96 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
VC0395_0060  CDS  NC_009456  62289  63581  1293  hypothetical protein  YP_001214901  unclonable  5.86289e-16  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0076  CDS  NC_009456  84068  85426  1359  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  YP_001214917  unclonable  1.13664e-15  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0077  CDS  NC_009456  85472  85621  150  hypothetical protein  YP_001214918  unclonable  1.20506e-18  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0078  CDS  NC_009456  85846  86205  360  major outer membrane lipoprotein  YP_001214919  unclonable  5.73899e-18  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0098  CDS  NC_009456  107415  108632  1218  serine/threonine transporter SstT  YP_001214939  unclonable  1.49121e-15  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0472  CDS  NC_009456  527971  528516  546  putative cytochrome b561  YP_001215313  unclonable  2.73245e-17  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0473  CDS  NC_009456  528513  529082  570  hypothetical protein  YP_001215314  unclonable  1.81293e-17  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0596  CDS  NC_009456  646954  647391  438  hypothetical protein  YP_001215435  unclonable  4.33635e-18  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0960  CDS  NC_009456  936117  937286  1170  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  YP_001215796  unclonable  1.23224e-15  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0994  CDS  NC_009456  968671  969864  1194  acetate kinase  YP_001215830  unclonable  9.48202e-16  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_1127  CDS  NC_009456  1090984  1092315  1332  putative oxidoreductase  YP_001215963  unclonable  1.64888e-15  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_1138  CDS  NC_009456  1107492  1107839  348  hypothetical protein  YP_001215974  unclonable  3.5141e-18  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0048  CDS  NC_009457  45735  45905  171  hypothetical protein  YP_001216021  unclonable  4.65006e-16  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0049  CDS  NC_009457  45948  46967  1020  putative DNA-binding/iron metalloprotein/AP endonuclease  YP_001216022  unclonable  4.62165e-14  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0103  CDS  NC_009457  93840  94268  429  50S ribosomal protein L13  YP_001216068  unclonable  1.23224e-15  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0134  CDS  NC_009457  127428  127808  381  hypothetical protein  YP_001216099  unclonable  1.19552e-15  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0135  CDS  NC_009457  127959  128324  366  nitrogen regulatory protein P-II  YP_001216100  unclonable  1.14835e-15  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0136  CDS  NC_009457  128340  129575  1236  putative ammonium transporter  YP_001216101  unclonable  1.07717e-13  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0165  CDS  NC_009457  168161  168790  630  23S rRNA methyltransferase J  YP_001216130  unclonable  1.13387e-14  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0166  CDS  NC_009457  168891  170846  1956  cell division protein FtsH  YP_001216131  unclonable  7.21667e-12  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0211  CDS  NC_009457  216316  216576  261  30S ribosomal protein S20  YP_001216174  unclonable  1.12504e-15  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0438  CDS  NC_009457  464791  465849  1059  hypothetical protein  YP_001216389  unclonable  4.66929e-14  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0486  CDS  NC_009457  519866  520375  510  PTS system glucose-specific transporter subunit  YP_001216437  unclonable  1.75128e-15  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0489  CDS  NC_009457  522894  523862  969  cysteine synthase A  YP_001216440  unclonable  3.38281e-14  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0527  CDS  NC_009457  568156  568887  732  ribonuclease T  YP_001216478  unclonable  1.01499e-14  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0578  CDS  NC_009457  618438  619499  1062  putative periplasmic protease  YP_001216528  unclonable  4.8636e-14  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0635  CDS  NC_009457  676895  677758  864  heat shock protein HtpX  YP_001216585  unclonable  2.79457e-14  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0727  CDS  NC_009457  753693  754958  1266  hypothetical protein  YP_001216677  unclonable  1.50296e-13  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0735  CDS  NC_009457  762728  764503  1776  aspartyl-tRNA synthetase  YP_001216685  unclonable  3.82007e-12  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0820  CDS  NC_009457  832601  833812  1212  putative trypsin  YP_001216770  unclonable  8.98339e-14  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0821  CDS  NC_009457  833887  834612  726  hypothetical protein  YP_001216771  unclonable  4.58892e-15  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0836  tRNA  NC_009457  852384  852457  74  tRNA-Cys    unclonable  3.20631e-16  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0837  