16 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Bamb_4120  CDS  NC_008391  1041944  1042435  492  hypothetical protein  YP_776007  unclonable  0.000000000109013  hitchhiker  0.0081168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_4350  CDS  NC_008391  1277797  1278123  327  hypothetical protein  YP_776236  normal  unclonable  0.00000333846  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_4351  CDS  NC_008391  1278139  1279320  1182  cytochrome P450-like protein  YP_776237  normal  unclonable  0.00000524199  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_4352  CDS  NC_008391  1279485  1279748  264  hypothetical protein  YP_776238  normal  unclonable  0.00000403824  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_4353  CDS  NC_008391  1280081  1280941  861  PEP phosphonomutase  YP_776239  normal  unclonable  0.00000493526  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_4354  CDS  NC_008391  1281342  1282202  861  RpiR family transcriptional regulator  YP_776240  normal  0.339513  unclonable  0.00000424592  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_4355  CDS  NC_008391  1282258  1282611  354  hypothetical protein  YP_776241  normal  0.0513241  unclonable  0.00000351015  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_4356  CDS  NC_008391  1282837  1283499  663  two component transcriptional regulator  YP_776242  hitchhiker  0.00111042  unclonable  0.00000437588  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_4357  CDS  NC_008391  1283496  1284872  1377  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  YP_776243  hitchhiker  0.0000114485  unclonable  0.00000640449  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_4358  CDS  NC_008391  1285083  1285529  447  MarR family transcriptional regulator  YP_776244  hitchhiker  0.000000202613  unclonable  0.00000493526  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_4359  CDS  NC_008391  1285568  1285936  369  antibiotic biosynthesis monooxygenase  YP_776245  decreased coverage  0.0000000189574  unclonable  0.00000450981  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_4360  CDS  NC_008391  1286725  1287618  894  Beta-lactamase  YP_776246  hitchhiker  0.0000108699  unclonable  0.00000562292  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_4434  CDS  NC_008391  1370047  1371603  1557  hypothetical protein  YP_776319  unclonable  0.0000000330507  unclonable  0.0000165626  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_4655  CDS  NC_008391  1637826  1638377  552  HD phosphohydrolase-like protein  YP_776539  unclonable  0.000000000224094  normal  0.0225387  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_4656  CDS  NC_008391  1638382  1639836  1455  aldehyde dehydrogenase  YP_776540  unclonable  0.0000000188591  normal  0.0270817  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_R0084  rRNA  NC_008391  1635784  1637309  1526  16S ribosomal RNA    unclonable  0.0000000608912  normal  0.0264011  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>