194 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Cphy_0020  CDS  NC_010001  33777  34718  942  RelA/SpoT domain-containing protein  YP_001557150  unclonable  1.13301e-09  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0109  CDS  NC_010001  146427  146708  282  SpoVG family protein  YP_001557237  unclonable  3.63253e-11  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0110  CDS  NC_010001  147354  148388  1035  polysaccharide deacetylase  YP_001557238  unclonable  1.82672e-09  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0120  CDS  NC_010001  161160  161375  216  heavy metal transport/detoxification protein  YP_001557248  unclonable  3.78265e-11  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0192  CDS  NC_010001  238298  240091  1794  ABC transporter related  YP_001557318  unclonable  2.0543e-07  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0222  CDS  NC_010001  273457  275457  2001  UvrD/REP helicase  YP_001557348  unclonable  4.5018e-07  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0223  CDS  NC_010001  275696  276031  336  hypothetical protein  YP_001557349  unclonable  6.12373e-11  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0226  CDS  NC_010001  280345  282126  1782  hypothetical protein  YP_001557352  unclonable  9.30043e-08  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0235  CDS  NC_010001  291402  291824  423  30S ribosomal protein S12  YP_001557361  unclonable  3.97858e-11  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0251  CDS  NC_010001  310038  310751  714  acyl-ACP thioesterase  YP_001557377  unclonable  5.81314e-10  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0277  CDS  NC_010001  345854  346531  678  hypothetical protein  YP_001557403  unclonable  4.65928e-10  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0282  CDS  NC_010001  350094  351305  1212  hypothetical protein  YP_001557408  unclonable  7.83437e-09  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0283  CDS  NC_010001  351565  352659  1095  hypothetical protein  YP_001557409  unclonable  2.35038e-09  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0325  CDS  NC_010001  404694  406298  1605  CTP synthetase  YP_001557451  unclonable  7.36967e-08  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0326  CDS  NC_010001  406898  408943  2046  ATP-dependent metalloprotease FtsH  YP_001557452  unclonable  4.32409e-07  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0369  CDS  NC_010001  470342  470923  582  RdgB/HAM1 family non-canonical purine NTP pyrophosphatase  YP_001557495  unclonable  2.351e-10  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0370  CDS  NC_010001  470940  471434  495  phosphodiesterase  YP_001557496  unclonable  1.32589e-10  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0414  CDS  NC_010001  525835  526911  1077  peptide chain release factor 1  YP_001557540  unclonable  4.01474e-09  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0415  CDS  NC_010001  527112  528479  1368  H(+)-transporting two-sector ATPase  YP_001557541  unclonable  1.97091e-08  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0428  CDS  NC_010001  542541  544196  1656  hypothetical protein  YP_001557554  unclonable  4.96305e-08  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0429  CDS  NC_010001  544531  545874  1344  uracil-xanthine permease  YP_001557555  unclonable  1.36785e-08  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0442  CDS  NC_010001  562582  564438  1857  ABC transporter related  YP_001557568  unclonable  2.93437e-07  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0443  CDS  NC_010001  564450  566216  1767  ABC transporter related  YP_001557569  unclonable  2.01252e-07  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0444  CDS  NC_010001  566471  567052  582  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_001557570  unclonable  5.10063e-10  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0498  CDS  NC_010001  638612  641344  2733  glycosyl transferase family protein  YP_001557624  unclonable  1.57387e-05  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0624  CDS  NC_010001  810523  812793  2271  endo-1,4-beta-xylanase  YP_001557750  unclonable  2.71039e-06  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0644  CDS  NC_010001  837749  837949  201  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  YP_001557770  unclonable  2.53244e-11  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0651  CDS  NC_010001  848249  850870  2622  pyruvate phosphate dikinase  YP_001557777  unclonable  9.14255e-06  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0664  CDS  NC_010001  866795  867769  975  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_001557790  unclonable  1.61767e-09  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0665  CDS  NC_010001  867787  868674  888  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_001557791  unclonable  1.36095e-09  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0715  CDS  NC_010001  926840  927283  444  hypothetical protein  YP_001557841  unclonable  1.63777e-10  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0730  CDS  NC_010001  944280  945086  807  AraC family transcriptional regulator  YP_001557856  unclonable  3.85534e-09  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0812  CDS  NC_010001  1038064  1040445  2382  extracellular solute-binding protein  YP_001557938  unclonable  3.78939e-06  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0908  CDS  NC_010001  1161112  1161885  774  hypothetical