31 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Maqu_0001  CDS  NC_008740  466  1929  1464  chromosomal replication initiation protein  YP_957296  unclonable  1.89853e-05  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0002  CDS  NC_008740  1990  3093  1104  DNA polymerase III, beta subunit  YP_957297  unclonable  3.48538e-06  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0559  CDS  NC_008740  634382  636478  2097  ATP-dependent DNA helicase RecQ  YP_957847  unclonable  0.000154535  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0611  CDS  NC_008740  700231  702867  2637  regulatory protein, LuxR  YP_957899  unclonable  0.000972895  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0697  CDS  NC_008740  797075  798277  1203  tyrosyl-tRNA synthetase  YP_957982  unclonable  2.50226e-06  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0717  CDS  NC_008740  829164  830360  1197  elongation factor Tu  YP_958001  unclonable  3.89336e-06  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0773  CDS  NC_008740  875018  876019  1002  outer membrane protein (porin)  YP_958057  unclonable  1.36886e-06  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0887  CDS  NC_008740  1009097  1009717  621  ferric reductase domain-containing protein  YP_958170  unclonable  5.12451e-07  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_1092  CDS  NC_008740  1242801  1243814  1014  extracellular solute-binding protein  YP_958371  unclonable  2.21625e-06  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_1530  CDS  NC_008740  1708927  1709988  1062  putative periplasmic protease  YP_958801  unclonable  2.85162e-06  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_1578  CDS  NC_008740  1765597  1766445  849  hypothetical protein  YP_958849  unclonable  6.45416e-07  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_1613  CDS  NC_008740  1806139  1808052  1914  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  YP_958884  unclonable  4.10993e-05  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_1697  CDS  NC_008740  1902668  1903444  777  tetratricopeptide domain-containing protein  YP_958968  unclonable  5.38849e-07  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_1707  CDS  NC_008740  1910545  1912344  1800  aspartyl-tRNA synthetase  YP_958978  unclonable  4.68378e-05  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_1730  CDS  NC_008740  1933872  1935746  1875  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_959001  unclonable  6.65124e-05  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_1731  CDS  NC_008740  1936060  1936269  210  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  YP_959002  unclonable  9.15529e-08  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_2192  CDS  NC_008740  2453284  2455461  2178  TonB-dependent siderophore receptor  YP_959458  unclonable  0.000215305  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_2415  CDS  NC_008740  2699860  2700210  351  iojap-like protein  YP_959677  unclonable  5.27491e-08  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_2444  CDS  NC_008740  2729335  2730291  957  peptidase M23B  YP_959706  unclonable  1.08635e-06  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_2483  CDS  NC_008740  2773336  2773647  312  hypothetical protein  YP_959745  unclonable  1.52567e-07  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_2637  CDS  NC_008740  2967023  2968513  1491  hypothetical protein  YP_959899  unclonable  1.08196e-05  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_2695  CDS  NC_008740  3020555  3022402  1848  hypothetical protein  YP_959957  unclonable  5.66517e-05  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_2728  CDS  NC_008740  3051817  3052860  1044  rod shape-determining protein MreB  YP_959990  unclonable  9.92624e-07  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_2750  CDS  NC_008740  3077679  3079478  1800  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  YP_960012  unclonable  8.4613e-05  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_2921  CDS  NC_008740  3263942  3264529  588  hypothetical protein  YP_960182  unclonable  4.07066e-07  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_2932  CDS  NC_008740  3272384  3272875  492  hypothetical protein  YP_960193  unclonable  2.32307e-07  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_2975  CDS  NC_008740  3306568  3307128  561  hypothetical protein  YP_960236  unclonable  1.70346e-07  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_R0006  rRNA  NC_008740  798762  800294  1533  16S ribosomal RNA    unclonable  1.47722e-05  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_R0016  rRNA  NC_008740  1010143  1011675  1533  16S ribosomal RNA    unclonable  2.72502e-05  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_R0038  tRNA  NC_008740  1902479  1902554  76  tRNA-Lys    unclonable  3.29533e-08  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_R0059  rRNA  NC_008740  2768183  2769715  1533  16S ribosomal RNA    unclonable  1.14912e-05  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>