tRNA  NC_009457  852460  852535  76  tRNA-Gly    unclonable  2.9888e-16  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0838  tRNA  NC_009457  852600  852686  87  tRNA-Leu    unclonable  3.30479e-16  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0839  tRNA  NC_009457  852697  852772  76  tRNA-Gly    unclonable  2.75762e-16  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0971  CDS  NC_009457  1005503  1006174  672  hypothetical protein  YP_001216917  unclonable  5.02235e-15  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A1036  CDS  NC_009457  1081457  1082557  1101  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  YP_001216982  unclonable  3.59474e-14  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A1254  CDS  NC_009457  1327307  1328953  1647  putative trypsin  YP_001217198  unclonable  7.70222e-13  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A1428  CDS  NC_009457  1529673  1530191  519  peptidoglycan-associated lipoprotein  YP_001217371  unclonable  1.58382e-15  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A1429  CDS  NC_009457  1530223  1531575  1353  translocation protein TolB  YP_001217372  unclonable  1.34537e-13  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A1431  CDS  NC_009457  1532678  1533118  441  tolR membrane protein  YP_001217374  unclonable  2.87088e-16  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A1432  CDS  NC_009457  1533121  1533804  684  tolQ protein  YP_001217375  unclonable  1.36252e-15  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A1433  CDS  NC_009457  1533937  1534092  156  short chain acyl-CoA thioesterase YbgC  YP_001217376  unclonable  6.78998e-17  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A1435  CDS  NC_009457  1535953  1537578  1626  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  YP_001217378  unclonable  2.98443e-13  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A1451  CDS  NC_009457  1553368  1554174  807  exonuclease III  YP_001217394  unclonable  1.70984e-14  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A1452  CDS  NC_009457  1554233  1554910  678  amino acid ABC transporter, permease protein  YP_001217395  unclonable  6.8563e-15  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A1505  CDS  NC_009457  1616916  1618586  1671  30S ribosomal protein S1  YP_001217448  unclonable  5.98437e-13  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A1506  CDS  NC_009457  1618695  1619384  690  cytidylate kinase  YP_001217449  unclonable  2.36579e-15  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A1507  CDS  NC_009457  1619555  1619866  312  hypothetical protein  YP_001217450  unclonable  5.24688e-16  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A1508  CDS  NC_009457  1620001  1621860  1860  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase D  YP_001217451  unclonable  2.93924e-12  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A1569  CDS  NC_009457  1688963  1690108  1146  ribonuclease D  YP_001217510  unclonable  5.4851e-14  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A1585  CDS  NC_009457  1705064  1705210  147  hypothetical protein  YP_001217526  unclonable  4.37816e-16  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A1586  CDS  NC_009457  1705358  1706353  996  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  YP_001217527  unclonable  4.76485e-14  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A1606  CDS  NC_009457  1727200  1727532  333  acyl carrier protein  YP_001217547  unclonable  8.57537e-16  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A1632  CDS  NC_009457  1756282  1756866  585  superoxide dismutase, Fe  YP_001217571  unclonable  4.40787e-15  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A1682  CDS  NC_009457  1811001  1811534  534  replication initiation regulator SeqA  YP_001217621  unclonable  7.81212e-15  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A1685  CDS  NC_009457  1812766  1813293  528  flavodoxin FldA  YP_001217624  unclonable  6.71882e-15  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A1690  CDS  NC_009457  1816366  1816818  453  ferric uptake regulator  YP_001217629  unclonable  2.86155e-15  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A1692  CDS  NC_009457  1817897  1819060  1164  erythronate-4-phosphate dehydrogenase  YP_001217631  unclonable  1.0344e-13  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A1693  CDS  NC_009457  1819246  1820457  1212  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase I  YP_001217632  unclonable  1.93384e-13  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A1760  CDS  NC_009457  1880783  1881727  945  ribose-phosphate pyrophosphokinase  YP_001217699  unclonable  2.90937e-14  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A1761  CDS  NC_009457  1881896  1882486  591  peptidyl-tRNA hydrolase  YP_001217700  unclonable  3.19671e-15  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A1762  CDS  NC_009457  1882497  1883588  1092  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  YP_001217701  unclonable  6.06508e-14  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A1847  CDS  NC_009457  1965386  1966156  771  undecaprenyl diphosphate