protein  YP_001558032  unclonable  1.00336e-09  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0972  CDS  NC_010001  1240295  1240876  582  endopeptidase Clp  YP_001558093  unclonable  2.65141e-10  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_0998  CDS  NC_010001  1262609  1263250  642  hypothetical protein  YP_001558117  unclonable  7.63425e-10  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1003  CDS  NC_010001  1267185  1268915  1731  FMN-binding domain-containing protein  YP_001558122  unclonable  1.26222e-07  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1029  CDS  NC_010001  1301846  1303036  1191  iron-containing alcohol dehydrogenase  YP_001558148  unclonable  7.15077e-09  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1057  CDS  NC_010001  1331318  1332256  939  ABC transporter related  YP_001558176  unclonable  8.53274e-10  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1064  CDS  NC_010001  1343506  1344645  1140  metallophosphoesterase  YP_001558183  unclonable  5.89961e-09  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1065  CDS  NC_010001  1344844  1345083  240  hypothetical protein  YP_001558184  unclonable  4.35652e-11  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1066  CDS  NC_010001  1345519  1347243  1725  Na+/H+ antiporter NhaC  YP_001558185  unclonable  1.04071e-07  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1067  CDS  NC_010001  1348080  1349441  1362  MATE efflux family protein  YP_001558186  unclonable  1.54468e-08  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1172  CDS  NC_010001  1486134  1487822  1689  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_001558289  unclonable  2.3446e-07  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1252  CDS  NC_010001  1581246  1582583  1338  MATE efflux family protein  YP_001558369  unclonable  1.31388e-08  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1256  CDS  NC_010001  1586394  1587647  1254  hypothetical protein  YP_001558373  unclonable  9.02575e-09  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1269  CDS  NC_010001  1599234  1600040  807  hypothetical protein  YP_001558386  unclonable  9.63526e-10  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1274  CDS  NC_010001  1602923  1604707  1785  arginyl-tRNA synthetase  YP_001558391  unclonable  1.44018e-07  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1291  CDS  NC_010001  1620273  1620806  534  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_001558408  unclonable  2.84437e-10  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1318  CDS  NC_010001  1649861  1651192  1332  MATE efflux family protein  YP_001558434  unclonable  1.01978e-08  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1328  CDS  NC_010001  1660204  1660731  528  hypothetical protein  YP_001558444  unclonable  4.16974e-10  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1338  CDS  NC_010001  1672882  1673334  453  NUDIX hydrolase  YP_001558454  unclonable  6.50565e-11  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1396  CDS  NC_010001  1739448  1740800  1353  sodium:dicarboxylate symporter  YP_001558510  unclonable  2.20299e-08  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1447  CDS  NC_010001  1787325  1788239  915  hypothetical protein  YP_001558560  unclonable  1.41757e-09  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1455  CDS  NC_010001  1795903  1797531  1629  hypothetical protein  YP_001558568  unclonable  9.88618e-08  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1461  CDS  NC_010001  1802168  1803382  1215  sodium:dicarboxylate symporter  YP_001558574  unclonable  6.02347e-09  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1498  CDS  NC_010001  1844555  1845838  1284  xanthine/uracil/vitamin C permease  YP_001558611  unclonable  5.60897e-09  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1546  CDS  NC_010001  1898594  1899421  828  AraC family transcriptional regulator  YP_001558659  unclonable  8.27637e-10  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1562  CDS  NC_010001  1919275  1920270  996  hypothetical protein  YP_001558675  unclonable  1.88332e-09  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1593  CDS  NC_010001  1963131  1964513  1383  MATE efflux family protein  YP_001558706  unclonable  1.99125e-08  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1594  CDS  NC_010001  1964825  1965385  561  hypothetical protein  YP_001558707  unclonable  2.25825e-10  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1595  CDS  NC_010001  1965566  1966474  909  hypothetical protein  YP_001558708  unclonable  1.26668e-09  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1596  CDS  NC_010001  1966899  1969457  2559  glycoside hydrolase family 3 protein  YP_001558709  unclonable  4.79393e-06  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1614  CDS  NC_010001  1991341  1991967  627  glycosyl transferase family protein  YP_001558727  unclonable  2.84437e-10  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1730  CDS  NC_010001  2131517  2133430  1914  NADH dehydrogenase (quinone)  YP_001558841  unclonable  4.0262e-07  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1782  CDS  NC_010001  2196182  2197801  1620  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  YP_001558891  unclonable  6.59316e-08  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1783  CDS  NC_010001  2197991  2198899  909  MarR family transcriptional regulator  YP_001558892  unclonable  1.34706e-09  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1799  