13 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Ping_0139  CDS  NC_008709  182140  184401  2262  glycoside hydrolase family 3 protein  YP_941609  unclonable  8.55243e-05  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0530  CDS  NC_008709  676697  678910  2214  (p)ppGpp synthetase I and guanosine-3',5'-bis pyrophosphate 3'-pyrophosphohydrolase  YP_941983  unclonable  5.5023e-05  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0545  CDS  NC_008709  696206  697843  1638  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  YP_941998  unclonable  6.83285e-06  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0762  CDS  NC_008709  958537  959712  1176  hypothetical protein  YP_942209  unclonable  7.52788e-07  normal  0.804932  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_1960  CDS  NC_008709  2383691  2384998  1308  hypothetical protein  YP_943328  unclonable  1.19339e-06  normal  0.362131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_3013  CDS  NC_008709  3712394  3714064  1671  30S ribosomal protein S1  YP_944314  unclonable  3.48916e-06  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_3169  CDS  NC_008709  3901384  3903105  1722  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  YP_944456  unclonable  1.22164e-05  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_3259  CDS  NC_008709  4021687  4022976  1290  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  YP_944545  unclonable  1.30647e-06  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_3381  CDS  NC_008709  4176925  4178001  1077  recombination protein RecA  YP_944666  unclonable  3.85109e-07  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_3437  CDS  NC_008709  4249454  4250638  1185  elongation factor Tu  YP_944720  unclonable  1.12361e-06  hitchhiker  0.000128836  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_3438  CDS  NC_008709  4250713  4252806  2094  translation elongation factor G  YP_944721  unclonable  1.52425e-05  hitchhiker  0.000196406  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_3504  CDS  NC_008709  4332705  4334033  1329  preprotein translocase, SecY subunit  YP_944786  hitchhiker  0.00370905  unclonable  6.64102e-09  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_3523  CDS  NC_008709  4341548  4342153  606  50S ribosomal protein L4  YP_944805  unclonable  8.76425e-08  hitchhiker  7.26358e-06  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>