96 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
SaurJH1_0025  CDS  NC_009632  34617  35873  +  1257  hypothetical protein  YP_001315180  unclonable  0.00000254674  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_0424  CDS  NC_009632  448726  449022  +  297  30S ribosomal protein S6  YP_001315573  unclonable  0.0000000892295  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_0425  CDS  NC_009632  449043  449546  +  504  single-strand binding protein  YP_001315574  unclonable  0.00000015552  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_0426  CDS  NC_009632  449598  449840  +  243  30S ribosomal protein S18  YP_001315575  unclonable  0.0000000528471  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_0427  CDS  NC_009632  450117  451091  -  975  Abi family protein  YP_001315576  unclonable  0.00000079529  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_0441  CDS  NC_009632  460461  461216  +  756  nitroreductase  YP_001315589  unclonable  0.000000237608  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_0442  CDS  NC_009632  461296  462684  -  1389  sodium:dicarboxylate symporter  YP_001315590  unclonable  0.00000381157  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_0443  CDS  NC_009632  463662  464618  -  957  hypothetical protein  YP_001315591  unclonable  0.000000697848  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_0493  CDS  NC_009632  513481  514821  +  1341  sodium:neurotransmitter symporter  YP_001315638  unclonable  0.00000262524  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_0496  CDS  NC_009632  517370  518398  +  1029  ABC transporter related  YP_001315641  unclonable  0.00000100343  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_0497  CDS  NC_009632  518402  519061  +  660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_001315642  unclonable  0.000000249965  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_0532  CDS  NC_009632  561622  561924  +  303  regulatory protein SpoVG  YP_001315677  unclonable  0.0000000987509  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_0543  CDS  NC_009632  573429  573830  +  402  hypothetical protein  YP_001315688  unclonable  0.000000100816  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_0576  CDS  NC_009632  618110  618610  +  501  50S ribosomal protein L10  YP_001315721  unclonable  0.000000179203  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_0583  CDS  NC_009632  628298  628768  +  471  30S ribosomal protein S7  YP_001315728  unclonable  0.0000000892295  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_0674  CDS  NC_009632  725473  726237  +  765  WecB/TagA/CpsF family glycosyl transferase  YP_001315818  unclonable  0.000000341766  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_0702  CDS  NC_009632  755382  755999  +  618  hypothetical protein  YP_001315846  unclonable  0.000000282132  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_0703  CDS  NC_009632  756015  757022  +  1008  phosphate transporter  YP_001315847  unclonable  0.00000147408  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_0832  CDS  NC_009632  897195  897881  +  687  micrococcal nuclease  YP_001315975  unclonable  0.000000140573  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_0962  CDS  NC_009632  988021  989337  +  1317  Na+ antiporter NhaC  YP_001316105  unclonable  0.00000234758  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_0963  CDS  NC_009632  989356  989730  +  375  hypothetical protein  YP_001316106  unclonable  0.0000000957659  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1002  CDS  NC_009632  1035116  1036360  +  1245  Beta-ketoacyl synthase  YP_001316145  unclonable  0.00000168291  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1035  CDS  NC_009632  1071504  1072988  +  1485  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--L- lysine ligase  YP_001316178  unclonable  0.0000109369  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1106  CDS  NC_009632  1127454  1128023  -  570  ComK family protein  YP_001316249  unclonable  0.0000000539334  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1113  CDS  NC_009632  1131853  1133817  +  1965  bacteriocin-associated integral membrane protein  YP_001316255  unclonable  0.0000492636  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1114  CDS  NC_009632  1133820  1134140  +  321  hypothetical protein  YP_001316256  unclonable  0.0000000782706  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1115  CDS  NC_009632  1134137  1134778  +  642  ABC transporter related  YP_001316257  unclonable  0.000000285067  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1116  CDS  NC_009632  1134866  1135156  -  291  hypothetical protein  YP_001316258  unclonable  0.0000000806822  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1117    NC_009632  1135231  1135434  +  204      unclonable  0.0000000473096  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1118  CDS  NC_009632  1135523  1135879  -  357  DoxX family protein  YP_001316259  unclonable  0.000000073687  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1119  CDS  NC_009632  1136367  1137326  +  960  periplasmic binding protein  YP_001316260  unclonable  0.000000565066  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1130  CDS  NC_009632  1146163  1147191  -  1029  glutamyl endopeptidase  YP_001316271  unclonable  0.00000101388  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1135  CDS  NC_009632  1150858  1154604  -  3747  