21 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Cag_0058  CDS  NC_007514  67141  68448  1308  cell division protein FtsA  YP_378380  unclonable  2.30037e-10  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0059  CDS  NC_007514  68500  69783  1284  cell division protein FtsZ  YP_378381  unclonable  2.25371e-10  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0142  CDS  NC_007514  157165  159627  2463  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  YP_378463  unclonable  9.79597e-07  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0528  CDS  NC_007514  616283  617131  849  endonuclease IV  YP_378844  unclonable  8.58771e-12  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0610  CDS  NC_007514  712553  713212  660  hypothetical protein  YP_378926  unclonable  6.53405e-13  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0829  CDS  NC_007514  1156774  1157103  330  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  YP_379138  unclonable  2.23685e-13  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0830  CDS  NC_007514  1157100  1157312  213  hypothetical protein  YP_379139  unclonable  1.19075e-13  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0932  CDS  NC_007514  1266950  1268767  1818  aspartyl-tRNA synthetase  YP_379238  unclonable  1.07292e-08  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_1054  CDS  NC_007514  1429504  1431234  1731  activation/secretion signal peptide protein  YP_379359  unclonable  2.17377e-09  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_1056  CDS  NC_007514  1436182  1437912  1731  hemolysin activation/secretion protein-like  YP_379361  unclonable  5.36803e-09  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_1149  CDS  NC_007514  1544112  1544648  537  hypothetical protein  YP_379454  unclonable  3.92175e-13  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_1196  CDS  NC_007514  1589213  1592392  3180  adenine specific DNA methyltransferase  YP_379501  unclonable  9.65363e-05  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_1199  CDS  NC_007514  1594402  1595328  927  hypothetical protein  YP_379504  unclonable  5.3087e-12  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_1306  CDS  NC_007514  1772444  1774087  1644  chaperonin GroEL  YP_379609  unclonable  2.55221e-09  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_1325  CDS  NC_007514  1791751  1792152  402  nucleic acid binding protein  YP_379628  unclonable  3.54508e-13  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_1326  CDS  NC_007514  1792412  1792825  414  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  YP_379629  unclonable  3.88083e-13  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_1327  CDS  NC_007514  1792836  1794650  1815  ATPase  YP_379630  unclonable  1.55487e-08  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_1488  CDS  NC_007514  1959092  1959373  282  hypothetical protein  YP_379787  unclonable  9.64732e-14  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_1698  CDS  NC_007514  2205726  2206361  636  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  YP_379992  unclonable  1.4556e-12  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_1796  CDS  NC_007514  2316188  2319331  3144  ankyrin  YP_380090  unclonable  6.002e-05  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_1930  CDS  NC_007514  2462737  2462961  225  ferrous iron transport protein A  YP_380221  unclonable  5.34516e-14  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>