synthase  YP_001217771  unclonable  9.2739e-15  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A1848  CDS  NC_009457  1966230  1966787  558  ribosome recycling factor  YP_001217772  unclonable  2.01497e-15  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A1921  CDS  NC_009457  2048626  2050713  2088  elongation factor G  YP_001217845  unclonable  4.1036e-12  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A1974  CDS  NC_009457  2117265  2118182  918  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase  YP_001217898  unclonable  2.17475e-14  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A1975  CDS  NC_009457  2118280  2119476  1197  cell division protein FtsZ  YP_001217899  unclonable  8.04348e-14  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A2012  CDS  NC_009457  2162875  2163501  627  MutT/nudix family protein  YP_001217936  unclonable  5.17661e-15  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A2013  CDS  NC_009457  2163733  2165049  1317  outer membrane channel protein  YP_001217937  unclonable  1.58125e-13  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A2077  CDS  NC_009457  2234628  2234747  120  hypothetical protein  YP_001217994  unclonable  5.52007e-16  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A2078  CDS  NC_009457  2235096  2236349  1254  hypothetical protein  YP_001217995  unclonable  1.17952e-13  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A2144  CDS  NC_009457  2302681  2302797  117  hypothetical protein  YP_001218060  unclonable  4.89093e-16  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A2162  CDS  NC_009457  2312289  2312828  540  50S ribosomal protein L5  YP_001218078  unclonable  3.13261e-15  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A2163  CDS  NC_009457  2312853  2313170  318  50S ribosomal protein L24  YP_001218079  unclonable  9.19947e-16  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A2164  CDS  NC_009457  2313183  2313554  372  50S ribosomal protein L14  YP_001218080  unclonable  1.08066e-15  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A2182  CDS  NC_009457  2327799  2328398  600  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, FKBP-type  YP_001218098  unclonable  5.38925e-15  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A2264  CDS  NC_009457  2413678  2414364  687  transcriptional regulator CpxR  YP_001218180  unclonable  5.667e-15  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A2415  CDS  NC_009457  2568644  2569411  768  hypothetical protein  YP_001218315  unclonable  2.5534e-14  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A2506  CDS  NC_009457  2659354  2660454  1101  DNA polymerase III subunit beta  YP_001218399  unclonable  1.26636e-13  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A2557  tRNA  NC_009457  2707858  2707934  77  tRNA-Arg    unclonable  1.55794e-16  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A2580  CDS  NC_009457  2732835  2734991  2157  iron(III) compound receptor  YP_001218459  unclonable  1.13666e-11  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A2596  CDS  NC_009457  2749857  2751551  1695  methyl-accepting chemotaxis protein  YP_001218475  unclonable  5.7467e-13  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A2597  CDS  NC_009457  2751663  2752337  675  DNA repair protein RadC  YP_001218476  unclonable  3.67988e-15  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A2598  CDS  NC_009457  2752495  2752629  135  hypothetical protein  YP_001218477  unclonable  2.08312e-16  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A2599  CDS  NC_009457  2752632  2752868  237  50S ribosomal protein L28  YP_001218478  unclonable  3.88112e-16  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A2600  CDS  NC_009457  2752882  2753049  168  50S ribosomal protein L33  YP_001218479  unclonable  2.19047e-16  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A2750  tRNA  NC_009457  2904896  2904972  77  tRNA-Met    unclonable  3.88112e-16  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A2751  tRNA  NC_009457  2905015  2905091  77  tRNA-Met    unclonable  4.74519e-16  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A2752  CDS  NC_009457  2905177  2905314  138  hypothetical protein  YP_001218610  unclonable  5.46376e-16  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A2773  CDS  NC_009457  2921627  2923723  2097  elongation factor G  YP_001218631  unclonable  8.56998e-12  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A2798  CDS  NC_009457  2943682  2943801  120  hypothetical protein  YP_001218656  unclonable  5.30095e-16  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A2834  CDS  NC_009457  2984240  2985283  1044  rod shape-determining protein MreB  YP_001218684  unclonable  1.9673e-14  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A2870  tRNA  NC_009457  3020872  3020947  76  tRNA-Phe    unclonable  1.65469e-16  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A2874  tRNA  NC_009457  3023444  3023519  76  tRNA-Thr    unclonable  3.51003e-16  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A2875  tRNA  NC_009457  3023568  3023643  76  tRNA-Phe    unclonable  3.76547e-16  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>