74 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CCC13826_0021  CDS  NC_009802  929815  930117  303  DNA-binding protein HU 1 (DNA-binding protein II; HB)  YP_001466788  unclonable  1.60012e-06  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0085  CDS  NC_009802  894874  896112  1239  hypothetical protein  YP_001466755  unclonable  5.95597e-05  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0148  CDS  NC_009802  866877  869129  2253  hypothetical protein  YP_001466728  unclonable  0.00101772  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0161  CDS  NC_009802  854003  854539  537  copper/zinc superoxide dismutase  YP_001466718  unclonable  9.19214e-06  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0166  CDS  NC_009802  656302  657501  1200  elongation factor Tu  YP_001466538  unclonable  4.96784e-05  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0345  CDS  NC_009802  1900868  1901962  1095  putative helix-turn-helix containsing protein  YP_001467722  unclonable  3.45136e-05  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0347  CDS  NC_009802  441902  442807  906  methionyl-tRNA formyltransferase  YP_001466335  unclonable  1.90251e-05  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0352  CDS  NC_009802  1897868  1898701  834  50S ribosomal protein L2  YP_001467717  unclonable  1.47687e-05  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0353  CDS  NC_009802  1898703  1898984  282  50S ribosomal protein L23  YP_001467718  unclonable  1.9966e-06  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0354  CDS  NC_009802  1898986  1899600  615  50S ribosomal protein L4  YP_001467719  unclonable  5.23614e-06  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0358  CDS  NC_009802  445044  445904  861  stage 0 sporulation protein J  YP_001466339  unclonable  1.94185e-05  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0551  CDS  NC_009802  1560922  1561710  789  30S ribosomal protein S2  YP_001467386  unclonable  1.23187e-05  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0575  CDS  NC_009802  1193646  1194161  516  cell division  YP_001467036  unclonable  3.95011e-06  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0605  CDS  NC_009802  1171184  1172527  1344  transcription termination factor Rho  YP_001467008  unclonable  7.83157e-05  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0622  CDS  NC_009795  19721  20677  957  hypothetical protein  YP_001456664  unclonable  5.39808e-06  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0641  CDS  NC_009802  769657  771102  1446  hypothetical protein  YP_001466634  unclonable  0.000139272  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0667  CDS  NC_009802  747668  749302  1635  chaperonin GroEL  YP_001466610  unclonable  0.000291491  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0669  CDS  NC_009802  744678  747221  2544  tryptophanyl-tRNA synthetase  YP_001466608  unclonable  0.00205718  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0709  CDS  NC_009802  853169  853936  768  hypothetical protein  YP_001466717  unclonable  1.70117e-05  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0747  CDS  NC_009802  289323  290534  1212  saccharopine dehydrogenase  YP_001466203  unclonable  4.18334e-05  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0828  CDS  NC_009802  368468  369175  708  biopolymer transport ExbD protein  YP_001466269  unclonable  9.66789e-06  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0829  CDS  NC_009802  594763  596148  1386  hypothetical protein  YP_001466478  unclonable  6.79241e-05  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0895  CDS  NC_009802  654604  655230  627  OmpA/MotB  YP_001466536  unclonable  8.73981e-06  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0912  CDS  NC_009802  446000  446422  423  F0F1 ATP synthase subunit B'  YP_001466340  unclonable  3.95011e-06  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0942  CDS  NC_009802  469370  471625  2256  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  YP_001466370  unclonable  0.000918625  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0943  CDS  NC_009802  471715  472545  831  prephenate dehydrogenase  YP_001466371  unclonable  1.80721e-05  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0963  CDS  NC_009802  390018  391079  1062  CjaC  YP_001466286  unclonable  2.47317e-05  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_1050  CDS  NC_009802  830867  832567  1701  prolyl-tRNA synthetase  YP_001466693  unclonable  0.000328969  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_1052    NC_009802  828701  829594  894      unclonable  1.50741e-05  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_1067  CDS  NC_009802  817823  819448  1626  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  YP_001466678  unclonable  0.000268693  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_1072  CDS  NC_009802  812864  815470  2607  preprotein translocase subunit SecA  YP_001466674  unclonable  0.0016593  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_1076  CDS  NC_009802  808355  810370  2016  DNA gyrase subunit A  YP_001466670  unclonable  0.000909041  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_1088  CDS  NC_009802  1035117  1037291  2175  monomeric isocitrate dehydrogenase  YP_001466882  unclonable  0.00133972  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_1133  CDS  NC_009802  93720  94499  780  putative CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  YP_001466023  unclonable  1.96227e-05  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_1200  CDS  NC_009802  937483  937692  210  hypothetical protein  YP_001466793  unclonable  1.34873e-06  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_1294  CDS  NC_009802  1032773  1033903  1131  2-oxoglutarate-acceptor oxidoreductase subunit OorA  YP_001466879  unclonable  7.29522e-05  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_1295  CDS  NC_009802  1033900  1034211  312  2-oxoglutarate-acceptor oxidoreductase subunit OorD  