96 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
SaurJH1_0025  CDS  NC_009632  34617  35873  1257  hypothetical protein  YP_001315180  unclonable  2.54674e-06  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_0424  CDS  NC_009632  448726  449022  297  30S ribosomal protein S6  YP_001315573  unclonable  8.92295e-08  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_0425  CDS  NC_009632  449043  449546  504  single-strand binding protein  YP_001315574  unclonable  1.5552e-07  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_0426  CDS  NC_009632  449598  449840  243  30S ribosomal protein S18  YP_001315575  unclonable  5.28471e-08  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_0427  CDS  NC_009632  450117  451091  975  Abi family protein  YP_001315576  unclonable  7.9529e-07  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_0441  CDS  NC_009632  460461  461216  756  nitroreductase  YP_001315589  unclonable  2.37608e-07  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_0442  CDS  NC_009632  461296  462684  1389  sodium:dicarboxylate symporter  YP_001315590  unclonable  3.81157e-06  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_0443  CDS  NC_009632  463662  464618  957  hypothetical protein  YP_001315591  unclonable  6.97848e-07  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_0493  CDS  NC_009632  513481  514821  1341  sodium:neurotransmitter symporter  YP_001315638  unclonable  2.62524e-06  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_0496  CDS  NC_009632  517370  518398  1029  ABC transporter related  YP_001315641  unclonable  1.00343e-06  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_0497  CDS  NC_009632  518402  519061  660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_001315642  unclonable  2.49965e-07  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_0532  CDS  NC_009632  561622  561924  303  regulatory protein SpoVG  YP_001315677  unclonable  9.87509e-08  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_0543  CDS  NC_009632  573429  573830  402  hypothetical protein  YP_001315688  unclonable  1.00816e-07  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_0576  CDS  NC_009632  618110  618610  501  50S ribosomal protein L10  YP_001315721  unclonable  1.79203e-07  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_0583  CDS  NC_009632  628298  628768  471  30S ribosomal protein S7  YP_001315728  unclonable  8.92295e-08  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_0674  CDS  NC_009632  725473  726237  765  WecB/TagA/CpsF family glycosyl transferase  YP_001315818  unclonable  3.41766e-07  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_0702  CDS  NC_009632  755382  755999  618  hypothetical protein  YP_001315846  unclonable  2.82132e-07  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_0703  CDS  NC_009632  756015  757022  1008  phosphate transporter  YP_001315847  unclonable  1.47408e-06  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_0832  CDS  NC_009632  897195  897881  687  micrococcal nuclease  YP_001315975  unclonable  1.40573e-07  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_0962  CDS  NC_009632  988021  989337  1317  Na+ antiporter NhaC  YP_001316105  unclonable  2.34758e-06  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_0963  CDS  NC_009632  989356  989730  375  hypothetical protein  YP_001316106  unclonable  9.57659e-08  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1002  CDS  NC_009632  1035116  1036360  1245  Beta-ketoacyl synthase  YP_001316145  unclonable  1.68291e-06  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1035  CDS  NC_009632  1071504  1072988  1485  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--L- lysine ligase  YP_001316178  unclonable  1.09369e-05  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1106  CDS  NC_009632  1127454  1128023  570  ComK family protein  YP_001316249  unclonable  5.39334e-08  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1113  CDS  NC_009632  1131853  1133817  1965  bacteriocin-associated integral membrane protein  YP_001316255  unclonable  4.92636e-05  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1114  CDS  NC_009632  1133820  1134140  321  hypothetical protein  YP_001316256  unclonable  7.82706e-08  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1115  CDS  NC_009632  1134137  1134778  642  ABC transporter related  YP_001316257  unclonable  2.85067e-07  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1116  CDS  NC_009632  1134866  1135156  291  hypothetical protein  YP_001316258  unclonable  8.06822e-08  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1117    NC_009632  1135231  1135434  204      unclonable  4.73096e-08  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1118  CDS  NC_009632  1135523  1135879  357  DoxX family protein  YP_001316259  unclonable  7.3687e-08  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1119  CDS  NC_009632  1136367  1137326  960  periplasmic binding protein  YP_001316260  unclonable  5.65066e-07  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1130  CDS  NC_009632  1146163  1147191  1029  glutamyl endopeptidase  YP_001316271  unclonable  1.01388e-06  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1135  CDS  NC_009632  1150858  1154604  3747  