1915632  1916624  993  C4-dicarboxylate-binding periplasmic protein  YP_001409177  unclonable  7.73537e-07  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_2131  CDS  NC_009715  91452  91922  471  diamine acetyltransferase 2  YP_001407386  unclonable  2.87953e-07  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_2144    NC_009715  381331  382095  765      unclonable  4.22893e-07  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_2145  CDS  NC_009715  382134  382694  561  Sel1 repeat-containing protein  YP_001407658  unclonable  2.0662e-07  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_2147  CDS  NC_009715  511408  511875  468  ferric uptake regulation protein  YP_001407788  unclonable  1.54091e-07  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_2150  CDS  NC_009715  567315  567935  621  acetyltransferase  YP_001407840  unclonable  3.18542e-07  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_2152  CDS  NC_009715  666472  666735  264  hypothetical protein  YP_001407937  unclonable  6.43116e-08  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_2224  CDS  NC_009715  1538208  1539578  1371  peptidase M23B  YP_001408788  unclonable  2.68272e-06  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_2225  CDS  NC_009715  1539637  1540467  831  prephenate dehydrogenase  YP_001408789  unclonable  3.70984e-07  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_2236  CDS  NC_009715  1896649  1897029  381  30S ribosomal protein S10  YP_001409154  unclonable  1.96356e-07  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_2238  CDS  NC_009715  1909484  1909660  177  hypothetical protein  YP_001409169  unclonable  4.57534e-08  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_2239  CDS  NC_009715  1909613  1910386  774  flagellar hook protein FlgE  YP_001409170  unclonable  4.35982e-07  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
CCV52592_2240  CDS  NC_009715  1910521  1911357  837  hypothetical protein  YP_001409171  unclonable  4.49475e-07  n/a    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>