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  YP_001316276  unclonable  0.00817868  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1178  CDS  NC_009632  1198774  1200180  +  1407  dihydrolipoamide dehydrogenase  YP_001316319  unclonable  0.00000305556  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1179  CDS  NC_009632  1200348  1200623  +  276  hypothetical protein  YP_001316320  unclonable  0.0000000468227  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1180  CDS  NC_009632  1200767  1201306  +  540  helix-turn-helix domain-containing protein  YP_001316321  unclonable  0.000000150819  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1181  CDS  NC_009632  1201319  1202413  +  1095  ABC transporter related  YP_001316322  unclonable  0.00000170044  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1187  CDS  NC_009632  1206965  1208317  -  1353  manganese transport protein MntH  YP_001316328  unclonable  0.00000302407  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1188  CDS  NC_009632  1208501  1209115  -  615  hypothetical protein  YP_001316329  unclonable  0.000000175594  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1207  CDS  NC_009632  1226880  1228019  -  1140  hypothetical protein  YP_001316348  unclonable  0.00000131866  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1208  CDS  NC_009632  1228146  1228703  +  558  hypothetical protein  YP_001316349  unclonable  0.000000132249  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1209  CDS  NC_009632  1228783  1228956  +  174  50S ribosomal protein L32  YP_001316350  unclonable  0.0000000286453  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1210  CDS  NC_009632  1229110  1231047  -  1938  cell wall anchor domain-containing protein  YP_001316351  unclonable  0.0000311928  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1211  CDS  NC_009632  1231250  1232302  -  1053  cell wall anchor domain-containing protein  YP_001316352  unclonable  0.00000134578  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1212  CDS  NC_009632  1232511  1233194  +  684  NEAr transporter  YP_001316353  unclonable  0.000000237608  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1269  CDS  NC_009632  1288789  1290201  +  1413  cell division protein FtsA  YP_001316410  unclonable  0.00000461742  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1270  CDS  NC_009632  1290234  1291406  +  1173  cell division protein FtsZ  YP_001316411  unclonable  0.00000230027  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1272  CDS  NC_009632  1292481  1293149  +  669  alanine racemase domain-containing protein  YP_001316413  unclonable  0.000000279227  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1273  CDS  NC_009632  1293146  1293709  +  564  hypothetical protein  YP_001316414  unclonable  0.000000107088  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1322  CDS  NC_009632  1348560  1348835  +  276  30S ribosomal protein S16  YP_001316462  unclonable  0.000000033965  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1323  CDS  NC_009632  1349023  1349526  +  504  16S rRNA-processing protein RimM  YP_001316463  unclonable  0.0000000721778  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1324  CDS  NC_009632  1349526  1350263  +  738  tRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  YP_001316464  unclonable  0.000000276351  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1341  CDS  NC_009632  1369653  1370420  +  768  30S ribosomal protein S2  YP_001316479  unclonable  0.000000466794  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1412  CDS  NC_009632  1445842  1446414  +  573  thermonuclease  YP_001316549  unclonable  0.000000099778  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1435  CDS  NC_009632  1467484  1470513  +  3030  putative exonuclease SbcC  YP_001316572  unclonable  0.00155429  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1436  CDS  NC_009632  1470584  1470946  -  363  large-conductance mechanosensitive channel  YP_001316573  unclonable  0.0000000693237  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1444  CDS  NC_009632  1480779  1483181  +  2403  DNA topoisomerase IV subunit A  YP_001316581  unclonable  0.000125144  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1445  CDS  NC_009632  1483431  1484891  +  1461  amino acid carrier protein  YP_001316582  unclonable  0.00000977985  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1449  CDS  NC_009632  1488066  1490588  +  2523  hypothetical protein  YP_001316586  unclonable  0.00038982  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1611  CDS  NC_009632  1685024  1686703  -  1680  DNA repair protein RecN  YP_001316746  unclonable  0.0000188364  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1615  CDS  NC_009632  1688685  1690022  -  1338  exodeoxyribonuclease VII large subunit  YP_001316750  unclonable  0.00000193789  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1653  CDS  NC_009632  1720035  1721141  -  1107  RNA polymerase sigma factor RpoD  YP_001316788  unclonable  0.00000164842  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1717  CDS  NC_009632  1782275  1782697  -  423  Rrf2 family transcriptional regulator  YP_001316850  unclonable  0.000000165253  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1720  CDS  NC_009632  1785451  1787217  -  1767  aspartyl-tRNA synthetase  YP_001316853  unclonable  0.0000219088  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1772  CDS  NC_009632  1835978  1836580  -  603  translation initiation factor IF-3  YP_001316903  unclonable  0.000000139127  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1808  CDS  NC_009632  1883011  1884705  -  1695  septation ring formation regulator EzrA  YP_001316939  unclonable  0.00000998467  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1809  CDS  NC_009632  1884842  1885306  +  465  GAF domain-containing protein  YP_001316940  unclonable  0.0000000874323  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1918  CDS  NC_009632  2005114  2005668  -  555  hypothetical protein  YP_001317039  unclonable  0.00000031538  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1935  CDS  NC_009632  2025146  2025610  -  465  helix-turn-helix domain-containing protein  YP_001317056  unclonable  0.0000000729285  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1936  CDS  NC_009632  2025966  2026589  -  624  response regulator receiver  YP_001317057  unclonable  0.000000150819  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1946  CDS  NC_009632  2035087  2036544  -  1458  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  YP_001317067  unclonable  0.00000538211  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_2089  CDS  NC_009632  2166270  2166713  -  444  hypothetical protein  YP_001317206  unclonable  0.0000000967619  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_2121  CDS  NC_009632  2196529  2198457  +  1929  ABC transporter related  YP_001317237  unclonable  0.0000290627  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_2156  CDS  NC_009632  2242124  2243644  -  1521  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  YP_001317272  unclonable  0.00000532471  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_2173  CDS  NC_009632  2258852  2259292  -  441  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  YP_001317289  unclonable  0.000000210444  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_2311  CDS  NC_009632  2403682  2404116  -  435  50S ribosomal protein L16  YP_001317423  unclonable  0.0000000620596  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_2312  CDS  NC_009632  2404119  2404772  -  654  30S ribosomal protein S3  YP_001317424  unclonable  0.000000168649  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_2313  CDS  NC_009632  2404796  2405149  -  354  50S ribosomal protein L22  YP_001317425  unclonable  0.0000000419164  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_2314  CDS  NC_009632  2405178  2405456  -  279  30S ribosomal protein S19  YP_001317426  unclonable  0.0000000275126  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_2315  CDS  NC_009632  2405523  2406356  -  834  50S ribosomal protein L2  YP_001317427  unclonable  0.000000290927  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_2316  CDS  NC_009632  2406389  2406664  -  276  50S ribosomal protein L23  YP_001317428  unclonable  0.0000000264247  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_2317  CDS  NC_009632  2406664  2407287  -  624  50S ribosomal protein L4  YP_001317429  unclonable  0.000000134967  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_2318  CDS  NC_009632  2407314  2407976  -  663  50S ribosomal protein L3  YP_001317430  unclonable  0.000000223614  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_2319  CDS  NC_009632  2408004  2408312  -  309  30S ribosomal protein S10  YP_001317431  unclonable  0.0000000523033  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_2320  CDS  NC_009632  2408669  2409058  +  390  hypothetical protein  YP_001317432  unclonable  0.0000000679275  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_2321  CDS  NC_009632  2409249  2410583  -  1335  xanthine/uracil/vitamin C permease  YP_001317433  unclonable  0.00000388996  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_2383  CDS  NC_009632  2471416  2472795  -  1380  amino acid permease-associated region  YP_001317495  unclonable  0.00000244601  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_2449  CDS  NC_009632  2534969  2536411  -  1443  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  YP_001317561  unclonable  0.00000521739  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_2450  CDS  NC_009632  2536594  2536977  +  384  hypothetical protein  YP_001317562  unclonable  0.000000111535  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_2477  CDS  NC_009632  2564584  2565051  -  468  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  YP_001317588  unclonable  0.000000109289  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_2526  CDS  NC_009632  2615769  2617406  +  1638  amino acid permease-associated region  YP_001317637  unclonable  0.0000127161  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_2532  CDS  NC_009632  2623822  2624088  -  267  addiction module antitoxin  YP_001317643  unclonable  0.0000000423523  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_2538  CDS  NC_009632  2628210  2629403  -  1194  major facilitator transporter  YP_001317649  unclonable  0.00000106699  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_R0010  tRNA  NC_009632  585057  585132  +  76  tRNA-Thr    unclonable  0.0000000231874  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_R0011  tRNA  NC_009632  585139  585211  +  73  tRNA-Lys    unclonable  0.0000000213973  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_R0012  tRNA  NC_009632  585245  585319  +  75  tRNA-Gly    unclonable  0.000000023664  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>