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  YP_001316276  unclonable  0.00817868  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1178  CDS  NC_009632  1198774  1200180  1407  dihydrolipoamide dehydrogenase  YP_001316319  unclonable  3.05556e-06  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1179  CDS  NC_009632  1200348  1200623  276  hypothetical protein  YP_001316320  unclonable  4.68227e-08  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1180  CDS  NC_009632  1200767  1201306  540  helix-turn-helix domain-containing protein  YP_001316321  unclonable  1.50819e-07  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1181  CDS  NC_009632  1201319  1202413  1095  ABC transporter related  YP_001316322  unclonable  1.70044e-06  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1187  CDS  NC_009632  1206965  1208317  1353  manganese transport protein MntH  YP_001316328  unclonable  3.02407e-06  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1188  CDS  NC_009632  1208501  1209115  615  hypothetical protein  YP_001316329  unclonable  1.75594e-07  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1207  CDS  NC_009632  1226880  1228019  1140  hypothetical protein  YP_001316348  unclonable  1.31866e-06  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1208  CDS  NC_009632  1228146  1228703  558  hypothetical protein  YP_001316349  unclonable  1.32249e-07  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1209  CDS  NC_009632  1228783  1228956  174  50S ribosomal protein L32  YP_001316350  unclonable  2.86453e-08  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1210  CDS  NC_009632  1229110  1231047  1938  cell wall anchor domain-containing protein  YP_001316351  unclonable  3.11928e-05  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1211  CDS  NC_009632  1231250  1232302  1053  cell wall anchor domain-containing protein  YP_001316352  unclonable  1.34578e-06  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1212  CDS  NC_009632  1232511  1233194  684  NEAr transporter  YP_001316353  unclonable  2.37608e-07  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1269  CDS  NC_009632  1288789  1290201  1413  cell division protein FtsA  YP_001316410  unclonable  4.61742e-06  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1270  CDS  NC_009632  1290234  1291406  1173  cell division protein FtsZ  YP_001316411  unclonable  2.30027e-06  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1272  CDS  NC_009632  1292481  1293149  669  alanine racemase domain-containing protein  YP_001316413  unclonable  2.79227e-07  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1273  CDS  NC_009632  1293146  1293709  564  hypothetical protein  YP_001316414  unclonable  1.07088e-07  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1322  CDS  NC_009632  1348560  1348835  276  30S ribosomal protein S16  YP_001316462  unclonable  3.3965e-08  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1323  CDS  NC_009632  1349023  1349526  504  16S rRNA-processing protein RimM  YP_001316463  unclonable  7.21778e-08  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1324  CDS  NC_009632  1349526  1350263  738  tRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  YP_001316464  unclonable  2.76351e-07  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1341  CDS  NC_009632  1369653  1370420  768  30S ribosomal protein S2  YP_001316479  unclonable  4.66794e-07  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1412  CDS  NC_009632  1445842  1446414  573  thermonuclease  YP_001316549  unclonable  9.9778e-08  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1435  CDS  NC_009632  1467484  1470513  3030  putative exonuclease SbcC  YP_001316572  unclonable  0.00155429  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1436  CDS  NC_009632  1470584  1470946  363  large-conductance mechanosensitive channel  YP_001316573  unclonable  6.93237e-08  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1444  CDS  NC_009632  1480779  1483181  2403  DNA topoisomerase IV subunit A  YP_001316581  unclonable  0.000125144  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1445  CDS  NC_009632  1483431  1484891  1461  amino acid carrier protein  YP_001316582  unclonable  9.77985e-06  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1449  CDS  NC_009632  1488066  1490588  2523  hypothetical protein  YP_001316586  unclonable  0.00038982  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1611  CDS  NC_009632  1685024  1686703  1680  DNA repair protein RecN  YP_001316746  unclonable  1.88364e-05  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1615  CDS  NC_009632  1688685  1690022  1338  exodeoxyribonuclease VII large subunit  YP_001316750  unclonable  1.93789e-06  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1653  CDS  NC_009632  1720035  1721141  1107  RNA polymerase sigma factor RpoD  YP_001316788  unclonable  1.64842e-06  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1717  CDS  NC_009632  1782275  1782697  423  Rrf2 family transcriptional regulator  YP_001316850  unclonable  1.65253e-07  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1720  CDS  NC_009632  1785451  1787217  1767  aspartyl-tRNA synthetase  YP_001316853  unclonable  2.19088e-05  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1772  CDS  NC_009632  