CDS  NC_010001  2214443  2216098  1656  glycoside hydrolase family protein  YP_001558907  unclonable  7.60023e-08  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1815  CDS  NC_010001  2241716  2244034  2319  leucine-rich repeat-containing protein  YP_001558923  unclonable  1.80506e-06  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1816  CDS  NC_010001  2244708  2246063  1356  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter  YP_001558924  unclonable  1.87232e-08  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1871  CDS  NC_010001  2300628  2301188  561  metallophosphoesterase  YP_001558979  unclonable  1.70547e-10  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1872  CDS  NC_010001  2301347  2302306  960  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)-like protein  YP_001558980  unclonable  1.52191e-09  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1873  CDS  NC_010001  2302530  2305805  3276  carbohydrate-binding family 6 protein  YP_001558981  unclonable  0.00027012  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1879  CDS  NC_010001  2315244  2316557  1314  extracellular solute-binding protein  YP_001558987  unclonable  1.46819e-08  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1907  CDS  NC_010001  2350016  2351425  1410  major facilitator transporter  YP_001559015  unclonable  1.93036e-08  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1914  CDS  NC_010001  2361132  2362028  897  hypothetical protein  YP_001559022  unclonable  1.38915e-09  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1915  CDS  NC_010001  2362169  2364496  2328  AraC family transcriptional regulator  YP_001559023  unclonable  4.15573e-06  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_1976  CDS  NC_010001  2438851  2440587  1737  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_001559083  unclonable  1.51566e-07  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_2003  CDS  NC_010001  2471732  2472706  975  NLP/P60 protein  YP_001559110  unclonable  1.14468e-09  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_2048  CDS  NC_010001  2528018  2528731  714  hypothetical protein  YP_001559155  unclonable  5.87304e-10  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_2055  CDS  NC_010001  2537233  2538369  1137  lipoprotein  YP_001559162  unclonable  3.85534e-09  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_2080  CDS  NC_010001  2566265  2567089  825  cell wall hydrolase/autolysin  YP_001559187  unclonable  8.02973e-10  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_2148  CDS  NC_010001  2657890  2659413  1524  DNA-repair protein  YP_001559253  unclonable  2.93029e-08  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_2208  CDS  NC_010001  2722427  2723719  1293  hypothetical protein  YP_001559313  unclonable  5.12489e-09  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_2227  CDS  NC_010001  2747288  2748205  918  hypothetical protein  YP_001559331  unclonable  1.84555e-09  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_2228  CDS  NC_010001  2748356  2749678  1323  transcriptional regulator  YP_001559332  unclonable  1.16408e-08  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_2258  CDS  NC_010001  2781202  2783832  2631  cell wall hydrolase/autolysin  YP_001559360  unclonable  1.47959e-05  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_2285  CDS  NC_010001  2818734  2819411  678  orotate phosphoribosyltransferase  YP_001559385  unclonable  5.47323e-10  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_2286  CDS  NC_010001  2819471  2820373  903  dihydroorotate dehydrogenase 1B  YP_001559386  unclonable  1.60117e-09  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_2309  CDS  NC_010001  2845275  2846276  1002  ribosomal protein L11 methyltransferase  YP_001559409  unclonable  2.81824e-09  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_2310  CDS  NC_010001  2846373  2847518  1146  chaperone protein DnaJ  YP_001559410  unclonable  6.02347e-09  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_2318  CDS  NC_010001  2858396  2858659  264  30S ribosomal protein S20  YP_001559418  unclonable  4.31209e-11  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_2352  CDS  NC_010001  2904477  2905811  1335  aspartate kinase  YP_001559452  unclonable  4.53597e-09  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_2408  CDS  NC_010001  2962791  2963036  246  30S ribosomal protein S16  YP_001559508  unclonable  3.82163e-11  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_2437  CDS  NC_010001  2990661  2992094  1434  propionyl-CoA carboxylase  YP_001559537  unclonable  5.06601e-08  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_2438  CDS  NC_010001  2992459  2993100  642  regulatory protein RecX  YP_001559538  unclonable  9.8324e-10  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_2439  CDS  NC_010001  2993104  2994147  1044  recA protein  YP_001559539  unclonable  5.66681e-09  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_2440  CDS  NC_010001  2994740  2994916  177  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  YP_001559540  unclonable  8.02988e-11  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_2441  CDS  NC_010001  2995013  2996233  1221  threonine dehydratase  YP_001559541  unclonable  1.48333e-08  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Cphy_2442  CDS  NC_010001  2996412  2997344  933  signal recognition particle-docking protein FtsY  YP_001559542  unclonable  1.26668e-09  n/a    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>