YP_001466880  unclonable  4.92894e-06  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_1296  CDS  NC_009802  472607  473977  1371  tyrosyl-tRNA synthetase  YP_001466372  unclonable  9.11619e-05  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_1297  CDS  NC_009802  474038  474922  885  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase  YP_001466373  unclonable  1.18303e-05  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_1351  CDS  NC_009802  896075  897751  1677  M41 family peptidase  YP_001466756  unclonable  0.000179169  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_1374  CDS  NC_009802  797927  799066  1140  cell division protein FtsZ  YP_001466659  unclonable  5.77452e-05  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_1453  CDS  NC_009802  1169935  1171020  1086  threonine synthase  YP_001467006  unclonable  2.19249e-05  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_1456    NC_009802  676731  677165  435      unclonable  6.03131e-06  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_1534  CDS  NC_009802  515884  516939  1056  lipopolysaccharide biosynthesis protein  YP_001466412  unclonable  3.74232e-05  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_1610  CDS  NC_009802  771229  773169  1941  hypothetical protein  YP_001466635  unclonable  0.00096761  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_1751  CDS  NC_009802  1886908  1887924  1017  DNA-directed RNA polymerase subunit alpha  YP_001467695  unclonable  1.82621e-05  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_1771  CDS  NC_009802  1896540  1897238  699  30S ribosomal protein S3  YP_001467714  unclonable  5.85037e-06  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_1772  CDS  NC_009802  69636  70877  1242  outer membrane protein transport protein (ompp1/fadl/todx)  YP_001466000  unclonable  6.72167e-05  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_1803  CDS  NC_009802  42087  43652  1566  FAD binding domain-containing protein  YP_001465970  unclonable  0.000300511  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_1897  CDS  NC_009802  2003914  2006016  2103  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  YP_001467813  unclonable  0.000617448  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_1910  CDS  NC_009802  1994096  1994740  645  enolase (2-phosphoglycerate dehydratase; 2-phospho-D-glycerate hydro-lyase)  YP_001467801  unclonable  2.89321e-06  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_1981  CDS  NC_009802  1334393  1336150  1758  aspartyl-tRNA synthetase  YP_001467181  unclonable  0.000379313  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_2018  CDS  NC_009802  1303756  1304955  1200  aspartate kinase  YP_001467151  unclonable  7.59653e-05  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_2023  CDS  NC_009802  1298591  1300534  1944  NAD-dependent DNA ligase LigA  YP_001467146  unclonable  0.000845936  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_2046  CDS  NC_009802  1278454  1280325  1872  molecular chaperone DnaK  YP_001467123  unclonable  0.000592664  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_2058  CDS  NC_009802  1268950  1269759  810  polyphosphate kinase 2 superfamily protein  YP_001467115  unclonable  1.17071e-05  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_2088  CDS  NC_009802  1776887  1777624  738  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_001467594  unclonable  9.86776e-06  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_2177  CDS  NC_009802  1690495  1692105  1611  glycosyl transferase, group 2 family protein  YP_001467510  unclonable  0.000219359  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_2189    NC_009802  1777812  1778942  1131      unclonable  4.49298e-05  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_2228  CDS  NC_009802  594210  594653  444  ribose 5-phosphate isomerase B  YP_001466477  unclonable  3.13562e-06  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_2229  CDS  NC_009802  655227  655475  249  flagellar biosynthesis protein  YP_001466537  unclonable  2.16389e-06  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_2230  tRNA  NC_009802  655734  655809  76  tRNA-Thr    unclonable  8.75758e-07  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_2231  tRNA  NC_009802  655862  655946  85  tRNA-Tyr    unclonable  8.93857e-07  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_2232  tRNA  NC_009802  655954  656030  77  tRNA-Gly    unclonable  9.40116e-07  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_2233  tRNA  NC_009802  656155  656229  75  tRNA-Thr    unclonable  1.02912e-06  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_2236    NC_009802  676201  676578  378      unclonable  3.90901e-06  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_2246    NC_009802  930241  930987  747      unclonable  6.40722e-06  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_2254  CDS  NC_009802  1034220  1035113  894  malate dehydrogenase  YP_001466881  unclonable  3.48768e-05  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_2265  CDS  NC_009802  1171003  1171128  126  hypothetical protein  YP_001467007  unclonable  8.40652e-07  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_2324  CDS  NC_009802  1897240  1897497  258  ribosomal protein L22  YP_001467715  unclonable  1.60012e-06  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_2325  CDS  NC_009802  1897584  1897865  282  30S ribosomal protein S19  YP_001467716  unclonable  1.50625e-06  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_2326  CDS  NC_009802  1899597  1900175  579  50S ribosomal protein L3  YP_001467720  unclonable  4.28305e-06  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_2327  CDS  NC_009802  1900196  1900534  339  30S ribosomal protein S10  YP_001467721  unclonable  1.87948e-06  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_2334  CDS  NC_009802  1993762  1993959  198  hypothetical protein  YP_001467800  unclonable  8.49488e-07  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>