1835978  1836580  603  translation initiation factor IF-3  YP_001316903  unclonable  1.39127e-07  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1808  CDS  NC_009632  1883011  1884705  1695  septation ring formation regulator EzrA  YP_001316939  unclonable  9.98467e-06  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1809  CDS  NC_009632  1884842  1885306  465  GAF domain-containing protein  YP_001316940  unclonable  8.74323e-08  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1918  CDS  NC_009632  2005114  2005668  555  hypothetical protein  YP_001317039  unclonable  3.1538e-07  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1935  CDS  NC_009632  2025146  2025610  465  helix-turn-helix domain-containing protein  YP_001317056  unclonable  7.29285e-08  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1936  CDS  NC_009632  2025966  2026589  624  response regulator receiver  YP_001317057  unclonable  1.50819e-07  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_1946  CDS  NC_009632  2035087  2036544  1458  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  YP_001317067  unclonable  5.38211e-06  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_2089  CDS  NC_009632  2166270  2166713  444  hypothetical protein  YP_001317206  unclonable  9.67619e-08  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_2121  CDS  NC_009632  2196529  2198457  1929  ABC transporter related  YP_001317237  unclonable  2.90627e-05  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_2156  CDS  NC_009632  2242124  2243644  1521  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  YP_001317272  unclonable  5.32471e-06  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_2173  CDS  NC_009632  2258852  2259292  441  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  YP_001317289  unclonable  2.10444e-07  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_2311  CDS  NC_009632  2403682  2404116  435  50S ribosomal protein L16  YP_001317423  unclonable  6.20596e-08  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_2312  CDS  NC_009632  2404119  2404772  654  30S ribosomal protein S3  YP_001317424  unclonable  1.68649e-07  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_2313  CDS  NC_009632  2404796  2405149  354  50S ribosomal protein L22  YP_001317425  unclonable  4.19164e-08  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_2314  CDS  NC_009632  2405178  2405456  279  30S ribosomal protein S19  YP_001317426  unclonable  2.75126e-08  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_2315  CDS  NC_009632  2405523  2406356  834  50S ribosomal protein L2  YP_001317427  unclonable  2.90927e-07  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_2316  CDS  NC_009632  2406389  2406664  276  50S ribosomal protein L23  YP_001317428  unclonable  2.64247e-08  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_2317  CDS  NC_009632  2406664  2407287  624  50S ribosomal protein L4  YP_001317429  unclonable  1.34967e-07  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_2318  CDS  NC_009632  2407314  2407976  663  50S ribosomal protein L3  YP_001317430  unclonable  2.23614e-07  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_2319  CDS  NC_009632  2408004  2408312  309  30S ribosomal protein S10  YP_001317431  unclonable  5.23033e-08  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_2320  CDS  NC_009632  2408669  2409058  390  hypothetical protein  YP_001317432  unclonable  6.79275e-08  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_2321  CDS  NC_009632  2409249  2410583  1335  xanthine/uracil/vitamin C permease  YP_001317433  unclonable  3.88996e-06  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_2383  CDS  NC_009632  2471416  2472795  1380  amino acid permease-associated region  YP_001317495  unclonable  2.44601e-06  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_2449  CDS  NC_009632  2534969  2536411  1443  PTS system, sucrose-specific IIBC subunit  YP_001317561  unclonable  5.21739e-06  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_2450  CDS  NC_009632  2536594  2536977  384  hypothetical protein  YP_001317562  unclonable  1.11535e-07  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_2477  CDS  NC_009632  2564584  2565051  468  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  YP_001317588  unclonable  1.09289e-07  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_2526  CDS  NC_009632  2615769  2617406  1638  amino acid permease-associated region  YP_001317637  unclonable  1.27161e-05  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_2532  CDS  NC_009632  2623822  2624088  267  addiction module antitoxin  YP_001317643  unclonable  4.23523e-08  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_2538  CDS  NC_009632  2628210  2629403  1194  major facilitator transporter  YP_001317649  unclonable  1.06699e-06  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_R0010  tRNA  NC_009632  585057  585132  76  tRNA-Thr    unclonable  2.31874e-08  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_R0011  tRNA  NC_009632  585139  585211  73  tRNA-Lys    unclonable  2.13973e-08  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH1_R0012  tRNA  NC_009632  585245  585319  75  tRNA-Gly    unclonable  2.3664e-08  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>