15 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Pput_0074  CDS  NC_009512  80465  81250  786  phospholipid/glycerol acyltransferase  YP_001265433  unclonable  1.85774e-11  normal  0.109161  Pseudomonas putida F1  Bacteria 
 
 
-
 
Pput_0178  CDS  NC_009512  183347  184567  1221  Formyl-CoA transferase  YP_001265537  unclonable  7.10796e-11  normal  0.705206  Pseudomonas putida F1  Bacteria 
 
 
-
 
Pput_0335  CDS  NC_009512  382083  382910  828  hypothetical protein  YP_001265692  unclonable  3.59835e-11  normal  0.780933  Pseudomonas putida F1  Bacteria 
 
 
-
 
Pput_0384  CDS  NC_009512  446377  447264  888  transporter DMT superfamily protein  YP_001265741  unclonable  6.82799e-11  normal  Pseudomonas putida F1  Bacteria 
 
 
-
 
Pput_0469  CDS  NC_009512  538063  539262  1200  tyrosyl-tRNA synthetase  YP_001265823  unclonable  1.69724e-10  decreased coverage  0.000126716  Pseudomonas putida F1  Bacteria 
 
 
-
 
Pput_0632  CDS  NC_009512  709827  710513  687  short chain dehydrogenase  YP_001265984  unclonable  1.59867e-11  normal  Pseudomonas putida F1  Bacteria 
 
 
-
 
Pput_0633  CDS  NC_009512  710882  711466  585  hypothetical protein  YP_001265985  unclonable  1.02941e-11  normal  Pseudomonas putida F1  Bacteria 
 
 
-
 
Pput_0682  CDS  NC_009512  766285  767151  867  hypothetical protein  YP_001266031  unclonable  2.15879e-11  normal  0.0246998  Pseudomonas putida F1  Bacteria 
 
 
-
 
Pput_1900  CDS  NC_009512  2176490  2177395  906  LysR family transcriptional regulator  YP_001267232  unclonable  6.62496e-11  normal  Pseudomonas putida F1  Bacteria 
 
 
-
 
Pput_1992  CDS  NC_009512  2256105  2256419  315  hypothetical protein  YP_001267316  unclonable  2.39023e-12  decreased coverage  8.82432e-06  Pseudomonas putida F1  Bacteria 
 
 
-
 
Pput_3214  CDS  NC_009512  3626571  3627377  807  HNH endonuclease  YP_001268524  unclonable  2.45895e-11  normal  0.0194211  Pseudomonas putida F1  Bacteria 
 
 
-
 
Pput_3448  CDS  NC_009512  3852964  3853215  252  outer membrane lipoprotein OprI  YP_001268758  unclonable  8.11412e-13  hitchhiker  1.87275e-05  Pseudomonas putida F1  Bacteria 
 
 
-
 
Pput_4357  CDS  NC_009512  4875889  4876266  378  hypothetical protein  YP_001269664  unclonable  1.35149e-12  normal  0.0272701  Pseudomonas putida F1  Bacteria 
 
 
-
 
Pput_4639  CDS  NC_009512  5204199  5205152  954  histone deacetylase superfamily protein  YP_001269943  unclonable  3.15852e-11  hitchhiker  0.00689363  Pseudomonas putida F1  Bacteria 
 
 
-
 
Pput_4740  CDS  NC_009512  5307172  5307936  765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001270044  unclonable  2.61149e-11  unclonable  5.03217e-10  Pseudomonas putida F1  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>